Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S9DCX1

Protein Details
Accession A0A1S9DCX1    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-220AKEQIKPPRKQPKHLKMRFRPVGSBasic
239-308QPTFKMPKESRKEKEDKKRKHHQTDGEGSQPSAEPRKKFRKEDGVEKAEKSKKSSKSKEEKKRKKSEKSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-212KPPRKQPKHLK
245-308PKESRKEKEDKKRKHHQTDGEGSQPSAEPRKKFRKEDGVEKAEKSKKSSKSKEEKKRKKSEKSA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAPKSKEAVASDSESSRSNSPEVAEKAEVSSSSESENSSNESDSDNDSVASETQGKKKSSKFSSQAPQPYRAPSGFKAAKKQSPPSSSTTSLLSNLRSKQVYHITAPAFLPLSKVKEISLGKIMKGEPVMKHEGVEYGIPAESINQGDMGGKALLLYDSKSQTYYTTSTNDIRSYHVQELINLPERSEENDTVLEAAKEQIKPPRKQPKHLKMRFRPVGSEQGPPETIGSSSEESEGEQPTFKMPKESRKEKEDKKRKHHQTDGEGSQPSAEPRKKFRKEDGVEKAEKSKKSSKSKEEKKRKKSEKSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.26
4 0.25
5 0.22
6 0.2
7 0.21
8 0.27
9 0.28
10 0.3
11 0.29
12 0.27
13 0.27
14 0.27
15 0.25
16 0.21
17 0.2
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.16
28 0.16
29 0.17
30 0.19
31 0.19
32 0.16
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.13
37 0.13
38 0.16
39 0.18
40 0.25
41 0.31
42 0.33
43 0.38
44 0.44
45 0.52
46 0.53
47 0.59
48 0.57
49 0.59
50 0.66
51 0.69
52 0.73
53 0.68
54 0.66
55 0.59
56 0.58
57 0.54
58 0.46
59 0.42
60 0.34
61 0.39
62 0.4
63 0.41
64 0.46
65 0.48
66 0.53
67 0.54
68 0.61
69 0.59
70 0.58
71 0.58
72 0.55
73 0.54
74 0.5
75 0.46
76 0.4
77 0.32
78 0.3
79 0.28
80 0.26
81 0.24
82 0.23
83 0.26
84 0.25
85 0.24
86 0.27
87 0.33
88 0.33
89 0.29
90 0.33
91 0.29
92 0.3
93 0.3
94 0.25
95 0.18
96 0.15
97 0.16
98 0.13
99 0.16
100 0.15
101 0.15
102 0.14
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.26
107 0.23
108 0.22
109 0.25
110 0.25
111 0.2
112 0.21
113 0.21
114 0.15
115 0.19
116 0.23
117 0.2
118 0.2
119 0.19
120 0.18
121 0.16
122 0.15
123 0.1
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.14
154 0.17
155 0.19
156 0.2
157 0.21
158 0.19
159 0.21
160 0.22
161 0.24
162 0.23
163 0.25
164 0.23
165 0.23
166 0.24
167 0.24
168 0.29
169 0.24
170 0.23
171 0.2
172 0.2
173 0.22
174 0.24
175 0.2
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.11
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.13
187 0.2
188 0.28
189 0.31
190 0.41
191 0.51
192 0.53
193 0.63
194 0.72
195 0.75
196 0.78
197 0.83
198 0.84
199 0.82
200 0.88
201 0.86
202 0.76
203 0.69
204 0.62
205 0.63
206 0.54
207 0.5
208 0.4
209 0.36
210 0.35
211 0.31
212 0.28
213 0.18
214 0.16
215 0.12
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.15
223 0.15
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.16
228 0.19
229 0.18
230 0.25
231 0.27
232 0.37
233 0.47
234 0.56
235 0.58
236 0.65
237 0.75
238 0.76
239 0.84
240 0.84
241 0.85
242 0.85
243 0.89
244 0.9
245 0.91
246 0.9
247 0.88
248 0.87
249 0.85
250 0.81
251 0.75
252 0.65
253 0.55
254 0.47
255 0.39
256 0.32
257 0.33
258 0.33
259 0.32
260 0.41
261 0.53
262 0.6
263 0.66
264 0.72
265 0.74
266 0.75
267 0.8
268 0.81
269 0.79
270 0.74
271 0.7
272 0.7
273 0.65
274 0.62
275 0.58
276 0.56
277 0.58
278 0.65
279 0.72
280 0.74
281 0.78
282 0.86
283 0.9
284 0.93
285 0.94
286 0.94
287 0.95
288 0.95