Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8W421

Protein Details
Accession A0A1S8W421    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-164IVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGQINSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-155FTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences PSVAVKSKSASSSDSSSSSDSSDSSDSDSDTDAHKSKNASKSVEKDTPTASSTTSTSNTPADVASISRKDTKRKADDEASSSENSFSKRSKPNGTQQRFQRVRAEEVTFADEKLKDNRFISKGGANVDYGFKAHMDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGQINSQEVHSIKFEYSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.27
4 0.26
5 0.24
6 0.21
7 0.17
8 0.17
9 0.16
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.14
14 0.14
15 0.15
16 0.13
17 0.13
18 0.17
19 0.17
20 0.17
21 0.19
22 0.22
23 0.29
24 0.35
25 0.38
26 0.39
27 0.44
28 0.49
29 0.54
30 0.56
31 0.51
32 0.45
33 0.42
34 0.39
35 0.34
36 0.28
37 0.21
38 0.17
39 0.16
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.2
55 0.23
56 0.28
57 0.35
58 0.43
59 0.46
60 0.48
61 0.52
62 0.5
63 0.51
64 0.48
65 0.44
66 0.38
67 0.31
68 0.28
69 0.23
70 0.19
71 0.17
72 0.16
73 0.14
74 0.18
75 0.24
76 0.28
77 0.34
78 0.38
79 0.46
80 0.55
81 0.59
82 0.59
83 0.59
84 0.65
85 0.61
86 0.58
87 0.56
88 0.47
89 0.46
90 0.43
91 0.4
92 0.3
93 0.29
94 0.3
95 0.23
96 0.2
97 0.18
98 0.15
99 0.15
100 0.2
101 0.21
102 0.21
103 0.22
104 0.28
105 0.27
106 0.28
107 0.29
108 0.26
109 0.25
110 0.25
111 0.25
112 0.19
113 0.18
114 0.18
115 0.16
116 0.13
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.12
125 0.16
126 0.16
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.2
131 0.24
132 0.31
133 0.38
134 0.49
135 0.59
136 0.69
137 0.78
138 0.81
139 0.88
140 0.89
141 0.88
142 0.87
143 0.85
144 0.85
145 0.85
146 0.8
147 0.72
148 0.64
149 0.61
150 0.51
151 0.44
152 0.37
153 0.28
154 0.27
155 0.25
156 0.24