FuNGI

A0A1S8VQJ0

Protein Details

Accession

A0A1S8VQJ0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MSQSSPPRRPRRRSEQPLETARVS	Hydrophilic
142-169	LQQSKSSQIRQRRSDKRVSKRASRHTSQ	Hydrophilic
740-761	TVSSRRPSVRGSRNRDRGSHRA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 8.5, mito 6, cyto 3.5, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR019354 SMG8/SMG9 IPR039177 SMG9
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF10220 Smg8_Smg9

Amino Acid Sequences

MSQSSPPRRPRRRSEQPLETARVSPTANRAASVVSTATGSSPNDREGHNKGGSSSQSSSRTPPAAPDSRAVRGSIVGGQATASMAASTAERSVAVAMASMSDAGDSERRQPAAAGRKLWVDPTAPSTPQSGGGSRSNLEGALQQSKSSQIRQRRSDKRVSKRASRHTSQDPEDHRDGRSLSQYPSGASKMALLNNPVILDRNATIEPSMLAPRHDRSGSLSRNVHADPPARSDLSTASVRSQTCKSKSPSPCAELSTPHYPVNASLPPSHSDLKAAGIGSPDSPTSPACSPTLDGPDRLTMLFPTLFSGPTSNSVKLLDENLQFHLEDAFKILSDYPGCFVIGVLGRAGVGKSTLLSSMTNSKVFPVQGHDRRSSLPETKAAVPNETCGVDLYVTPERVIFLDTQAVLPLQSSSTHARGSLYTHSGDARSQRSDPPVQTDSAKLSLFMVSVCHVILLVSDTHHDSELYRLIRNAESIRSTEASLSKSAAPMPPRQSSAPNIMHASSGQKPVSSLQPAPISTEIFWPHIALVYNKCKPEMLIPQSMCRSWKSFSRSFKNTDFNAFNLFSSTCLTERTVDFEKLKALRLQRQSAHDSSLADVSGTKNSTEDHDTADASIGNVYCLPYQAKPLSSIDLNLSLDELMSSSRGTIARFDVLVKQLRDILLGIPRLPTSTGTDSSHTSRHEPIGRHYMMSERDWIRSAARTWECIRKHDFSTGELYTGTASQPFSGAPLFSTGYDTVSSRRPSVRGSRNRDRGSHRASRNG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.92
2	0.91
3	0.9
4	0.89
5	0.84
6	0.76
7	0.67
8	0.57
9	0.5
10	0.41
11	0.34
12	0.32
13	0.34
14	0.32
15	0.3
16	0.29
17	0.27
18	0.26
19	0.25
20	0.19
21	0.11
22	0.11
23	0.11
24	0.11
25	0.13
26	0.14
27	0.17
28	0.19
29	0.22
30	0.23
31	0.25
32	0.3
33	0.33
34	0.39
35	0.37
36	0.36
37	0.34
38	0.38
39	0.39
40	0.39
41	0.36
42	0.36
43	0.37
44	0.39
45	0.41
46	0.41
47	0.42
48	0.36
49	0.39
50	0.4
51	0.42
52	0.43
53	0.45
54	0.44
55	0.46
56	0.47
57	0.41
58	0.33
59	0.27
60	0.27
61	0.24
62	0.21
63	0.16
64	0.14
65	0.13
66	0.13
67	0.12
68	0.1
69	0.07
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.07
77	0.07
78	0.07
79	0.08
80	0.08
81	0.07
82	0.07
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.06
87	0.05
88	0.05
89	0.05
90	0.06
91	0.1
92	0.11
93	0.17
94	0.21
95	0.22
96	0.22
97	0.24
98	0.3
99	0.37
100	0.41
101	0.38
102	0.35
103	0.39
104	0.39
105	0.39
106	0.33
107	0.25
108	0.21
109	0.25
110	0.27
111	0.24
112	0.25
113	0.25
114	0.24
115	0.26
116	0.27
117	0.22
118	0.22
119	0.25
120	0.26
121	0.24
122	0.25
123	0.21
124	0.19
125	0.18
126	0.17
127	0.16
128	0.2
129	0.2
130	0.19
131	0.19
132	0.26
133	0.28
134	0.31
135	0.36
136	0.39
137	0.48
138	0.58
139	0.68
140	0.72
141	0.76
142	0.8
143	0.83
144	0.84
145	0.85
146	0.83
147	0.83
148	0.82
149	0.86
150	0.84
151	0.79
152	0.75
153	0.74
154	0.74
155	0.68
156	0.67
157	0.61
158	0.6
159	0.6
160	0.55
161	0.46
162	0.41
163	0.39
164	0.33
165	0.34
166	0.3
167	0.26
168	0.29
169	0.28
170	0.26
171	0.28
172	0.26
173	0.2
174	0.17
175	0.18
176	0.17
177	0.19
178	0.2
179	0.19
180	0.18
181	0.19
182	0.19
183	0.16
184	0.15
185	0.12
186	0.12
187	0.11
188	0.13
189	0.13
190	0.13
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.14
196	0.11
197	0.13
198	0.15
199	0.17
200	0.21
201	0.21
202	0.19
203	0.23
204	0.32
205	0.34
206	0.38
207	0.38
208	0.35
209	0.38
210	0.38
211	0.34
212	0.29
213	0.29
214	0.24
215	0.27
216	0.29
217	0.26
218	0.25
219	0.24
220	0.21
221	0.21
222	0.21
223	0.17
224	0.16
225	0.2
226	0.2
227	0.23
228	0.27
229	0.3
230	0.32
231	0.38
232	0.41
233	0.46
234	0.52
235	0.57
236	0.59
237	0.55
238	0.53
239	0.5
240	0.47
241	0.4
242	0.4
243	0.36
244	0.33
245	0.29
246	0.27
247	0.24
248	0.23
249	0.24
250	0.21
251	0.18
252	0.17
253	0.19
254	0.2
255	0.24
256	0.25
257	0.2
258	0.19
259	0.17
260	0.17
261	0.16
262	0.14
263	0.12
264	0.11
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.11
273	0.11
274	0.13
275	0.12
276	0.13
277	0.14
278	0.16
279	0.22
280	0.2
281	0.19
282	0.19
283	0.19
284	0.19
285	0.18
286	0.16
287	0.09
288	0.1
289	0.1
290	0.08
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.09
297	0.14
298	0.17
299	0.15
300	0.15
301	0.16
302	0.16
303	0.16
304	0.17
305	0.17
306	0.16
307	0.17
308	0.17
309	0.17
310	0.17
311	0.16
312	0.16
313	0.11
314	0.09
315	0.1
316	0.08
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.04
337	0.04
338	0.03
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.06
344	0.07
345	0.12
346	0.14
347	0.14
348	0.14
349	0.14
350	0.15
351	0.15
352	0.14
353	0.15
354	0.22
355	0.27
356	0.32
357	0.32
358	0.32
359	0.33
360	0.35
361	0.34
362	0.29
363	0.24
364	0.23
365	0.25
366	0.27
367	0.31
368	0.29
369	0.27
370	0.23
371	0.22
372	0.2
373	0.17
374	0.14
375	0.09
376	0.09
377	0.07
378	0.07
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.08
388	0.06
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.04
398	0.05
399	0.07
400	0.1
401	0.12
402	0.12
403	0.12
404	0.13
405	0.13
406	0.15
407	0.15
408	0.15
409	0.13
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.15
414	0.17
415	0.17
416	0.17
417	0.18
418	0.2
419	0.24
420	0.27
421	0.27
422	0.29
423	0.28
424	0.26
425	0.26
426	0.25
427	0.22
428	0.21
429	0.2
430	0.14
431	0.13
432	0.12
433	0.11
434	0.1
435	0.08
436	0.06
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.07
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.09
453	0.14
454	0.14
455	0.14
456	0.14
457	0.16
458	0.17
459	0.19
460	0.18
461	0.15
462	0.15
463	0.16
464	0.17
465	0.16
466	0.16
467	0.16
468	0.17
469	0.16
470	0.16
471	0.16
472	0.14
473	0.14
474	0.15
475	0.16
476	0.17
477	0.21
478	0.26
479	0.27
480	0.29
481	0.3
482	0.32
483	0.32
484	0.38
485	0.34
486	0.32
487	0.3
488	0.28
489	0.26
490	0.24
491	0.25
492	0.19
493	0.21
494	0.19
495	0.18
496	0.18
497	0.19
498	0.24
499	0.23
500	0.21
501	0.2
502	0.23
503	0.24
504	0.26
505	0.25
506	0.22
507	0.19
508	0.22
509	0.19
510	0.17
511	0.17
512	0.15
513	0.13
514	0.14
515	0.15
516	0.13
517	0.18
518	0.25
519	0.29
520	0.29
521	0.3
522	0.28
523	0.28
524	0.32
525	0.35
526	0.32
527	0.36
528	0.36
529	0.41
530	0.43
531	0.44
532	0.39
533	0.32
534	0.29
535	0.23
536	0.29
537	0.32
538	0.37
539	0.45
540	0.52
541	0.55
542	0.58
543	0.62
544	0.63
545	0.57
546	0.56
547	0.49
548	0.41
549	0.41
550	0.35
551	0.29
552	0.24
553	0.22
554	0.16
555	0.16
556	0.16
557	0.12
558	0.13
559	0.14
560	0.15
561	0.15
562	0.2
563	0.22
564	0.25
565	0.25
566	0.25
567	0.29
568	0.28
569	0.31
570	0.3
571	0.31
572	0.36
573	0.42
574	0.47
575	0.47
576	0.51
577	0.54
578	0.51
579	0.49
580	0.42
581	0.36
582	0.31
583	0.27
584	0.21
585	0.15
586	0.14
587	0.12
588	0.14
589	0.14
590	0.13
591	0.12
592	0.13
593	0.16
594	0.2
595	0.19
596	0.19
597	0.2
598	0.2
599	0.2
600	0.2
601	0.17
602	0.13
603	0.14
604	0.1
605	0.08
606	0.09
607	0.1
608	0.09
609	0.11
610	0.13
611	0.12
612	0.18
613	0.21
614	0.21
615	0.23
616	0.25
617	0.27
618	0.25
619	0.26
620	0.22
621	0.23
622	0.22
623	0.19
624	0.18
625	0.14
626	0.13
627	0.11
628	0.09
629	0.05
630	0.06
631	0.06
632	0.05
633	0.09
634	0.1
635	0.11
636	0.13
637	0.15
638	0.17
639	0.17
640	0.19
641	0.2
642	0.24
643	0.3
644	0.28
645	0.27
646	0.28
647	0.28
648	0.27
649	0.23
650	0.21
651	0.2
652	0.21
653	0.2
654	0.19
655	0.19
656	0.19
657	0.19
658	0.18
659	0.19
660	0.22
661	0.25
662	0.26
663	0.28
664	0.31
665	0.33
666	0.36
667	0.32
668	0.31
669	0.31
670	0.36
671	0.4
672	0.39
673	0.43
674	0.49
675	0.47
676	0.45
677	0.42
678	0.4
679	0.38
680	0.37
681	0.38
682	0.3
683	0.32
684	0.32
685	0.33
686	0.29
687	0.3
688	0.3
689	0.32
690	0.32
691	0.35
692	0.38
693	0.46
694	0.46
695	0.48
696	0.53
697	0.48
698	0.48
699	0.5
700	0.47
701	0.41
702	0.45
703	0.39
704	0.34
705	0.29
706	0.26
707	0.19
708	0.18
709	0.16
710	0.12
711	0.11
712	0.11
713	0.11
714	0.11
715	0.12
716	0.12
717	0.12
718	0.1
719	0.13
720	0.14
721	0.14
722	0.18
723	0.16
724	0.16
725	0.18
726	0.18
727	0.18
728	0.24
729	0.27
730	0.28
731	0.32
732	0.33
733	0.38
734	0.48
735	0.56
736	0.59
737	0.65
738	0.72
739	0.78
740	0.82
741	0.82
742	0.8
743	0.79
744	0.78
745	0.78

A0A1S8VQJ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer