FuNGI

A0A1S9D9J3

Protein Details

Accession

A0A1S9D9J3

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-40	GSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKKKL	Hydrophilic
134-153	SQFTRPVRLQRRDPRARSHE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-44	PMRIRRPKAADPLVRPKKKLAAKP
412-434	EKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE
491-509	RPKHTDPLKKGTAAAPRKR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MATPTNDLNARTPTGSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKKKLAAKPGISVSGNGPALKSVSSRPATSNPLSMPHPDRGKPSSSGADFSANGFSGPLLSETYTDYPLVTTKRALREGLKHHIARFASKKTVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARSHEMTSEKSQGMQKTMSESSHQMDEVEREELEARKAAREKERAENLAQIAPSAGSAPKRANVPKQKTQQVSKTDMTPEEMAKTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLEATGKMRMIPVEKWYRFNAKHQFKALTIEEAEKFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPSGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEEAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKDYEQEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDDESSDDSESERLKEEERKAEEEKNKKDTTASSKGNNTPSGRPKHTDPLKKGTAAAPRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKGKSKDLSSQPTPQPSSRNMSPVASSQMPLGKKRVRNVPLGGAGSGSDADGGAGSGGEMSESGKTKKLKLNPPAVSQGGTPQGSRAGSPTPLAGRSFSGSRASSPESFRGQTRVSTPVRAGNQSFPTPAEIHAAIPPSGILSSDLLKIFRPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGTLKES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.33
3	0.33
4	0.38
5	0.38
6	0.43
7	0.48
8	0.54
9	0.58
10	0.65
11	0.68
12	0.7
13	0.75
14	0.76
15	0.81
16	0.81
17	0.79
18	0.78
19	0.81
20	0.82
21	0.8
22	0.75
23	0.7
24	0.69
25	0.69
26	0.69
27	0.68
28	0.68
29	0.66
30	0.7
31	0.7
32	0.66
33	0.58
34	0.51
35	0.42
36	0.38
37	0.35
38	0.29
39	0.24
40	0.19
41	0.2
42	0.19
43	0.19
44	0.15
45	0.23
46	0.25
47	0.27
48	0.3
49	0.35
50	0.41
51	0.42
52	0.43
53	0.35
54	0.37
55	0.37
56	0.39
57	0.38
58	0.39
59	0.43
60	0.41
61	0.46
62	0.45
63	0.48
64	0.44
65	0.45
66	0.45
67	0.4
68	0.4
69	0.35
70	0.35
71	0.31
72	0.29
73	0.27
74	0.19
75	0.17
76	0.15
77	0.13
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.08
82	0.08
83	0.09
84	0.13
85	0.15
86	0.16
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.17
91	0.19
92	0.17
93	0.2
94	0.25
95	0.31
96	0.34
97	0.37
98	0.38
99	0.44
100	0.5
101	0.55
102	0.57
103	0.53
104	0.51
105	0.54
106	0.5
107	0.49
108	0.48
109	0.44
110	0.43
111	0.42
112	0.47
113	0.49
114	0.58
115	0.54
116	0.53
117	0.53
118	0.55
119	0.57
120	0.54
121	0.51
122	0.48
123	0.46
124	0.47
125	0.45
126	0.46
127	0.52
128	0.57
129	0.62
130	0.65
131	0.75
132	0.79
133	0.8
134	0.81
135	0.78
136	0.78
137	0.72
138	0.67
139	0.63
140	0.59
141	0.59
142	0.53
143	0.51
144	0.43
145	0.42
146	0.42
147	0.36
148	0.34
149	0.3
150	0.26
151	0.26
152	0.28
153	0.26
154	0.24
155	0.24
156	0.23
157	0.23
158	0.23
159	0.17
160	0.16
161	0.17
162	0.16
163	0.15
164	0.13
165	0.12
166	0.14
167	0.15
168	0.15
169	0.16
170	0.15
171	0.19
172	0.23
173	0.28
174	0.34
175	0.4
176	0.43
177	0.49
178	0.55
179	0.52
180	0.5
181	0.49
182	0.42
183	0.38
184	0.33
185	0.24
186	0.18
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.11
193	0.12
194	0.14
195	0.2
196	0.24
197	0.33
198	0.42
199	0.49
200	0.56
201	0.63
202	0.69
203	0.7
204	0.72
205	0.7
206	0.66
207	0.64
208	0.57
209	0.52
210	0.47
211	0.41
212	0.37
213	0.31
214	0.26
215	0.22
216	0.22
217	0.22
218	0.22
219	0.23
220	0.22
221	0.22
222	0.23
223	0.21
224	0.22
225	0.26
226	0.27
227	0.29
228	0.28
229	0.26
230	0.25
231	0.24
232	0.22
233	0.17
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.16
242	0.13
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.09
267	0.1
268	0.17
269	0.26
270	0.28
271	0.31
272	0.33
273	0.4
274	0.39
275	0.47
276	0.5
277	0.48
278	0.51
279	0.52
280	0.51
281	0.43
282	0.47
283	0.39
284	0.32
285	0.25
286	0.23
287	0.2
288	0.18
289	0.18
290	0.13
291	0.12
292	0.13
293	0.16
294	0.14
295	0.2
296	0.29
297	0.38
298	0.44
299	0.49
300	0.5
301	0.54
302	0.56
303	0.52
304	0.53
305	0.46
306	0.41
307	0.43
308	0.46
309	0.41
310	0.41
311	0.43
312	0.35
313	0.33
314	0.35
315	0.31
316	0.26
317	0.27
318	0.34
319	0.37
320	0.43
321	0.42
322	0.4
323	0.41
324	0.44
325	0.42
326	0.44
327	0.41
328	0.38
329	0.41
330	0.4
331	0.37
332	0.31
333	0.29
334	0.2
335	0.14
336	0.1
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.11
371	0.14
372	0.17
373	0.24
374	0.31
375	0.32
376	0.4
377	0.46
378	0.51
379	0.52
380	0.5
381	0.44
382	0.4
383	0.38
384	0.32
385	0.26
386	0.19
387	0.17
388	0.18
389	0.17
390	0.16
391	0.17
392	0.17
393	0.17
394	0.17
395	0.21
396	0.23
397	0.25
398	0.31
399	0.3
400	0.36
401	0.42
402	0.46
403	0.49
404	0.55
405	0.58
406	0.6
407	0.65
408	0.65
409	0.67
410	0.67
411	0.64
412	0.63
413	0.65
414	0.63
415	0.66
416	0.69
417	0.71
418	0.73
419	0.73
420	0.76
421	0.73
422	0.69
423	0.63
424	0.59
425	0.51
426	0.43
427	0.4
428	0.32
429	0.28
430	0.26
431	0.23
432	0.17
433	0.15
434	0.13
435	0.13
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.13
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.12
444	0.14
445	0.14
446	0.13
447	0.12
448	0.12
449	0.14
450	0.21
451	0.25
452	0.31
453	0.34
454	0.38
455	0.39
456	0.47
457	0.52
458	0.54
459	0.56
460	0.56
461	0.53
462	0.49
463	0.47
464	0.45
465	0.45
466	0.45
467	0.42
468	0.39
469	0.44
470	0.49
471	0.51
472	0.51
473	0.45
474	0.44
475	0.48
476	0.52
477	0.5
478	0.48
479	0.48
480	0.53
481	0.59
482	0.61
483	0.58
484	0.59
485	0.59
486	0.56
487	0.54
488	0.49
489	0.49
490	0.5
491	0.51
492	0.5
493	0.49
494	0.51
495	0.52
496	0.52
497	0.47
498	0.46
499	0.42
500	0.41
501	0.4
502	0.37
503	0.35
504	0.3
505	0.3
506	0.24
507	0.21
508	0.2
509	0.21
510	0.24
511	0.31
512	0.34
513	0.34
514	0.4
515	0.5
516	0.55
517	0.59
518	0.67
519	0.71
520	0.75
521	0.74
522	0.75
523	0.69
524	0.65
525	0.62
526	0.55
527	0.49
528	0.45
529	0.48
530	0.42
531	0.42
532	0.36
533	0.34
534	0.33
535	0.3
536	0.31
537	0.25
538	0.22
539	0.2
540	0.24
541	0.25
542	0.26
543	0.31
544	0.33
545	0.37
546	0.43
547	0.51
548	0.5
549	0.54
550	0.55
551	0.54
552	0.52
553	0.49
554	0.42
555	0.32
556	0.28
557	0.22
558	0.18
559	0.12
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.04
564	0.04
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.04
573	0.07
574	0.1
575	0.12
576	0.18
577	0.2
578	0.26
579	0.34
580	0.42
581	0.49
582	0.56
583	0.65
584	0.65
585	0.68
586	0.68
587	0.62
588	0.53
589	0.44
590	0.39
591	0.35
592	0.3
593	0.25
594	0.2
595	0.23
596	0.22
597	0.22
598	0.2
599	0.17
600	0.17
601	0.18
602	0.2
603	0.19
604	0.21
605	0.22
606	0.21
607	0.2
608	0.22
609	0.22
610	0.21
611	0.24
612	0.22
613	0.23
614	0.26
615	0.29
616	0.31
617	0.33
618	0.36
619	0.36
620	0.38
621	0.38
622	0.38
623	0.35
624	0.34
625	0.34
626	0.37
627	0.34
628	0.36
629	0.36
630	0.39
631	0.41
632	0.43
633	0.42
634	0.41
635	0.44
636	0.42
637	0.41
638	0.34
639	0.34
640	0.3
641	0.28
642	0.26
643	0.21
644	0.2
645	0.22
646	0.23
647	0.19
648	0.18
649	0.17
650	0.13
651	0.12
652	0.11
653	0.1
654	0.09
655	0.11
656	0.15
657	0.16
658	0.16
659	0.19
660	0.23
661	0.25
662	0.26
663	0.28
664	0.28
665	0.36
666	0.43
667	0.48
668	0.48
669	0.56
670	0.65
671	0.64
672	0.63
673	0.55
674	0.49
675	0.44
676	0.48
677	0.45
678	0.38
679	0.37
680	0.35
681	0.35
682	0.34
683	0.33
684	0.25
685	0.19
686	0.18
687	0.19
688	0.21
689	0.22
690	0.23
691	0.29
692	0.31
693	0.3
694	0.34

A0A1S9D9J3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer