Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S9DIP4

Protein Details
Accession A0A1S9DIP4    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-82VPAAVPSPEKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKHESSQLTDETADHDIEKKKKSKKSKDKTKSKQADTEGAHydrophilic
384-416PEPETPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-45EKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKH
61-75KKKKSKKSKDKTKSK
391-416KTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAVDAMEIDSERVPAAVPSPEKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKHESSQLTDETADHDIEKKKKSKKSKDKTKSKQADTEGAAIPDSPYVLTTATLYLPLSPISISPTHAKASLLAEHLSPLLLTYYAPLQGVILAYSDASISSTPPSPYTSSDPADPNPKPLTLAKTAGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPSNWKWVPPGEEGSVSGDQQKTATTSEDDESEPSASFDQEKEHFNPVSLANPVSDTLNEEANAEDDESAAEGYFQSVSGHRVRGTVRFRVVDVDVIPGSERDRSFLSIEGTMLSPEEEARVLEDERNGILTTSATPRRGRSQEPRVSMSGALAAPSVAAIPEPETPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.11
3 0.16
4 0.18
5 0.2
6 0.3
7 0.39
8 0.47
9 0.57
10 0.65
11 0.7
12 0.79
13 0.87
14 0.89
15 0.91
16 0.94
17 0.94
18 0.94
19 0.91
20 0.88
21 0.85
22 0.84
23 0.8
24 0.79
25 0.78
26 0.78
27 0.78
28 0.8
29 0.84
30 0.85
31 0.87
32 0.89
33 0.91
34 0.89
35 0.9
36 0.83
37 0.73
38 0.63
39 0.52
40 0.44
41 0.35
42 0.26
43 0.17
44 0.19
45 0.25
46 0.31
47 0.39
48 0.44
49 0.51
50 0.6
51 0.7
52 0.76
53 0.8
54 0.85
55 0.89
56 0.92
57 0.94
58 0.95
59 0.96
60 0.94
61 0.9
62 0.87
63 0.8
64 0.77
65 0.68
66 0.63
67 0.53
68 0.43
69 0.36
70 0.28
71 0.23
72 0.15
73 0.13
74 0.08
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.1
91 0.11
92 0.13
93 0.15
94 0.17
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.17
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.17
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.13
107 0.1
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.07
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.13
135 0.14
136 0.17
137 0.22
138 0.25
139 0.24
140 0.27
141 0.28
142 0.27
143 0.34
144 0.31
145 0.31
146 0.28
147 0.26
148 0.25
149 0.26
150 0.28
151 0.24
152 0.26
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.2
157 0.17
158 0.12
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.15
175 0.16
176 0.19
177 0.19
178 0.21
179 0.15
180 0.21
181 0.21
182 0.19
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.12
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.03
203 0.04
204 0.05
205 0.08
206 0.09
207 0.12
208 0.15
209 0.17
210 0.24
211 0.28
212 0.38
213 0.43
214 0.46
215 0.46
216 0.45
217 0.47
218 0.42
219 0.39
220 0.3
221 0.23
222 0.19
223 0.2
224 0.19
225 0.16
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.11
249 0.13
250 0.16
251 0.18
252 0.23
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.21
257 0.21
258 0.18
259 0.16
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.1
288 0.13
289 0.15
290 0.15
291 0.18
292 0.19
293 0.27
294 0.31
295 0.34
296 0.35
297 0.35
298 0.35
299 0.35
300 0.34
301 0.29
302 0.24
303 0.21
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.13
308 0.13
309 0.15
310 0.14
311 0.13
312 0.15
313 0.17
314 0.18
315 0.2
316 0.22
317 0.18
318 0.18
319 0.17
320 0.15
321 0.13
322 0.12
323 0.1
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.1
331 0.11
332 0.13
333 0.14
334 0.15
335 0.15
336 0.16
337 0.15
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.12
342 0.18
343 0.23
344 0.26
345 0.28
346 0.32
347 0.41
348 0.45
349 0.51
350 0.54
351 0.6
352 0.64
353 0.68
354 0.69
355 0.62
356 0.59
357 0.5
358 0.41
359 0.34
360 0.25
361 0.2
362 0.15
363 0.12
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.07
371 0.11
372 0.15
373 0.17
374 0.21
375 0.23
376 0.3
377 0.39
378 0.45
379 0.48
380 0.54
381 0.61
382 0.68
383 0.77
384 0.82
385 0.82
386 0.85
387 0.89
388 0.89
389 0.9
390 0.9
391 0.9
392 0.91
393 0.92
394 0.92
395 0.93
396 0.94