Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VSM8

Protein Details
Accession A0A1S8VSM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23RATTEQRRKLHQKELAQSRQNEHydrophilic
525-548WDELERKAEQHDRKRHDREQEQGDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
552-560RRAGKKGRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013953  FACT_Spt16  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040258  Spt16  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF08512  Rtt106  
PF08644  SPT16  
Amino Acid Sequences DRATTEQRRKLHQKELAQSRQNEGLSRYSENKDGKQKVQQAVVRRFESYRKESQLPRNIGELRILVDRRSESILLPIFGQSVPFHISTLKNVSKSDEQDFVLLRFNFVTPGQSVGKKEGPTPFEDPNATFVRALSYRSNDIGRFVEIYREISELKKEMQKREAERLEMADLVEQASLMEVKGRRPTRLPDVFVRPGLEGKRFPGDLEIHLNGLRYQSQLKSDQKIDILFSNVKHLFFQPCDGELIVLLHVNLKNPIMMGKKKTKDIQFYREVSDASFDETGNRRRRVNYGDEDELAQEQEERRKRLHLNREFQQFSERIGEMSKRKVLVDVPLRDVSFSGVPFRQLVILQPTTDCLVHLSDTPFLVIPVKDIEVAHLERVQFGLKNFDLVFVYKDFHRPVTHINTIPVNQVETVREWLDSSDIPFSEGPVNLSWPQIMKTINDDPKAFYEEAGGWSFLQIDGSDHGSSEEESESEFEMSGSASGVSGSDSDETSQGSDASGSGFSDSGSGSGSGSGEEDASGEDWDELERKAEQHDRKRHDREQEQGDDDHRRAGKKGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.82
3 0.82
4 0.8
5 0.76
6 0.7
7 0.68
8 0.61
9 0.53
10 0.45
11 0.42
12 0.37
13 0.39
14 0.4
15 0.37
16 0.43
17 0.45
18 0.5
19 0.54
20 0.57
21 0.58
22 0.62
23 0.67
24 0.65
25 0.69
26 0.65
27 0.65
28 0.68
29 0.7
30 0.62
31 0.56
32 0.53
33 0.52
34 0.56
35 0.53
36 0.52
37 0.51
38 0.56
39 0.62
40 0.69
41 0.72
42 0.69
43 0.65
44 0.63
45 0.59
46 0.53
47 0.47
48 0.38
49 0.3
50 0.31
51 0.3
52 0.23
53 0.25
54 0.25
55 0.25
56 0.28
57 0.26
58 0.19
59 0.25
60 0.27
61 0.23
62 0.23
63 0.21
64 0.18
65 0.17
66 0.18
67 0.11
68 0.12
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.16
73 0.17
74 0.2
75 0.28
76 0.3
77 0.3
78 0.3
79 0.35
80 0.38
81 0.41
82 0.4
83 0.36
84 0.32
85 0.32
86 0.33
87 0.29
88 0.3
89 0.26
90 0.23
91 0.2
92 0.19
93 0.18
94 0.17
95 0.18
96 0.11
97 0.16
98 0.18
99 0.2
100 0.22
101 0.25
102 0.3
103 0.28
104 0.32
105 0.34
106 0.33
107 0.35
108 0.38
109 0.35
110 0.34
111 0.35
112 0.32
113 0.31
114 0.31
115 0.27
116 0.23
117 0.2
118 0.22
119 0.21
120 0.23
121 0.22
122 0.22
123 0.24
124 0.26
125 0.29
126 0.24
127 0.26
128 0.24
129 0.21
130 0.2
131 0.18
132 0.19
133 0.18
134 0.19
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.19
140 0.17
141 0.2
142 0.24
143 0.28
144 0.32
145 0.38
146 0.44
147 0.47
148 0.55
149 0.54
150 0.5
151 0.46
152 0.43
153 0.37
154 0.3
155 0.25
156 0.16
157 0.13
158 0.11
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.08
166 0.09
167 0.12
168 0.2
169 0.22
170 0.24
171 0.27
172 0.33
173 0.38
174 0.44
175 0.45
176 0.43
177 0.49
178 0.5
179 0.48
180 0.44
181 0.35
182 0.32
183 0.3
184 0.28
185 0.21
186 0.2
187 0.22
188 0.21
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.19
193 0.23
194 0.21
195 0.19
196 0.19
197 0.19
198 0.16
199 0.15
200 0.14
201 0.1
202 0.12
203 0.12
204 0.15
205 0.22
206 0.26
207 0.29
208 0.3
209 0.31
210 0.3
211 0.29
212 0.27
213 0.21
214 0.2
215 0.18
216 0.16
217 0.21
218 0.21
219 0.2
220 0.2
221 0.21
222 0.2
223 0.18
224 0.21
225 0.15
226 0.14
227 0.15
228 0.14
229 0.12
230 0.1
231 0.1
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.11
243 0.13
244 0.16
245 0.21
246 0.29
247 0.32
248 0.36
249 0.42
250 0.43
251 0.49
252 0.51
253 0.53
254 0.52
255 0.51
256 0.5
257 0.45
258 0.4
259 0.3
260 0.26
261 0.19
262 0.14
263 0.12
264 0.1
265 0.11
266 0.15
267 0.23
268 0.28
269 0.31
270 0.3
271 0.31
272 0.35
273 0.37
274 0.4
275 0.38
276 0.36
277 0.36
278 0.34
279 0.33
280 0.3
281 0.25
282 0.18
283 0.12
284 0.08
285 0.08
286 0.14
287 0.18
288 0.2
289 0.21
290 0.26
291 0.32
292 0.4
293 0.5
294 0.52
295 0.55
296 0.6
297 0.67
298 0.62
299 0.56
300 0.52
301 0.42
302 0.34
303 0.31
304 0.24
305 0.16
306 0.17
307 0.21
308 0.19
309 0.22
310 0.23
311 0.2
312 0.2
313 0.21
314 0.21
315 0.24
316 0.29
317 0.28
318 0.3
319 0.31
320 0.31
321 0.3
322 0.29
323 0.23
324 0.16
325 0.14
326 0.13
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.12
334 0.14
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.13
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.1
352 0.11
353 0.09
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.14
365 0.13
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.12
370 0.16
371 0.14
372 0.17
373 0.16
374 0.17
375 0.17
376 0.16
377 0.17
378 0.12
379 0.14
380 0.12
381 0.17
382 0.17
383 0.19
384 0.19
385 0.19
386 0.25
387 0.31
388 0.35
389 0.33
390 0.34
391 0.34
392 0.34
393 0.35
394 0.29
395 0.22
396 0.17
397 0.17
398 0.16
399 0.15
400 0.17
401 0.15
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.14
406 0.13
407 0.13
408 0.13
409 0.12
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.16
414 0.16
415 0.16
416 0.14
417 0.17
418 0.16
419 0.17
420 0.16
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.17
425 0.14
426 0.2
427 0.28
428 0.33
429 0.36
430 0.35
431 0.34
432 0.36
433 0.4
434 0.34
435 0.25
436 0.21
437 0.19
438 0.22
439 0.21
440 0.19
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.11
445 0.11
446 0.08
447 0.07
448 0.08
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.12
457 0.08
458 0.09
459 0.1
460 0.11
461 0.1
462 0.1
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.06
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.09
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.09
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.11
516 0.13
517 0.13
518 0.2
519 0.29
520 0.38
521 0.46
522 0.56
523 0.63
524 0.72
525 0.81
526 0.82
527 0.84
528 0.82
529 0.8
530 0.8
531 0.79
532 0.72
533 0.66
534 0.64
535 0.6
536 0.53
537 0.51
538 0.45
539 0.4
540 0.4