Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S9DFW3

Protein Details
Accession A0A1S9DFW3    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-434FPPLLPRKLRVMRAKKQLKKREAGGHydrophilic
487-518NGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-110RKRKRA
124-143AKEEQKEEQKRRAEKAKRQK
338-341KKKK
415-443PRKLRVMRAKKQLKKREAGGSTQGKPLRE
491-527RIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAAGGKKRKTE
Subcellular Location(s) nucl 23.5, mito_nucl 13.333, cyto_mito 2.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKSKSQSEKAPQTEKAETSLPFLAGNVGIDPTLASLFETSSGPVKAPSLPTTSSAVEKPAAGDDSSEDVSEPEDEDQVMQEASEASSDAGGEPAQAASEPPSRKRKRAAGEDLEESYMRRIAKEEQKEEQKRRAEKAKRQKGEGEEEDEATSTDKSDDENEDESSDEDEEVAIPKHETVTGDAQSSDIDKSNRTVFLSNVSNEAIKSKSAKKTLLKHFESFLSTLPESTGPHKVESIRFRSTAFASGGKIPKRAAFAKREVLDETTPSTNAYIVYSTVQAARKAPVALNGTVVLDRHVRVDSVAHPAPVDNKRCVFVGNLNFVDQEGNADDEEKPKKKKAPADVEEGLWRTFNAHTSKPKDQATRRGNVESVRVVRDSVTRVSKGFAYVQFYDQNCVEEALLLNGKQFPPLLPRKLRVMRAKKQLKKREAGGSTQGKPLREADKTLQGRAGKLFGRAGAAKVRADATKIISNNSLVFEGHRATDNGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAAGGKKRKTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.71
3 0.62
4 0.54
5 0.48
6 0.4
7 0.38
8 0.35
9 0.29
10 0.23
11 0.21
12 0.19
13 0.15
14 0.15
15 0.11
16 0.09
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.17
35 0.21
36 0.23
37 0.24
38 0.25
39 0.27
40 0.3
41 0.3
42 0.29
43 0.26
44 0.26
45 0.23
46 0.21
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.16
51 0.15
52 0.14
53 0.17
54 0.18
55 0.16
56 0.14
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.09
87 0.16
88 0.2
89 0.27
90 0.38
91 0.44
92 0.5
93 0.58
94 0.63
95 0.65
96 0.72
97 0.75
98 0.73
99 0.72
100 0.69
101 0.63
102 0.55
103 0.46
104 0.36
105 0.28
106 0.22
107 0.17
108 0.14
109 0.14
110 0.21
111 0.3
112 0.38
113 0.42
114 0.47
115 0.58
116 0.67
117 0.71
118 0.71
119 0.7
120 0.67
121 0.69
122 0.72
123 0.71
124 0.72
125 0.77
126 0.8
127 0.76
128 0.74
129 0.74
130 0.69
131 0.68
132 0.61
133 0.56
134 0.46
135 0.42
136 0.38
137 0.32
138 0.26
139 0.18
140 0.15
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.1
146 0.12
147 0.14
148 0.16
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.13
155 0.09
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.15
175 0.13
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.16
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.15
185 0.19
186 0.22
187 0.2
188 0.19
189 0.19
190 0.17
191 0.16
192 0.18
193 0.13
194 0.11
195 0.14
196 0.19
197 0.25
198 0.28
199 0.34
200 0.39
201 0.48
202 0.57
203 0.63
204 0.6
205 0.56
206 0.54
207 0.49
208 0.44
209 0.36
210 0.27
211 0.21
212 0.17
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.15
218 0.2
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.2
223 0.25
224 0.3
225 0.33
226 0.29
227 0.29
228 0.29
229 0.3
230 0.28
231 0.26
232 0.21
233 0.17
234 0.16
235 0.2
236 0.24
237 0.23
238 0.24
239 0.21
240 0.21
241 0.24
242 0.28
243 0.28
244 0.29
245 0.32
246 0.37
247 0.37
248 0.37
249 0.34
250 0.31
251 0.26
252 0.22
253 0.2
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.16
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.1
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.21
297 0.25
298 0.27
299 0.23
300 0.24
301 0.25
302 0.25
303 0.25
304 0.21
305 0.21
306 0.22
307 0.25
308 0.24
309 0.24
310 0.24
311 0.23
312 0.22
313 0.15
314 0.11
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.08
319 0.08
320 0.13
321 0.2
322 0.24
323 0.28
324 0.32
325 0.38
326 0.43
327 0.5
328 0.55
329 0.6
330 0.58
331 0.63
332 0.59
333 0.54
334 0.51
335 0.46
336 0.35
337 0.24
338 0.2
339 0.14
340 0.13
341 0.17
342 0.18
343 0.21
344 0.29
345 0.36
346 0.42
347 0.46
348 0.51
349 0.54
350 0.57
351 0.62
352 0.61
353 0.61
354 0.59
355 0.56
356 0.52
357 0.45
358 0.43
359 0.37
360 0.34
361 0.29
362 0.25
363 0.23
364 0.22
365 0.23
366 0.23
367 0.23
368 0.24
369 0.23
370 0.23
371 0.24
372 0.24
373 0.23
374 0.25
375 0.22
376 0.23
377 0.23
378 0.25
379 0.3
380 0.3
381 0.3
382 0.27
383 0.25
384 0.2
385 0.19
386 0.16
387 0.12
388 0.11
389 0.11
390 0.12
391 0.11
392 0.12
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.12
398 0.2
399 0.28
400 0.35
401 0.38
402 0.41
403 0.5
404 0.56
405 0.64
406 0.66
407 0.68
408 0.68
409 0.74
410 0.82
411 0.81
412 0.85
413 0.87
414 0.85
415 0.81
416 0.79
417 0.78
418 0.71
419 0.67
420 0.66
421 0.63
422 0.57
423 0.58
424 0.54
425 0.45
426 0.43
427 0.43
428 0.39
429 0.33
430 0.36
431 0.33
432 0.41
433 0.43
434 0.43
435 0.43
436 0.39
437 0.39
438 0.36
439 0.36
440 0.27
441 0.27
442 0.27
443 0.22
444 0.25
445 0.24
446 0.24
447 0.25
448 0.27
449 0.24
450 0.24
451 0.26
452 0.22
453 0.24
454 0.24
455 0.22
456 0.26
457 0.27
458 0.28
459 0.27
460 0.28
461 0.27
462 0.27
463 0.23
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.17
468 0.17
469 0.17
470 0.16
471 0.18
472 0.24
473 0.27
474 0.29
475 0.3
476 0.32
477 0.33
478 0.41
479 0.44
480 0.44
481 0.48
482 0.53
483 0.62
484 0.7
485 0.76
486 0.78
487 0.82
488 0.86
489 0.9
490 0.9
491 0.89
492 0.89
493 0.9
494 0.9
495 0.92
496 0.89
497 0.89
498 0.86
499 0.85
500 0.79
501 0.76
502 0.7
503 0.66
504 0.66
505 0.64
506 0.63
507 0.61