FuNGI

A0A1S8VM92

Protein Details

Accession

A0A1S8VM92

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
414-437	SVETESTKKRKRKALKKVAKEFTA	Hydrophilic
582-601	LGLNQRRGGKKGKRGKKTRR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
421-431	KKRKRKALKKV
587-601	RRGGKKGKRGKKTRR

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 9.166, cyto_mito 7.833, mito 7, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010301 RRP1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05997 Nop52

Amino Acid Sequences

MPTVMVVSPTPASSNAATIPTTISSIGFGKRLAHTEKSIRDKAVKSLQEYLTANAKSLSDLEFLKLWKGLYYCFWMSDKPLIQQGLAQNLASTITRLPASEAIRYIHAFWKTLIKEWYGIDRLRLDKFYLLCRQFHLWTFTLLIENDWDKDLLDKVFTILEQGPLSINNTSVPDSLRYHTSEVMFEELAKAIKSADEEGKLPQHAFDRLTSSHFLGLEKSDNQQFLQHIVDDFLVLWTTKVDAEDELSLEDTETTTPPNASKIVQECMTPAQLVERLHQIALSNSALKRNRKTIHLFNKRLAKSLGLPYSDPTFSIGMTASTIPDLPVASSTLAAAKTTKKKSKQAKGSMVSLSKAVEVYSEADLWEEGQDNEEAKATSESSSSAAIDNSIEVVEADTAVAAEVSESVSTDSVSVETESTKKRKRKALKKVAKEFTAVDVDAPVEVISGCVDDLGDDDTVSKKSRIEAVEDVSDIQEGHQEVFEDPSGEAAAQSDVDTLDDTNVSPSGRKSVRWGTKLRVKTFFKLKPICASSEIKTPEHKPATKSALRKSPAKFDTMMFDDCVDGDMGAATPDQILDQIALGLNQRRGGKKGKRGKKTRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.17
3	0.18
4	0.18
5	0.17
6	0.18
7	0.16
8	0.16
9	0.14
10	0.12
11	0.12
12	0.15
13	0.17
14	0.16
15	0.17
16	0.19
17	0.22
18	0.28
19	0.31
20	0.32
21	0.36
22	0.43
23	0.51
24	0.56
25	0.58
26	0.56
27	0.58
28	0.56
29	0.58
30	0.6
31	0.56
32	0.51
33	0.54
34	0.51
35	0.51
36	0.5
37	0.44
38	0.43
39	0.38
40	0.34
41	0.27
42	0.26
43	0.2
44	0.2
45	0.19
46	0.14
47	0.15
48	0.16
49	0.17
50	0.18
51	0.19
52	0.19
53	0.17
54	0.18
55	0.18
56	0.18
57	0.19
58	0.25
59	0.24
60	0.25
61	0.26
62	0.24
63	0.27
64	0.33
65	0.32
66	0.28
67	0.32
68	0.3
69	0.29
70	0.31
71	0.31
72	0.3
73	0.28
74	0.25
75	0.2
76	0.19
77	0.2
78	0.16
79	0.14
80	0.08
81	0.1
82	0.1
83	0.1
84	0.13
85	0.17
86	0.19
87	0.21
88	0.23
89	0.22
90	0.24
91	0.25
92	0.25
93	0.25
94	0.24
95	0.22
96	0.21
97	0.29
98	0.27
99	0.31
100	0.31
101	0.27
102	0.28
103	0.29
104	0.35
105	0.3
106	0.3
107	0.28
108	0.3
109	0.32
110	0.33
111	0.33
112	0.28
113	0.27
114	0.29
115	0.32
116	0.36
117	0.35
118	0.34
119	0.35
120	0.38
121	0.36
122	0.38
123	0.36
124	0.28
125	0.26
126	0.27
127	0.24
128	0.23
129	0.2
130	0.17
131	0.15
132	0.15
133	0.14
134	0.13
135	0.13
136	0.1
137	0.11
138	0.13
139	0.11
140	0.11
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.12
146	0.1
147	0.12
148	0.12
149	0.12
150	0.12
151	0.12
152	0.14
153	0.11
154	0.1
155	0.09
156	0.11
157	0.12
158	0.12
159	0.13
160	0.14
161	0.17
162	0.18
163	0.2
164	0.21
165	0.21
166	0.23
167	0.23
168	0.2
169	0.19
170	0.2
171	0.16
172	0.14
173	0.13
174	0.11
175	0.11
176	0.1
177	0.09
178	0.06
179	0.07
180	0.08
181	0.1
182	0.12
183	0.13
184	0.14
185	0.16
186	0.19
187	0.19
188	0.18
189	0.17
190	0.16
191	0.17
192	0.18
193	0.17
194	0.18
195	0.18
196	0.21
197	0.21
198	0.2
199	0.19
200	0.18
201	0.18
202	0.14
203	0.15
204	0.15
205	0.14
206	0.16
207	0.17
208	0.17
209	0.17
210	0.18
211	0.17
212	0.16
213	0.16
214	0.14
215	0.12
216	0.12
217	0.12
218	0.09
219	0.09
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.12
249	0.14
250	0.16
251	0.16
252	0.16
253	0.16
254	0.16
255	0.16
256	0.12
257	0.1
258	0.09
259	0.11
260	0.12
261	0.12
262	0.13
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.13
267	0.1
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.11
272	0.17
273	0.21
274	0.25
275	0.28
276	0.33
277	0.35
278	0.38
279	0.44
280	0.47
281	0.54
282	0.6
283	0.6
284	0.57
285	0.64
286	0.59
287	0.56
288	0.46
289	0.36
290	0.29
291	0.32
292	0.3
293	0.22
294	0.22
295	0.21
296	0.23
297	0.21
298	0.18
299	0.14
300	0.11
301	0.09
302	0.1
303	0.09
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.13
324	0.21
325	0.28
326	0.35
327	0.4
328	0.49
329	0.59
330	0.67
331	0.72
332	0.74
333	0.76
334	0.72
335	0.7
336	0.65
337	0.56
338	0.47
339	0.37
340	0.28
341	0.19
342	0.15
343	0.11
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.05
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.08
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.08
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.07
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.02
389	0.02
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.12
405	0.17
406	0.25
407	0.34
408	0.4
409	0.47
410	0.56
411	0.66
412	0.73
413	0.78
414	0.82
415	0.84
416	0.88
417	0.91
418	0.88
419	0.79
420	0.7
421	0.6
422	0.52
423	0.45
424	0.34
425	0.24
426	0.17
427	0.15
428	0.13
429	0.12
430	0.07
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.03
440	0.04
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.06
445	0.08
446	0.1
447	0.13
448	0.13
449	0.12
450	0.15
451	0.21
452	0.21
453	0.25
454	0.27
455	0.29
456	0.3
457	0.29
458	0.28
459	0.22
460	0.21
461	0.15
462	0.12
463	0.11
464	0.09
465	0.1
466	0.1
467	0.11
468	0.11
469	0.13
470	0.13
471	0.11
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.07
478	0.07
479	0.06
480	0.07
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.08
490	0.1
491	0.1
492	0.11
493	0.11
494	0.19
495	0.21
496	0.22
497	0.27
498	0.37
499	0.46
500	0.51
501	0.55
502	0.56
503	0.63
504	0.71
505	0.7
506	0.69
507	0.65
508	0.66
509	0.71
510	0.69
511	0.69
512	0.68
513	0.65
514	0.65
515	0.62
516	0.58
517	0.53
518	0.51
519	0.44
520	0.46
521	0.47
522	0.4
523	0.43
524	0.42
525	0.47
526	0.51
527	0.53
528	0.48
529	0.52
530	0.59
531	0.6
532	0.63
533	0.62
534	0.63
535	0.63
536	0.67
537	0.63
538	0.64
539	0.6
540	0.57
541	0.5
542	0.42
543	0.45
544	0.42
545	0.39
546	0.3
547	0.28
548	0.24
549	0.22
550	0.21
551	0.14
552	0.1
553	0.08
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.06
559	0.05
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.08
568	0.08
569	0.12
570	0.17
571	0.19
572	0.23
573	0.29
574	0.31
575	0.36
576	0.45
577	0.51
578	0.57
579	0.65
580	0.71
581	0.76

A0A1S8VM92

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer