Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S9D5C3

Protein Details
Accession A0A1S9D5C3    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-58SRQSSIDSNSHPRKRQRRNGKGEPTDARDHydrophilic
344-365FCPSWRRCQKCRERGHDQRDCSHydrophilic
560-579QPAPRSPPRGQSRPPPRGGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-47RKRQRR
548-597PNPRRGRGKDTWQPAPRSPPRGQSRPPPRGGRGGGRGRGGRGNGNKRGGN
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MPDSPGDDNNDSRTASVGAQRNRATSTNGSRQSSIDSNSHPRKRQRRNGKGEPTDARDFVPQGATFSANTLEVDPDSTSSSGSSSSDDESNSSDDGNEASSQAGPQSAAAPNWNKASKSTIRTSLNKRGNKANEGEHDSRFDAVNDKYWRSRSESVSNGGDNDNVSQTNSDGASEEGEVQEDDSSDSSRMHLSGDSDDSSLDSEADDSILLNINARGQTQNASQKQNGVQDDDYDPESLPVSQSITNGHTFGGAADGSPTTSKEEAFRHFAQKYPTNPETLADLNREDMDAQAKYVFYDREINDINLQLPVACIECMREGHLAEVCPYKECVHCGAWDKHQSSFCPSWRRCQKCRERGHDQRDCSSLLKGSASEIPCDLCGSSAHMELECDFMWKAHRQEPQSGPVLVSISCSHCTSSHHLVGDCPSLPQPLKSSSWTLKGVDPNMVTNINSVVNGRGGPSSRGRGGMKIRGRADVHSSPDDSDDLMTRRRPVGRGGNRGNIRIGSGIGKNKNLAPAGSRGPDMDSRQFYRDRQDFHSGNARQRSLSPNPRRGRGKDTWQPAPRSPPRGQSRPPPRGGRGGGRGRGGRGNGNKRGGNGDNYRPMPSAAKKAWDKYRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.27
4 0.31
5 0.33
6 0.41
7 0.43
8 0.44
9 0.46
10 0.45
11 0.43
12 0.43
13 0.47
14 0.49
15 0.54
16 0.55
17 0.52
18 0.51
19 0.52
20 0.48
21 0.43
22 0.37
23 0.36
24 0.43
25 0.52
26 0.6
27 0.62
28 0.68
29 0.75
30 0.82
31 0.86
32 0.88
33 0.88
34 0.9
35 0.93
36 0.94
37 0.91
38 0.88
39 0.84
40 0.8
41 0.74
42 0.64
43 0.55
44 0.47
45 0.41
46 0.34
47 0.31
48 0.24
49 0.21
50 0.21
51 0.21
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.18
78 0.16
79 0.15
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.18
97 0.2
98 0.23
99 0.29
100 0.31
101 0.28
102 0.28
103 0.35
104 0.37
105 0.4
106 0.42
107 0.45
108 0.49
109 0.56
110 0.63
111 0.66
112 0.68
113 0.67
114 0.65
115 0.66
116 0.65
117 0.62
118 0.58
119 0.54
120 0.52
121 0.55
122 0.54
123 0.46
124 0.44
125 0.39
126 0.36
127 0.3
128 0.23
129 0.2
130 0.18
131 0.24
132 0.25
133 0.28
134 0.31
135 0.33
136 0.35
137 0.38
138 0.43
139 0.41
140 0.45
141 0.45
142 0.46
143 0.46
144 0.44
145 0.38
146 0.32
147 0.27
148 0.2
149 0.17
150 0.14
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.08
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.11
206 0.16
207 0.25
208 0.28
209 0.32
210 0.31
211 0.35
212 0.37
213 0.41
214 0.37
215 0.31
216 0.26
217 0.25
218 0.25
219 0.23
220 0.21
221 0.16
222 0.14
223 0.11
224 0.12
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.12
251 0.15
252 0.18
253 0.24
254 0.25
255 0.28
256 0.28
257 0.31
258 0.33
259 0.35
260 0.36
261 0.38
262 0.36
263 0.33
264 0.32
265 0.3
266 0.27
267 0.23
268 0.21
269 0.15
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.1
275 0.08
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.14
286 0.14
287 0.18
288 0.19
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.18
293 0.12
294 0.11
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.08
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.11
309 0.1
310 0.11
311 0.13
312 0.12
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.14
318 0.16
319 0.14
320 0.16
321 0.22
322 0.24
323 0.28
324 0.34
325 0.34
326 0.35
327 0.36
328 0.34
329 0.34
330 0.36
331 0.35
332 0.39
333 0.38
334 0.45
335 0.53
336 0.6
337 0.59
338 0.65
339 0.71
340 0.71
341 0.8
342 0.78
343 0.78
344 0.81
345 0.85
346 0.82
347 0.74
348 0.67
349 0.59
350 0.53
351 0.43
352 0.34
353 0.25
354 0.19
355 0.16
356 0.13
357 0.12
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.13
365 0.11
366 0.07
367 0.07
368 0.09
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.13
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.11
381 0.15
382 0.18
383 0.23
384 0.28
385 0.29
386 0.38
387 0.41
388 0.42
389 0.42
390 0.39
391 0.33
392 0.29
393 0.27
394 0.19
395 0.17
396 0.14
397 0.12
398 0.13
399 0.14
400 0.14
401 0.14
402 0.17
403 0.22
404 0.27
405 0.28
406 0.28
407 0.28
408 0.28
409 0.29
410 0.29
411 0.22
412 0.17
413 0.14
414 0.16
415 0.16
416 0.17
417 0.17
418 0.19
419 0.21
420 0.22
421 0.27
422 0.27
423 0.32
424 0.33
425 0.32
426 0.32
427 0.35
428 0.33
429 0.32
430 0.29
431 0.25
432 0.25
433 0.24
434 0.2
435 0.16
436 0.16
437 0.12
438 0.12
439 0.11
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.14
447 0.18
448 0.21
449 0.21
450 0.26
451 0.26
452 0.3
453 0.34
454 0.4
455 0.42
456 0.45
457 0.45
458 0.47
459 0.47
460 0.44
461 0.46
462 0.41
463 0.41
464 0.36
465 0.36
466 0.3
467 0.3
468 0.29
469 0.21
470 0.18
471 0.16
472 0.15
473 0.18
474 0.2
475 0.21
476 0.26
477 0.29
478 0.3
479 0.34
480 0.42
481 0.47
482 0.55
483 0.59
484 0.63
485 0.63
486 0.63
487 0.57
488 0.47
489 0.39
490 0.29
491 0.24
492 0.19
493 0.21
494 0.27
495 0.28
496 0.29
497 0.3
498 0.31
499 0.34
500 0.31
501 0.27
502 0.23
503 0.24
504 0.27
505 0.27
506 0.26
507 0.22
508 0.24
509 0.28
510 0.31
511 0.33
512 0.34
513 0.36
514 0.4
515 0.43
516 0.42
517 0.47
518 0.48
519 0.45
520 0.46
521 0.52
522 0.48
523 0.49
524 0.57
525 0.52
526 0.54
527 0.57
528 0.52
529 0.44
530 0.47
531 0.49
532 0.49
533 0.56
534 0.58
535 0.6
536 0.65
537 0.73
538 0.78
539 0.75
540 0.74
541 0.71
542 0.71
543 0.7
544 0.72
545 0.73
546 0.73
547 0.74
548 0.7
549 0.73
550 0.7
551 0.69
552 0.65
553 0.65
554 0.67
555 0.7
556 0.71
557 0.71
558 0.74
559 0.77
560 0.81
561 0.79
562 0.74
563 0.74
564 0.73
565 0.71
566 0.7
567 0.69
568 0.66
569 0.64
570 0.62
571 0.56
572 0.56
573 0.5
574 0.49
575 0.5
576 0.55
577 0.57
578 0.61
579 0.6
580 0.56
581 0.6
582 0.55
583 0.54
584 0.51
585 0.51
586 0.53
587 0.53
588 0.55
589 0.48
590 0.47
591 0.46
592 0.44
593 0.45
594 0.4
595 0.47
596 0.51
597 0.58