Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S9DCS7

Protein Details
Accession A0A1S9DCS7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-57SIPSTGPPPKPLRKNRAGQTRQGMTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1221-1245PIKRPQQPGSRGGRRGGLGVKRAGP
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MMDINSLLSPQESNSQSGRSSPSAAPTSVSNTSIPSTGPPPKPLRKNRAGQTRQGMTSSPLAQHVFAPSHVSEPSPPAISPTVGPNVGSGSGTPPAADLPPPRQPSTPGMDTLADLASMQHHQPQRSNAPLLRSTESYESQLSPSTMYPHVSSVAHNTPTPRSSFDIAMSDGPREAARRNYMDTSLVPNAQRMATELFAQIQENPQSYDAHVNFVRLLHAGFVNHVYPPNNPDIHGDPRKYDLLKDMRTAREEMDKLFAMGEDLWAEWIQDESMLAQTVDERIVVMELCQRSVEEEYGSTKLWSIYGEWVLYLYNSAHAEGAQHQWTEEDRMIGREVFSWHMVLDVWQRGAEATRWRTPDSHLVWDRLLDLQVQDITRNPSQEKIGHVRNLFDIRLQTPHATWDQTFQAFSGFVSTYYNANYETIMADTAGRYATSCKEQYSAREEFEIRLRNATEAGDVTQEWTIFTEYIEWEISNNRRNHHSNFELVNAVYQRAVLRFPTDANMWEDFVMFLIDESMHGNANTTTISTLERATRHCPCSGTLWSQYLLSSEREGQSFSKIADIKHKATSTGLLDVAGMEEVLKVHTAWCSYLRRRAFMPDSTDEDLDVAEVGIRSAIESVQELGEKKYGRSYQGDPLFRLERIYIRYLSESGSWDSARETFKGLMGRRGNSYEFWLTYYEWELISWSKFVQGEATVDAARRTPNPSFATAVLKQAIKRTDLDWPEKIMQTYIAHCEDYEDSDELQLAILETRKAMRAVRARRERDARELAAQHAQQAASSQQATHPEKRKREEEEANVNGLPAKKARGEEETSAAEAEPAVLQRDRENATVVVKNLPHQISEHKVRQFFRHCGTINSVKMFPGDGNSEVAVIEFNSRDEALVAQTRDQKSLDGFTIEVQIGTCSTLFVTNFPPEADENYIRGLFREYGEIIDVRFPSLKYNTHRRFCYVQFKTAEAAHSATKLDGTTVGKGLTLTAKISDPSRKQDRHGPIYEGREIHVSNVDFKASERDVQELFSKYGTVELVRLPRKVDGGSKGFGYVVFSNKEEATAALAMDGQEYRSRTLHVKISAPQSTKRSATTIVSQVGKSQSPAAVVNGSKESADADTPSRERAARSLGLMNIPDTVNDARIRALVEPYGKLIKIVLRPDHQGAIVEFADVNHAGRASLELEGQEIAPGRKLHVGTVPEMLKQSAENKDGRIQPSSKPKEKQGGFLQPTGPIKRPQQPGSRGGRRGGLGVKRAGPHGGHNGEKTMTTTMMTTDSAPSAEGGKTKKSNDDFRAMIQRGREE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.3
5 0.34
6 0.28
7 0.32
8 0.3
9 0.35
10 0.36
11 0.35
12 0.33
13 0.29
14 0.33
15 0.31
16 0.31
17 0.24
18 0.22
19 0.23
20 0.23
21 0.21
22 0.19
23 0.23
24 0.3
25 0.34
26 0.4
27 0.48
28 0.57
29 0.67
30 0.74
31 0.78
32 0.78
33 0.84
34 0.86
35 0.88
36 0.84
37 0.82
38 0.81
39 0.78
40 0.7
41 0.62
42 0.53
43 0.45
44 0.45
45 0.39
46 0.31
47 0.29
48 0.28
49 0.27
50 0.27
51 0.28
52 0.24
53 0.21
54 0.24
55 0.2
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.19
60 0.21
61 0.24
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.24
69 0.25
70 0.23
71 0.24
72 0.2
73 0.2
74 0.2
75 0.19
76 0.14
77 0.12
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.11
82 0.12
83 0.13
84 0.17
85 0.18
86 0.22
87 0.31
88 0.37
89 0.39
90 0.39
91 0.42
92 0.44
93 0.48
94 0.45
95 0.38
96 0.36
97 0.33
98 0.32
99 0.3
100 0.24
101 0.16
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.17
108 0.21
109 0.25
110 0.3
111 0.37
112 0.43
113 0.47
114 0.53
115 0.49
116 0.51
117 0.52
118 0.52
119 0.48
120 0.42
121 0.4
122 0.38
123 0.37
124 0.34
125 0.31
126 0.28
127 0.25
128 0.26
129 0.23
130 0.2
131 0.19
132 0.2
133 0.2
134 0.2
135 0.2
136 0.19
137 0.21
138 0.2
139 0.2
140 0.23
141 0.27
142 0.28
143 0.28
144 0.29
145 0.31
146 0.33
147 0.34
148 0.31
149 0.29
150 0.3
151 0.3
152 0.3
153 0.28
154 0.27
155 0.3
156 0.27
157 0.24
158 0.21
159 0.2
160 0.18
161 0.17
162 0.19
163 0.21
164 0.26
165 0.29
166 0.33
167 0.35
168 0.35
169 0.36
170 0.34
171 0.34
172 0.31
173 0.32
174 0.27
175 0.26
176 0.26
177 0.24
178 0.22
179 0.18
180 0.18
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.15
188 0.17
189 0.19
190 0.19
191 0.2
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.29
196 0.24
197 0.27
198 0.26
199 0.25
200 0.25
201 0.24
202 0.24
203 0.15
204 0.15
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.16
213 0.15
214 0.16
215 0.19
216 0.24
217 0.23
218 0.23
219 0.26
220 0.28
221 0.36
222 0.42
223 0.4
224 0.36
225 0.39
226 0.43
227 0.4
228 0.36
229 0.36
230 0.37
231 0.38
232 0.43
233 0.45
234 0.44
235 0.46
236 0.46
237 0.4
238 0.39
239 0.37
240 0.33
241 0.3
242 0.26
243 0.24
244 0.23
245 0.2
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.16
280 0.16
281 0.12
282 0.12
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.15
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.07
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.11
307 0.12
308 0.16
309 0.15
310 0.14
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.19
315 0.17
316 0.15
317 0.14
318 0.16
319 0.17
320 0.17
321 0.16
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.15
326 0.14
327 0.12
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.15
338 0.16
339 0.2
340 0.23
341 0.28
342 0.3
343 0.32
344 0.33
345 0.35
346 0.41
347 0.37
348 0.41
349 0.39
350 0.39
351 0.37
352 0.37
353 0.34
354 0.26
355 0.23
356 0.14
357 0.11
358 0.1
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.12
363 0.17
364 0.18
365 0.21
366 0.2
367 0.2
368 0.23
369 0.25
370 0.28
371 0.3
372 0.34
373 0.37
374 0.37
375 0.36
376 0.37
377 0.37
378 0.32
379 0.27
380 0.23
381 0.19
382 0.21
383 0.21
384 0.18
385 0.16
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.17
390 0.18
391 0.19
392 0.19
393 0.19
394 0.15
395 0.14
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.09
400 0.08
401 0.1
402 0.11
403 0.1
404 0.11
405 0.12
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.07
421 0.09
422 0.14
423 0.15
424 0.15
425 0.17
426 0.19
427 0.23
428 0.28
429 0.28
430 0.24
431 0.26
432 0.26
433 0.25
434 0.3
435 0.32
436 0.26
437 0.26
438 0.25
439 0.23
440 0.23
441 0.21
442 0.16
443 0.11
444 0.11
445 0.09
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.09
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.13
462 0.17
463 0.23
464 0.25
465 0.25
466 0.31
467 0.36
468 0.39
469 0.42
470 0.4
471 0.37
472 0.36
473 0.36
474 0.31
475 0.27
476 0.25
477 0.18
478 0.16
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.1
484 0.08
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.13
491 0.15
492 0.15
493 0.14
494 0.14
495 0.13
496 0.11
497 0.1
498 0.08
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.07
517 0.08
518 0.1
519 0.12
520 0.15
521 0.2
522 0.25
523 0.26
524 0.27
525 0.27
526 0.25
527 0.29
528 0.3
529 0.29
530 0.25
531 0.25
532 0.23
533 0.23
534 0.21
535 0.18
536 0.16
537 0.13
538 0.11
539 0.12
540 0.13
541 0.13
542 0.14
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.13
547 0.16
548 0.16
549 0.16
550 0.24
551 0.28
552 0.28
553 0.31
554 0.31
555 0.27
556 0.26
557 0.28
558 0.2
559 0.17
560 0.15
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.09
565 0.06
566 0.05
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.04
572 0.03
573 0.04
574 0.05
575 0.06
576 0.07
577 0.11
578 0.17
579 0.2
580 0.27
581 0.28
582 0.29
583 0.29
584 0.34
585 0.34
586 0.31
587 0.34
588 0.29
589 0.33
590 0.33
591 0.32
592 0.26
593 0.22
594 0.18
595 0.13
596 0.1
597 0.05
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.04
608 0.04
609 0.05
610 0.06
611 0.07
612 0.07
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.16
617 0.17
618 0.18
619 0.21
620 0.24
621 0.28
622 0.35
623 0.36
624 0.32
625 0.34
626 0.32
627 0.29
628 0.27
629 0.19
630 0.15
631 0.16
632 0.18
633 0.15
634 0.15
635 0.16
636 0.15
637 0.16
638 0.14
639 0.13
640 0.11
641 0.12
642 0.11
643 0.1
644 0.11
645 0.13
646 0.13
647 0.12
648 0.12
649 0.11
650 0.13
651 0.18
652 0.18
653 0.23
654 0.25
655 0.25
656 0.25
657 0.27
658 0.26
659 0.22
660 0.24
661 0.18
662 0.16
663 0.15
664 0.15
665 0.13
666 0.13
667 0.14
668 0.11
669 0.1
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.07
676 0.08
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.09
682 0.09
683 0.1
684 0.08
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.13
691 0.12
692 0.18
693 0.2
694 0.21
695 0.22
696 0.22
697 0.27
698 0.24
699 0.25
700 0.21
701 0.2
702 0.19
703 0.22
704 0.22
705 0.18
706 0.18
707 0.17
708 0.22
709 0.26
710 0.29
711 0.26
712 0.28
713 0.29
714 0.29
715 0.28
716 0.21
717 0.19
718 0.16
719 0.16
720 0.16
721 0.15
722 0.14
723 0.14
724 0.15
725 0.13
726 0.14
727 0.14
728 0.11
729 0.1
730 0.1
731 0.1
732 0.08
733 0.08
734 0.06
735 0.04
736 0.04
737 0.05
738 0.05
739 0.05
740 0.06
741 0.07
742 0.09
743 0.09
744 0.15
745 0.23
746 0.31
747 0.41
748 0.5
749 0.52
750 0.58
751 0.65
752 0.61
753 0.6
754 0.57
755 0.49
756 0.44
757 0.42
758 0.37
759 0.34
760 0.31
761 0.25
762 0.21
763 0.19
764 0.14
765 0.14
766 0.12
767 0.09
768 0.1
769 0.09
770 0.09
771 0.18
772 0.22
773 0.29
774 0.38
775 0.44
776 0.51
777 0.56
778 0.6
779 0.58
780 0.62
781 0.61
782 0.59
783 0.61
784 0.56
785 0.52
786 0.46
787 0.39
788 0.33
789 0.27
790 0.21
791 0.12
792 0.12
793 0.13
794 0.14
795 0.17
796 0.19
797 0.22
798 0.23
799 0.26
800 0.25
801 0.23
802 0.22
803 0.19
804 0.14
805 0.1
806 0.09
807 0.06
808 0.05
809 0.07
810 0.07
811 0.08
812 0.09
813 0.13
814 0.15
815 0.15
816 0.17
817 0.16
818 0.19
819 0.21
820 0.21
821 0.2
822 0.18
823 0.19
824 0.23
825 0.22
826 0.19
827 0.18
828 0.22
829 0.25
830 0.31
831 0.36
832 0.35
833 0.4
834 0.41
835 0.47
836 0.5
837 0.48
838 0.45
839 0.46
840 0.42
841 0.4
842 0.44
843 0.44
844 0.4
845 0.38
846 0.34
847 0.27
848 0.27
849 0.25
850 0.19
851 0.14
852 0.13
853 0.11
854 0.12
855 0.11
856 0.11
857 0.11
858 0.1
859 0.08
860 0.06
861 0.07
862 0.06
863 0.06
864 0.07
865 0.07
866 0.07
867 0.07
868 0.07
869 0.09
870 0.12
871 0.13
872 0.15
873 0.22
874 0.23
875 0.25
876 0.25
877 0.23
878 0.2
879 0.22
880 0.2
881 0.14
882 0.13
883 0.12
884 0.14
885 0.13
886 0.12
887 0.09
888 0.09
889 0.08
890 0.08
891 0.07
892 0.05
893 0.05
894 0.07
895 0.07
896 0.09
897 0.12
898 0.13
899 0.14
900 0.14
901 0.15
902 0.14
903 0.16
904 0.2
905 0.18
906 0.17
907 0.19
908 0.2
909 0.18
910 0.18
911 0.18
912 0.14
913 0.13
914 0.15
915 0.13
916 0.13
917 0.14
918 0.14
919 0.12
920 0.14
921 0.13
922 0.12
923 0.13
924 0.13
925 0.16
926 0.19
927 0.25
928 0.28
929 0.4
930 0.47
931 0.53
932 0.55
933 0.55
934 0.57
935 0.57
936 0.62
937 0.55
938 0.53
939 0.48
940 0.48
941 0.45
942 0.41
943 0.36
944 0.26
945 0.24
946 0.18
947 0.17
948 0.15
949 0.13
950 0.12
951 0.11
952 0.09
953 0.11
954 0.12
955 0.13
956 0.13
957 0.13
958 0.13
959 0.13
960 0.13
961 0.12
962 0.11
963 0.1
964 0.1
965 0.11
966 0.12
967 0.16
968 0.23
969 0.25
970 0.32
971 0.42
972 0.43
973 0.46
974 0.54
975 0.6
976 0.61
977 0.6
978 0.58
979 0.54
980 0.56
981 0.58
982 0.48
983 0.4
984 0.35
985 0.31
986 0.27
987 0.26
988 0.21
989 0.2
990 0.2
991 0.2
992 0.17
993 0.17
994 0.22
995 0.18
996 0.21
997 0.19
998 0.21
999 0.21
1000 0.23
1001 0.26
1002 0.23
1003 0.22
1004 0.19
1005 0.18
1006 0.15
1007 0.16
1008 0.15
1009 0.12
1010 0.1
1011 0.13
1012 0.21
1013 0.24
1014 0.25
1015 0.25
1016 0.26
1017 0.28
1018 0.28
1019 0.3
1020 0.29
1021 0.3
1022 0.3
1023 0.29
1024 0.28
1025 0.26
1026 0.24
1027 0.23
1028 0.18
1029 0.17
1030 0.18
1031 0.18
1032 0.2
1033 0.2
1034 0.2
1035 0.16
1036 0.14
1037 0.13
1038 0.11
1039 0.11
1040 0.08
1041 0.09
1042 0.09
1043 0.09
1044 0.09
1045 0.08
1046 0.11
1047 0.12
1048 0.15
1049 0.15
1050 0.18
1051 0.2
1052 0.25
1053 0.3
1054 0.3
1055 0.33
1056 0.36
1057 0.43
1058 0.47
1059 0.47
1060 0.48
1061 0.46
1062 0.48
1063 0.46
1064 0.42
1065 0.37
1066 0.34
1067 0.34
1068 0.34
1069 0.35
1070 0.35
1071 0.35
1072 0.33
1073 0.34
1074 0.34
1075 0.31
1076 0.27
1077 0.24
1078 0.2
1079 0.19
1080 0.2
1081 0.18
1082 0.19
1083 0.19
1084 0.21
1085 0.2
1086 0.19
1087 0.17
1088 0.16
1089 0.15
1090 0.12
1091 0.13
1092 0.12
1093 0.13
1094 0.19
1095 0.2
1096 0.22
1097 0.23
1098 0.23
1099 0.23
1100 0.25
1101 0.28
1102 0.25
1103 0.27
1104 0.29
1105 0.28
1106 0.3
1107 0.29
1108 0.26
1109 0.22
1110 0.2
1111 0.17
1112 0.16
1113 0.15
1114 0.16
1115 0.16
1116 0.16
1117 0.15
1118 0.16
1119 0.17
1120 0.15
1121 0.17
1122 0.17
1123 0.19
1124 0.19
1125 0.22
1126 0.24
1127 0.23
1128 0.21
1129 0.21
1130 0.23
1131 0.26
1132 0.32
1133 0.35
1134 0.35
1135 0.4
1136 0.43
1137 0.43
1138 0.37
1139 0.34
1140 0.28
1141 0.26
1142 0.22
1143 0.18
1144 0.16
1145 0.13
1146 0.15
1147 0.13
1148 0.14
1149 0.1
1150 0.1
1151 0.09
1152 0.09
1153 0.11
1154 0.09
1155 0.1
1156 0.1
1157 0.09
1158 0.1
1159 0.11
1160 0.11
1161 0.11
1162 0.12
1163 0.12
1164 0.16
1165 0.16
1166 0.17
1167 0.22
1168 0.22
1169 0.23
1170 0.27
1171 0.28
1172 0.26
1173 0.33
1174 0.32
1175 0.29
1176 0.3
1177 0.28
1178 0.22
1179 0.22
1180 0.26
1181 0.25
1182 0.29
1183 0.29
1184 0.31
1185 0.38
1186 0.44
1187 0.45
1188 0.45
1189 0.41
1190 0.44
1191 0.53
1192 0.6
1193 0.61
1194 0.61
1195 0.66
1196 0.69
1197 0.69
1198 0.7
1199 0.68
1200 0.7
1201 0.65
1202 0.64
1203 0.57
1204 0.53
1205 0.57
1206 0.54
1207 0.48
1208 0.44
1209 0.47
1210 0.52
1211 0.59
1212 0.61
1213 0.64
1214 0.66
1215 0.71
1216 0.75
1217 0.78
1218 0.73
1219 0.67
1220 0.64
1221 0.55
1222 0.53
1223 0.51
1224 0.47
1225 0.43
1226 0.44
1227 0.46
1228 0.43
1229 0.43
1230 0.43
1231 0.36
1232 0.35
1233 0.39
1234 0.4
1235 0.39
1236 0.38
1237 0.4
1238 0.37
1239 0.36
1240 0.33
1241 0.26
1242 0.21
1243 0.17
1244 0.16
1245 0.15
1246 0.16
1247 0.16
1248 0.15
1249 0.15
1250 0.15
1251 0.15
1252 0.14
1253 0.14
1254 0.14
1255 0.15
1256 0.18
1257 0.19
1258 0.27
1259 0.32
1260 0.35
1261 0.44
1262 0.49
1263 0.57
1264 0.58
1265 0.63
1266 0.57
1267 0.57
1268 0.65
1269 0.58
1270 0.54