Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S9DW78

Protein Details
Accession A0A1S9DW78    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
542-565YEEISENRRKRRRLDNSRDPSPVPHydrophilic
652-677NLGYRSPILTRRKRIQPEPKQEEESSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
Amino Acid Sequences MSSSSLYEPEEDDEASDSDIETGNTQFTEPPSSPPSHRTRLSSPPKLDGRSSSRPAQTPRRVSRMQMLEHLQMLLSKESVEAYSDLLAQTTDDHMSVESKPGSGEYLPTQAGIVSWAPKEKEIFFNVLDRKGKDGIREIAGAIGTKSELEVQEYLRLLHMRLEWQHREETHSRAIVLGDVPAAEEVSSECCDFLDEYSKLLVLKEQQDEDVAGRQRHHDLWIIDRDKAELVEELESQDQKSQPDSSIYHTASLLNIPRWIRLSERLFMNFGGARLEDNWTNIAYAGEAPAITADALAEFYTLTVSVTRRLIQSTLFFAMSRLRNMRDTGNSKAKVVKPRDVRTALDVLKMKRDGFDYWTGVARRCCLDVSDSRHRKGWKAVRLSHDEVEDMLSNRVPIDAESNRSTSRQMAQGNTDGENTDGDEDNASDSGSESDPKRSPSPSALLSPEISSDEDEIPSDAENQHAELEDQKASCLGELELWKALDRPAPAFLVSIKDENQEKKTRKPMGARKTQEELTDWRERTLYRSDWEEYGHEVYDIYEEISENRRKRRRLDNSRDPSPVPADDENNQADGYKVEPTAGEYDEDINPGADDHKDIEMDDATAPDQNTTIPQDEEDPEMNNTRITQTTNPKTNQKQTNESDSSSPTNTNLGYRSPILTRRKRIQPEPKQEEESSSSSSDDDLPATREYPSSEQDDGDGMPLYSQPMSPANWPSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.14
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.12
13 0.13
14 0.14
15 0.21
16 0.2
17 0.25
18 0.29
19 0.33
20 0.36
21 0.42
22 0.48
23 0.5
24 0.53
25 0.54
26 0.55
27 0.62
28 0.69
29 0.71
30 0.66
31 0.67
32 0.7
33 0.67
34 0.64
35 0.61
36 0.59
37 0.59
38 0.6
39 0.59
40 0.58
41 0.6
42 0.65
43 0.68
44 0.69
45 0.71
46 0.73
47 0.74
48 0.7
49 0.68
50 0.69
51 0.66
52 0.59
53 0.56
54 0.53
55 0.47
56 0.45
57 0.42
58 0.32
59 0.26
60 0.25
61 0.19
62 0.14
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.12
83 0.12
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.16
90 0.14
91 0.17
92 0.14
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.17
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.11
102 0.13
103 0.17
104 0.17
105 0.2
106 0.22
107 0.23
108 0.27
109 0.27
110 0.3
111 0.27
112 0.34
113 0.35
114 0.4
115 0.41
116 0.37
117 0.37
118 0.39
119 0.39
120 0.35
121 0.38
122 0.35
123 0.33
124 0.33
125 0.29
126 0.26
127 0.25
128 0.21
129 0.15
130 0.11
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.16
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.24
149 0.32
150 0.33
151 0.36
152 0.4
153 0.36
154 0.42
155 0.41
156 0.4
157 0.38
158 0.35
159 0.32
160 0.28
161 0.28
162 0.22
163 0.19
164 0.14
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.07
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.13
190 0.18
191 0.2
192 0.21
193 0.2
194 0.21
195 0.22
196 0.21
197 0.22
198 0.22
199 0.2
200 0.2
201 0.22
202 0.25
203 0.25
204 0.26
205 0.25
206 0.21
207 0.26
208 0.34
209 0.34
210 0.32
211 0.31
212 0.3
213 0.26
214 0.24
215 0.19
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.19
231 0.2
232 0.21
233 0.27
234 0.27
235 0.25
236 0.24
237 0.23
238 0.2
239 0.21
240 0.19
241 0.12
242 0.16
243 0.15
244 0.16
245 0.18
246 0.18
247 0.18
248 0.24
249 0.26
250 0.27
251 0.29
252 0.3
253 0.29
254 0.28
255 0.27
256 0.2
257 0.17
258 0.14
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.05
291 0.06
292 0.08
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.12
305 0.17
306 0.17
307 0.19
308 0.18
309 0.18
310 0.2
311 0.21
312 0.24
313 0.25
314 0.27
315 0.31
316 0.37
317 0.36
318 0.35
319 0.4
320 0.41
321 0.43
322 0.44
323 0.45
324 0.44
325 0.48
326 0.54
327 0.51
328 0.47
329 0.41
330 0.43
331 0.36
332 0.32
333 0.32
334 0.25
335 0.27
336 0.27
337 0.24
338 0.19
339 0.21
340 0.17
341 0.17
342 0.21
343 0.18
344 0.17
345 0.21
346 0.21
347 0.21
348 0.21
349 0.18
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.11
354 0.14
355 0.16
356 0.24
357 0.33
358 0.37
359 0.38
360 0.42
361 0.42
362 0.41
363 0.45
364 0.45
365 0.42
366 0.46
367 0.5
368 0.52
369 0.57
370 0.58
371 0.51
372 0.43
373 0.35
374 0.27
375 0.23
376 0.19
377 0.13
378 0.1
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.06
384 0.06
385 0.1
386 0.11
387 0.15
388 0.16
389 0.18
390 0.19
391 0.2
392 0.2
393 0.17
394 0.18
395 0.2
396 0.21
397 0.2
398 0.22
399 0.25
400 0.26
401 0.25
402 0.22
403 0.17
404 0.15
405 0.13
406 0.11
407 0.09
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.04
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.09
420 0.09
421 0.15
422 0.17
423 0.2
424 0.22
425 0.22
426 0.24
427 0.24
428 0.27
429 0.25
430 0.26
431 0.25
432 0.24
433 0.23
434 0.21
435 0.18
436 0.16
437 0.14
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.11
456 0.12
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.1
463 0.07
464 0.09
465 0.1
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.13
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.13
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.15
482 0.15
483 0.14
484 0.17
485 0.21
486 0.24
487 0.29
488 0.35
489 0.37
490 0.43
491 0.52
492 0.56
493 0.58
494 0.64
495 0.68
496 0.69
497 0.76
498 0.74
499 0.69
500 0.67
501 0.63
502 0.55
503 0.48
504 0.42
505 0.38
506 0.41
507 0.36
508 0.32
509 0.32
510 0.3
511 0.31
512 0.33
513 0.29
514 0.24
515 0.28
516 0.29
517 0.28
518 0.3
519 0.27
520 0.24
521 0.23
522 0.2
523 0.16
524 0.14
525 0.13
526 0.12
527 0.11
528 0.08
529 0.06
530 0.06
531 0.09
532 0.16
533 0.23
534 0.27
535 0.37
536 0.45
537 0.49
538 0.57
539 0.66
540 0.7
541 0.74
542 0.8
543 0.81
544 0.82
545 0.84
546 0.8
547 0.7
548 0.62
549 0.54
550 0.44
551 0.38
552 0.32
553 0.29
554 0.27
555 0.31
556 0.28
557 0.25
558 0.24
559 0.19
560 0.17
561 0.14
562 0.13
563 0.11
564 0.1
565 0.09
566 0.09
567 0.12
568 0.14
569 0.14
570 0.14
571 0.12
572 0.15
573 0.15
574 0.16
575 0.14
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.08
581 0.09
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.13
587 0.12
588 0.13
589 0.12
590 0.11
591 0.1
592 0.13
593 0.12
594 0.11
595 0.1
596 0.1
597 0.12
598 0.15
599 0.17
600 0.14
601 0.15
602 0.18
603 0.2
604 0.23
605 0.22
606 0.21
607 0.21
608 0.23
609 0.23
610 0.2
611 0.2
612 0.19
613 0.19
614 0.21
615 0.26
616 0.33
617 0.42
618 0.5
619 0.54
620 0.61
621 0.67
622 0.73
623 0.75
624 0.71
625 0.71
626 0.69
627 0.74
628 0.68
629 0.62
630 0.56
631 0.51
632 0.48
633 0.41
634 0.36
635 0.27
636 0.26
637 0.25
638 0.25
639 0.22
640 0.21
641 0.22
642 0.23
643 0.25
644 0.26
645 0.34
646 0.42
647 0.49
648 0.56
649 0.62
650 0.7
651 0.76
652 0.83
653 0.85
654 0.86
655 0.88
656 0.87
657 0.85
658 0.81
659 0.73
660 0.68
661 0.62
662 0.55
663 0.47
664 0.39
665 0.33
666 0.26
667 0.27
668 0.23
669 0.18
670 0.17
671 0.15
672 0.17
673 0.18
674 0.18
675 0.18
676 0.18
677 0.21
678 0.24
679 0.26
680 0.28
681 0.28
682 0.27
683 0.27
684 0.28
685 0.23
686 0.21
687 0.18
688 0.12
689 0.11
690 0.11
691 0.13
692 0.12
693 0.11
694 0.13
695 0.15
696 0.17
697 0.21