Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VRB2

Protein Details
Accession A0A1S8VRB2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
268-299DLDTPITVSKPKRKRQRRKPKTSKDTLSNGSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-217IKKRKRSGEPNPLSVKRKRPLQSAAASLPKP
277-289KPKRKRQRRKPKT
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 12, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
Amino Acid Sequences MKLKRQKTNKRHMAVYLHSFGFREPYQLLIDGNFLQVARQTKKNLDVALPNLLNGQVRTMTTYCCYAELRKLGGEFRPTAATAKTFEKRRCVHQPAIAATDCLKEIVGDTNQFNYAVATQDQGLRAYLRSIPGVPLLYINKSVLILEPPSIATLKKVQEMEVAKTLPNANEIAVSTAKEAQILHVPIKKRKRSGEPNPLSVKRKRPLQSAAASLPKPKKQQLTSSSDAGASGSEPVVPLVSIPSTPTPEMATEMDSTSIEKADHDGHDLDTPITVSKPKRKRQRRKPKTSKDTLSNGSAIANETEESS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.67
3 0.61
4 0.52
5 0.46
6 0.42
7 0.36
8 0.33
9 0.26
10 0.23
11 0.18
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.21
16 0.16
17 0.18
18 0.15
19 0.15
20 0.13
21 0.11
22 0.1
23 0.14
24 0.2
25 0.22
26 0.27
27 0.31
28 0.35
29 0.41
30 0.45
31 0.44
32 0.4
33 0.41
34 0.38
35 0.42
36 0.38
37 0.31
38 0.28
39 0.26
40 0.24
41 0.19
42 0.18
43 0.11
44 0.11
45 0.15
46 0.15
47 0.16
48 0.16
49 0.19
50 0.17
51 0.18
52 0.2
53 0.18
54 0.24
55 0.25
56 0.25
57 0.24
58 0.25
59 0.25
60 0.27
61 0.29
62 0.24
63 0.22
64 0.22
65 0.21
66 0.22
67 0.2
68 0.18
69 0.17
70 0.22
71 0.27
72 0.32
73 0.35
74 0.43
75 0.44
76 0.51
77 0.58
78 0.58
79 0.57
80 0.55
81 0.57
82 0.51
83 0.52
84 0.44
85 0.35
86 0.29
87 0.24
88 0.2
89 0.14
90 0.11
91 0.06
92 0.07
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.07
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.2
146 0.22
147 0.23
148 0.21
149 0.21
150 0.17
151 0.18
152 0.19
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.1
164 0.09
165 0.1
166 0.09
167 0.08
168 0.12
169 0.13
170 0.16
171 0.18
172 0.21
173 0.28
174 0.38
175 0.42
176 0.44
177 0.5
178 0.57
179 0.64
180 0.71
181 0.75
182 0.71
183 0.73
184 0.75
185 0.74
186 0.69
187 0.65
188 0.63
189 0.57
190 0.61
191 0.57
192 0.56
193 0.56
194 0.57
195 0.56
196 0.52
197 0.5
198 0.47
199 0.44
200 0.44
201 0.44
202 0.43
203 0.44
204 0.44
205 0.48
206 0.46
207 0.55
208 0.56
209 0.59
210 0.57
211 0.54
212 0.5
213 0.42
214 0.37
215 0.28
216 0.2
217 0.12
218 0.09
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.1
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.18
237 0.16
238 0.16
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.11
249 0.14
250 0.15
251 0.17
252 0.17
253 0.18
254 0.2
255 0.2
256 0.18
257 0.14
258 0.14
259 0.12
260 0.12
261 0.17
262 0.22
263 0.31
264 0.41
265 0.51
266 0.61
267 0.72
268 0.82
269 0.88
270 0.92
271 0.94
272 0.95
273 0.97
274 0.97
275 0.97
276 0.96
277 0.94
278 0.91
279 0.88
280 0.82
281 0.74
282 0.64
283 0.53
284 0.43
285 0.35
286 0.28
287 0.2
288 0.16