FuNGI

A0A1S9D4J9

Protein Details

Accession

A0A1S9D4J9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MPSDKVEKKRKRASNGHERPSKKP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-23	EKKRKRASNGHERPSKK
466-495	KGGKAEANARRVARLRVPVEFPKVSRGGKR

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 10.833, mito 6.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MPSDKVEKKRKRASNGHERPSKKPALEFQDLPPLAASVVNDDSELAPVIITTPGVNVPQNLHLKPYLKDRADGSLSGRSTRNKGIVSSELLLQTSEHPKMDFVGREAEDDADSQLKHYIAVVDPEKKSWQFVEVRKVTLRGAVRRTKAAADEEEEVESEDEEMKTMRAQRTELTNTFGTKQSRKAAQSMAENAQLSNAPAGAASAAESAILSSMPLDSATDIATKTAAVQAQVQANKPLPQANLAASHPSDVYPIDVLVPGGLSTLQQLPGTNEWQETVNSGEAVATTSRYVSRRVEAVVNSTNATQLQVLRFIFLLLELARALRSGKDSKSSGPGSKRLPPRDELRRILSSPTGAKTDSAETLPDPVIDAIRRKFAPQGTHITKNDITFLHTTICALSLHIPPQPAKDGGSSSLGGNAPNELATDPSDLRDDLRLDNTVITQYFRELGCRVDKPRETEFAKWGIKGGKAEANARRVARLRVPVEFPKVSRGGKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.89
2	0.89
3	0.89
4	0.88
5	0.83
6	0.79
7	0.78
8	0.75
9	0.66
10	0.62
11	0.6
12	0.6
13	0.63
14	0.59
15	0.53
16	0.57
17	0.53
18	0.47
19	0.39
20	0.3
21	0.24
22	0.22
23	0.18
24	0.12
25	0.13
26	0.13
27	0.13
28	0.13
29	0.13
30	0.13
31	0.13
32	0.09
33	0.07
34	0.07
35	0.08
36	0.07
37	0.07
38	0.06
39	0.07
40	0.09
41	0.11
42	0.12
43	0.12
44	0.15
45	0.22
46	0.28
47	0.27
48	0.29
49	0.32
50	0.34
51	0.36
52	0.43
53	0.45
54	0.4
55	0.42
56	0.41
57	0.43
58	0.43
59	0.42
60	0.36
61	0.33
62	0.33
63	0.33
64	0.35
65	0.32
66	0.33
67	0.37
68	0.39
69	0.33
70	0.33
71	0.35
72	0.35
73	0.35
74	0.32
75	0.3
76	0.25
77	0.24
78	0.22
79	0.18
80	0.19
81	0.21
82	0.21
83	0.19
84	0.19
85	0.19
86	0.21
87	0.25
88	0.22
89	0.18
90	0.23
91	0.23
92	0.24
93	0.25
94	0.23
95	0.19
96	0.18
97	0.17
98	0.13
99	0.12
100	0.12
101	0.13
102	0.12
103	0.12
104	0.12
105	0.13
106	0.11
107	0.17
108	0.2
109	0.24
110	0.25
111	0.27
112	0.3
113	0.28
114	0.29
115	0.24
116	0.27
117	0.28
118	0.32
119	0.41
120	0.4
121	0.43
122	0.43
123	0.43
124	0.37
125	0.35
126	0.35
127	0.31
128	0.36
129	0.4
130	0.41
131	0.42
132	0.44
133	0.4
134	0.37
135	0.35
136	0.29
137	0.24
138	0.25
139	0.23
140	0.21
141	0.2
142	0.17
143	0.14
144	0.12
145	0.09
146	0.08
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.09
152	0.14
153	0.17
154	0.17
155	0.18
156	0.2
157	0.27
158	0.32
159	0.31
160	0.3
161	0.29
162	0.28
163	0.29
164	0.32
165	0.29
166	0.26
167	0.3
168	0.31
169	0.36
170	0.36
171	0.37
172	0.36
173	0.36
174	0.37
175	0.37
176	0.33
177	0.3
178	0.28
179	0.25
180	0.22
181	0.18
182	0.15
183	0.1
184	0.08
185	0.05
186	0.04
187	0.05
188	0.04
189	0.03
190	0.04
191	0.04
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.04
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.1
218	0.14
219	0.16
220	0.16
221	0.17
222	0.17
223	0.19
224	0.19
225	0.19
226	0.15
227	0.15
228	0.16
229	0.15
230	0.16
231	0.14
232	0.15
233	0.12
234	0.13
235	0.11
236	0.1
237	0.09
238	0.07
239	0.07
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.09
257	0.1
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.06
271	0.07
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.09
277	0.1
278	0.13
279	0.13
280	0.15
281	0.16
282	0.18
283	0.2
284	0.18
285	0.22
286	0.22
287	0.21
288	0.2
289	0.19
290	0.18
291	0.14
292	0.14
293	0.11
294	0.09
295	0.09
296	0.12
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.12
301	0.1
302	0.09
303	0.09
304	0.05
305	0.06
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.06
312	0.11
313	0.14
314	0.15
315	0.21
316	0.22
317	0.24
318	0.31
319	0.33
320	0.35
321	0.36
322	0.41
323	0.39
324	0.46
325	0.52
326	0.52
327	0.52
328	0.51
329	0.55
330	0.59
331	0.62
332	0.59
333	0.57
334	0.54
335	0.52
336	0.5
337	0.43
338	0.36
339	0.31
340	0.28
341	0.24
342	0.2
343	0.2
344	0.19
345	0.2
346	0.18
347	0.15
348	0.14
349	0.13
350	0.15
351	0.15
352	0.13
353	0.11
354	0.1
355	0.11
356	0.13
357	0.18
358	0.16
359	0.22
360	0.22
361	0.23
362	0.27
363	0.3
364	0.33
365	0.33
366	0.42
367	0.43
368	0.51
369	0.5
370	0.51
371	0.49
372	0.44
373	0.42
374	0.32
375	0.29
376	0.22
377	0.23
378	0.19
379	0.17
380	0.16
381	0.14
382	0.14
383	0.11
384	0.1
385	0.13
386	0.13
387	0.16
388	0.17
389	0.2
390	0.2
391	0.23
392	0.26
393	0.23
394	0.22
395	0.22
396	0.22
397	0.22
398	0.24
399	0.21
400	0.18
401	0.21
402	0.2
403	0.18
404	0.17
405	0.15
406	0.12
407	0.12
408	0.12
409	0.08
410	0.09
411	0.1
412	0.13
413	0.12
414	0.13
415	0.15
416	0.15
417	0.16
418	0.19
419	0.19
420	0.19
421	0.21
422	0.22
423	0.21
424	0.22
425	0.21
426	0.2
427	0.19
428	0.18
429	0.16
430	0.15
431	0.18
432	0.17
433	0.19
434	0.17
435	0.2
436	0.26
437	0.32
438	0.35
439	0.42
440	0.46
441	0.49
442	0.54
443	0.58
444	0.55
445	0.54
446	0.54
447	0.53
448	0.52
449	0.46
450	0.45
451	0.41
452	0.4
453	0.38
454	0.37
455	0.33
456	0.33
457	0.41
458	0.43
459	0.44
460	0.46
461	0.45
462	0.47
463	0.45
464	0.48
465	0.47
466	0.5
467	0.48
468	0.48
469	0.54
470	0.54
471	0.58
472	0.57
473	0.51
474	0.49
475	0.52

A0A1S9D4J9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer