Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VYI2

Protein Details
Accession A0A1S8VYI2    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MSGTRPKQAGQSRQNRRQQQLQQQQQQLNQHydrophilic
779-805LDKPSVQPEKEKRKAKRIAKRDMPEAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
788-800KEKRKAKRIAKRD
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MSGTRPKQAGQSRQNRRQQQLQQQQQQLNQLQQQQLQQQQQQQHQLHLQQQPLLHLQQQLFAQQQLRLQQQLQHLQQGHQLQIVKEQAANDEEEDDDDDDDDDDDDEEEDDNENEDEDEAGGEGDDDDDEDDNENEEDEEDGGEEDDEQAAGPELEEAEVDNGDGFLSMLEDRQPNQQPLHQQSNGSHYNTTNGSNSDTDDALAQLQELLDDVGNNAAATSSTSTAVTTAGDTTGTTAAKTTSTNVTSSIAASAAVNPFLLSGQQFLQPQHYYQLQLQQQRMQHQQQQQQKQKLQQQQQQQQQQMGSQSMQKTALHPDLMLLLNKIPTDKHDYVVKLYHQLRAKQINEEQFISESSALIAASSMMLNPSSSFKVGHIGSTDQTTTKRQSDAAASLSKRSKVEVQIPATSTLQQTQAILAQLYPGMASGATPRPPQATPQSSHPAWMKNSATPASTNSASGPTPRRSISTPSAPIVPVKLQIPSASIAKPKPEADVTKMDVEGMMDVTSYAGVDLREEEVAMTDTYGAHTQAVSSTVQQDKPLLNIPVLDKLVKDIAVKTAGISTVDPAFSRLLSHATHAFILNLLHHMRAISQHRSGASFEDFLSAEREIVLSRMTLEVLPTDDVKSQIAVFEERERAEEERMMALLGPFPSELGDAAGEGVDGAYVTAIPLAAGESLASGAQQVSEKTSSTSALSNTPSTLQQENGSGAGADSAATASKPSSGSNSTTHPEGCSSSTPAVGLLPSTSSGSVQAVVTSTAGAQSSHVHPLPGQSSSASLDKPSVQPEKEKRKAKRIAKRDMPEAIKNKNINKTALMAAGGALKSWMLPNAGVPLRSDGANLHVVSVTAGAGGSGGAAGGTNVAEGGGDRAFGRTARVGPGTATVHRASKRIMLKDALFSLEQQPTLRNSALLYKWLSNVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.87
3 0.85
4 0.85
5 0.84
6 0.84
7 0.84
8 0.85
9 0.85
10 0.84
11 0.83
12 0.76
13 0.75
14 0.68
15 0.64
16 0.59
17 0.56
18 0.51
19 0.5
20 0.51
21 0.5
22 0.53
23 0.54
24 0.55
25 0.55
26 0.58
27 0.61
28 0.66
29 0.61
30 0.58
31 0.57
32 0.57
33 0.58
34 0.56
35 0.52
36 0.45
37 0.44
38 0.43
39 0.41
40 0.38
41 0.33
42 0.32
43 0.3
44 0.3
45 0.3
46 0.3
47 0.27
48 0.28
49 0.28
50 0.25
51 0.28
52 0.31
53 0.33
54 0.33
55 0.33
56 0.35
57 0.4
58 0.47
59 0.46
60 0.48
61 0.46
62 0.44
63 0.48
64 0.46
65 0.39
66 0.34
67 0.35
68 0.27
69 0.32
70 0.33
71 0.28
72 0.26
73 0.25
74 0.24
75 0.23
76 0.24
77 0.18
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.16
82 0.14
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.08
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.03
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.09
158 0.1
159 0.12
160 0.2
161 0.25
162 0.28
163 0.3
164 0.33
165 0.39
166 0.45
167 0.52
168 0.46
169 0.44
170 0.42
171 0.48
172 0.49
173 0.42
174 0.37
175 0.28
176 0.3
177 0.29
178 0.29
179 0.24
180 0.2
181 0.21
182 0.2
183 0.21
184 0.19
185 0.17
186 0.15
187 0.13
188 0.12
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.14
230 0.16
231 0.16
232 0.17
233 0.18
234 0.17
235 0.17
236 0.15
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.11
252 0.13
253 0.13
254 0.19
255 0.19
256 0.2
257 0.22
258 0.22
259 0.21
260 0.21
261 0.28
262 0.29
263 0.34
264 0.35
265 0.37
266 0.38
267 0.42
268 0.48
269 0.45
270 0.47
271 0.49
272 0.54
273 0.58
274 0.66
275 0.69
276 0.71
277 0.71
278 0.71
279 0.72
280 0.73
281 0.73
282 0.69
283 0.7
284 0.7
285 0.74
286 0.74
287 0.68
288 0.62
289 0.53
290 0.49
291 0.4
292 0.33
293 0.25
294 0.22
295 0.2
296 0.19
297 0.2
298 0.18
299 0.18
300 0.21
301 0.22
302 0.18
303 0.17
304 0.16
305 0.17
306 0.17
307 0.16
308 0.12
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.09
314 0.1
315 0.19
316 0.2
317 0.21
318 0.25
319 0.26
320 0.28
321 0.31
322 0.29
323 0.28
324 0.29
325 0.32
326 0.32
327 0.34
328 0.37
329 0.42
330 0.42
331 0.39
332 0.43
333 0.43
334 0.41
335 0.39
336 0.34
337 0.26
338 0.26
339 0.21
340 0.17
341 0.11
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.03
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.03
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.14
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.14
365 0.14
366 0.15
367 0.15
368 0.11
369 0.13
370 0.15
371 0.17
372 0.18
373 0.18
374 0.18
375 0.19
376 0.2
377 0.21
378 0.21
379 0.22
380 0.21
381 0.24
382 0.26
383 0.27
384 0.24
385 0.24
386 0.24
387 0.23
388 0.3
389 0.33
390 0.34
391 0.34
392 0.35
393 0.36
394 0.32
395 0.29
396 0.22
397 0.17
398 0.15
399 0.12
400 0.11
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.06
415 0.08
416 0.1
417 0.11
418 0.11
419 0.14
420 0.14
421 0.17
422 0.23
423 0.25
424 0.25
425 0.3
426 0.36
427 0.33
428 0.36
429 0.35
430 0.31
431 0.28
432 0.31
433 0.27
434 0.22
435 0.25
436 0.22
437 0.21
438 0.17
439 0.18
440 0.16
441 0.15
442 0.14
443 0.12
444 0.13
445 0.12
446 0.15
447 0.18
448 0.17
449 0.19
450 0.19
451 0.21
452 0.21
453 0.27
454 0.28
455 0.3
456 0.29
457 0.28
458 0.29
459 0.27
460 0.25
461 0.21
462 0.17
463 0.12
464 0.1
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.12
471 0.11
472 0.14
473 0.14
474 0.15
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.18
479 0.19
480 0.2
481 0.24
482 0.24
483 0.23
484 0.22
485 0.2
486 0.17
487 0.15
488 0.11
489 0.07
490 0.05
491 0.03
492 0.03
493 0.04
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.1
522 0.13
523 0.14
524 0.14
525 0.16
526 0.15
527 0.16
528 0.19
529 0.16
530 0.14
531 0.15
532 0.15
533 0.17
534 0.17
535 0.16
536 0.12
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.12
541 0.09
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.09
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.09
558 0.08
559 0.1
560 0.1
561 0.12
562 0.12
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.12
567 0.1
568 0.1
569 0.09
570 0.1
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.08
576 0.14
577 0.18
578 0.2
579 0.21
580 0.23
581 0.24
582 0.25
583 0.25
584 0.22
585 0.19
586 0.16
587 0.14
588 0.14
589 0.14
590 0.13
591 0.14
592 0.12
593 0.1
594 0.09
595 0.09
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.05
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.07
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.1
611 0.11
612 0.11
613 0.11
614 0.09
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.11
619 0.14
620 0.17
621 0.16
622 0.18
623 0.19
624 0.19
625 0.2
626 0.2
627 0.17
628 0.15
629 0.15
630 0.13
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.09
635 0.08
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.03
650 0.02
651 0.02
652 0.02
653 0.02
654 0.02
655 0.03
656 0.03
657 0.02
658 0.03
659 0.03
660 0.03
661 0.03
662 0.03
663 0.03
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.05
670 0.06
671 0.06
672 0.09
673 0.1
674 0.11
675 0.12
676 0.13
677 0.13
678 0.14
679 0.16
680 0.14
681 0.17
682 0.19
683 0.18
684 0.18
685 0.18
686 0.19
687 0.2
688 0.2
689 0.18
690 0.17
691 0.18
692 0.18
693 0.17
694 0.15
695 0.11
696 0.1
697 0.09
698 0.07
699 0.05
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.05
705 0.05
706 0.07
707 0.08
708 0.09
709 0.13
710 0.16
711 0.19
712 0.21
713 0.25
714 0.25
715 0.27
716 0.27
717 0.23
718 0.22
719 0.21
720 0.21
721 0.19
722 0.21
723 0.2
724 0.2
725 0.19
726 0.17
727 0.15
728 0.13
729 0.1
730 0.07
731 0.07
732 0.08
733 0.09
734 0.09
735 0.08
736 0.09
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.09
744 0.08
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.07
749 0.07
750 0.1
751 0.13
752 0.18
753 0.18
754 0.18
755 0.18
756 0.22
757 0.24
758 0.22
759 0.2
760 0.15
761 0.16
762 0.19
763 0.21
764 0.17
765 0.15
766 0.16
767 0.18
768 0.2
769 0.26
770 0.29
771 0.29
772 0.38
773 0.48
774 0.57
775 0.63
776 0.71
777 0.72
778 0.76
779 0.84
780 0.85
781 0.85
782 0.84
783 0.86
784 0.86
785 0.85
786 0.81
787 0.79
788 0.75
789 0.73
790 0.69
791 0.64
792 0.61
793 0.61
794 0.61
795 0.61
796 0.59
797 0.52
798 0.48
799 0.46
800 0.4
801 0.36
802 0.29
803 0.21
804 0.17
805 0.19
806 0.17
807 0.13
808 0.11
809 0.09
810 0.09
811 0.1
812 0.11
813 0.08
814 0.09
815 0.1
816 0.18
817 0.2
818 0.2
819 0.2
820 0.22
821 0.23
822 0.23
823 0.22
824 0.15
825 0.17
826 0.22
827 0.2
828 0.18
829 0.16
830 0.16
831 0.16
832 0.16
833 0.12
834 0.06
835 0.06
836 0.05
837 0.04
838 0.04
839 0.04
840 0.03
841 0.03
842 0.02
843 0.03
844 0.03
845 0.03
846 0.03
847 0.03
848 0.03
849 0.03
850 0.04
851 0.04
852 0.06
853 0.06
854 0.07
855 0.07
856 0.09
857 0.1
858 0.1
859 0.14
860 0.16
861 0.18
862 0.22
863 0.24
864 0.23
865 0.23
866 0.29
867 0.29
868 0.27
869 0.29
870 0.27
871 0.32
872 0.33
873 0.35
874 0.31
875 0.36
876 0.42
877 0.43
878 0.46
879 0.45
880 0.45
881 0.49
882 0.48
883 0.43
884 0.36
885 0.32
886 0.33
887 0.31
888 0.3
889 0.25
890 0.26
891 0.27
892 0.31
893 0.29
894 0.24
895 0.22
896 0.28
897 0.29
898 0.31
899 0.32
900 0.29