Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VN92

Protein Details
Accession A0A1S8VN92    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-140WSRSRSPSRSRSPRHIRRNRSRSRSSEHydrophilic
149-171VTESNSKRRRKSSRSPADKSRSSHydrophilic
225-251GTDISSSKINKKRQYRQYMNRQKGFNRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-175RRRRGESPPISRGWSRSRSPSRSRSPRHIRRNRSRSRSSERGRDRRPRVTESNSKRRRKSSRSPADKSRSSKGRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4.5, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MNLIEALEGDTWMAGRVPIGDIVQPDTEAEAVAVPIDHENISQGPAHPKVYHKFFMLFISSGTYPLRLFQLPLPINALTASYVRGSGQNDRSFRDEAVDTRRRRGESPPISRGWSRSRSPSRSRSPRHIRRNRSRSRSSERGRDRRPRVTESNSKRRRKSSRSPADKSRSSKGRRTSDVAGTSSESEPDVAEVGLVTEEMDDETKMQILMGFGGFDSTKGKKVPGTDISSSKINKKRQYRQYMNRQKGFNRALSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.07
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.12
9 0.15
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.13
14 0.12
15 0.1
16 0.09
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.05
21 0.05
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.13
31 0.17
32 0.2
33 0.23
34 0.23
35 0.28
36 0.34
37 0.39
38 0.4
39 0.36
40 0.35
41 0.34
42 0.35
43 0.32
44 0.25
45 0.19
46 0.2
47 0.18
48 0.18
49 0.17
50 0.15
51 0.12
52 0.13
53 0.15
54 0.11
55 0.13
56 0.13
57 0.23
58 0.22
59 0.23
60 0.25
61 0.22
62 0.22
63 0.2
64 0.19
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.1
72 0.12
73 0.18
74 0.24
75 0.29
76 0.3
77 0.32
78 0.35
79 0.34
80 0.32
81 0.28
82 0.22
83 0.19
84 0.27
85 0.33
86 0.31
87 0.35
88 0.39
89 0.38
90 0.38
91 0.41
92 0.43
93 0.44
94 0.51
95 0.5
96 0.48
97 0.49
98 0.48
99 0.47
100 0.43
101 0.39
102 0.33
103 0.38
104 0.44
105 0.48
106 0.55
107 0.59
108 0.63
109 0.67
110 0.7
111 0.71
112 0.74
113 0.77
114 0.81
115 0.82
116 0.82
117 0.83
118 0.9
119 0.88
120 0.86
121 0.83
122 0.8
123 0.79
124 0.79
125 0.73
126 0.72
127 0.72
128 0.74
129 0.75
130 0.77
131 0.75
132 0.74
133 0.74
134 0.7
135 0.67
136 0.65
137 0.66
138 0.66
139 0.7
140 0.71
141 0.74
142 0.73
143 0.75
144 0.77
145 0.76
146 0.77
147 0.78
148 0.79
149 0.81
150 0.82
151 0.83
152 0.82
153 0.8
154 0.74
155 0.71
156 0.69
157 0.65
158 0.65
159 0.65
160 0.65
161 0.62
162 0.63
163 0.59
164 0.56
165 0.54
166 0.48
167 0.4
168 0.33
169 0.31
170 0.26
171 0.22
172 0.15
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.11
204 0.12
205 0.16
206 0.17
207 0.19
208 0.2
209 0.23
210 0.31
211 0.35
212 0.4
213 0.41
214 0.44
215 0.46
216 0.49
217 0.49
218 0.5
219 0.5
220 0.52
221 0.56
222 0.64
223 0.71
224 0.75
225 0.84
226 0.86
227 0.88
228 0.91
229 0.93
230 0.93
231 0.89
232 0.85
233 0.78
234 0.77
235 0.72