Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S9DZD5

Protein Details
Accession A0A1S9DZD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-298DKNINFKRNPTTPRKRRRRMIPNLKRGPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-294NPTTPRKRRRRMIPNLKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 15, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MKRYRDSQRTSPPHTQPTIEDNDVPKLSSLDAPVSPPRKRSTTKATHSSNALSNLNSPEQQTEAASNKERLNLAAIEAGQVEVTDHLSIFSSRLSQSARPAVSQSPRLQIPDWVSLYQRNQSPEGRHFVIHQHDHPVAGPHYDLRLQFSDSSSVSWSIMYGLPGNPNSRRLNRNATETRNHLIETASPRTGSMIIWDTGEYEILPYQPEQTQPETDDSRSDLSSDTSISTVDSKPDSAKLHQAFQNRKIRLRLHGTKLPQNYTIILRLDKNINFKRNPTTPRKRRRRMIPNLKRGPSTSTSDSSPPPSKSDSTGTPAPGVSDQTPSASETPGGEHSDEEDDIDEQIRANNAYPGAVNSIGSVHQRRWFVTLDRVNSGFVAEAGSGPGRKRWVRKWDPGTGQLLGFEPFYVRGPEVESSVVTGRLGRDVLEDEGVEGFVPRRGWRAVLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.67
3 0.6
4 0.58
5 0.57
6 0.5
7 0.46
8 0.4
9 0.44
10 0.41
11 0.38
12 0.31
13 0.25
14 0.24
15 0.21
16 0.21
17 0.18
18 0.19
19 0.22
20 0.3
21 0.36
22 0.38
23 0.41
24 0.44
25 0.48
26 0.52
27 0.56
28 0.59
29 0.62
30 0.68
31 0.72
32 0.73
33 0.69
34 0.68
35 0.64
36 0.58
37 0.52
38 0.45
39 0.36
40 0.33
41 0.33
42 0.32
43 0.29
44 0.26
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.19
49 0.2
50 0.21
51 0.25
52 0.27
53 0.3
54 0.3
55 0.33
56 0.32
57 0.29
58 0.28
59 0.24
60 0.21
61 0.2
62 0.18
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.06
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.1
79 0.1
80 0.13
81 0.16
82 0.17
83 0.23
84 0.29
85 0.3
86 0.28
87 0.3
88 0.33
89 0.35
90 0.4
91 0.37
92 0.35
93 0.36
94 0.38
95 0.36
96 0.35
97 0.34
98 0.34
99 0.33
100 0.29
101 0.28
102 0.31
103 0.33
104 0.33
105 0.32
106 0.28
107 0.3
108 0.33
109 0.37
110 0.38
111 0.41
112 0.38
113 0.35
114 0.34
115 0.36
116 0.39
117 0.37
118 0.34
119 0.32
120 0.31
121 0.31
122 0.3
123 0.28
124 0.21
125 0.18
126 0.16
127 0.12
128 0.13
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.2
137 0.17
138 0.18
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.12
150 0.14
151 0.17
152 0.17
153 0.23
154 0.27
155 0.31
156 0.34
157 0.36
158 0.44
159 0.43
160 0.51
161 0.52
162 0.52
163 0.5
164 0.5
165 0.47
166 0.39
167 0.36
168 0.27
169 0.21
170 0.2
171 0.21
172 0.21
173 0.2
174 0.19
175 0.18
176 0.19
177 0.19
178 0.15
179 0.12
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.07
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.07
194 0.08
195 0.1
196 0.12
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.19
201 0.19
202 0.19
203 0.18
204 0.16
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.1
209 0.09
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.22
226 0.22
227 0.26
228 0.29
229 0.36
230 0.37
231 0.44
232 0.52
233 0.46
234 0.48
235 0.49
236 0.48
237 0.47
238 0.52
239 0.5
240 0.48
241 0.51
242 0.51
243 0.52
244 0.54
245 0.5
246 0.42
247 0.35
248 0.3
249 0.26
250 0.26
251 0.21
252 0.19
253 0.17
254 0.18
255 0.21
256 0.22
257 0.3
258 0.32
259 0.37
260 0.37
261 0.39
262 0.44
263 0.47
264 0.52
265 0.54
266 0.59
267 0.64
268 0.73
269 0.82
270 0.84
271 0.86
272 0.89
273 0.89
274 0.9
275 0.91
276 0.9
277 0.9
278 0.9
279 0.84
280 0.75
281 0.65
282 0.59
283 0.51
284 0.46
285 0.39
286 0.32
287 0.31
288 0.32
289 0.33
290 0.33
291 0.35
292 0.3
293 0.29
294 0.3
295 0.29
296 0.3
297 0.32
298 0.29
299 0.29
300 0.31
301 0.29
302 0.27
303 0.26
304 0.24
305 0.21
306 0.2
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.13
315 0.13
316 0.11
317 0.13
318 0.15
319 0.16
320 0.14
321 0.13
322 0.14
323 0.16
324 0.15
325 0.13
326 0.12
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.09
331 0.07
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.16
348 0.18
349 0.18
350 0.23
351 0.25
352 0.26
353 0.28
354 0.3
355 0.29
356 0.36
357 0.4
358 0.38
359 0.41
360 0.4
361 0.38
362 0.34
363 0.31
364 0.21
365 0.14
366 0.12
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.1
371 0.11
372 0.12
373 0.15
374 0.21
375 0.27
376 0.35
377 0.43
378 0.52
379 0.6
380 0.7
381 0.74
382 0.77
383 0.78
384 0.76
385 0.71
386 0.62
387 0.53
388 0.43
389 0.37
390 0.28
391 0.21
392 0.15
393 0.12
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.13
398 0.12
399 0.16
400 0.17
401 0.18
402 0.18
403 0.16
404 0.16
405 0.17
406 0.17
407 0.14
408 0.15
409 0.14
410 0.16
411 0.16
412 0.13
413 0.14
414 0.16
415 0.18
416 0.18
417 0.17
418 0.15
419 0.15
420 0.14
421 0.12
422 0.1
423 0.09
424 0.11
425 0.13
426 0.14
427 0.18
428 0.19