Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8W9L0

Protein Details
Accession A0A1S8W9L0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
647-670GRFVRAVKRSKSKMMDRIRSMRLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-332SRTPRHAPTPPTSIRSPRTRRKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR018004  KilA/APSES_HTH  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MPVSPAADNASEMDVTLLEAVTSPNLRSSRVVPTNVKVENDDVKPVMLGIKSEGDQETAAITDPKDPTDTAPPSESASIASLEHALDATATTATETPSLPASIPIEEETLPIQATVPEPISATSTTVSKKMGKSYTSTPAKSTKSHSAKKAAAMASANTPTVRSACYSGVIVYEVKARNNVPVMRRKVDSYINATQILRAAGLPKPARTKVLEKDVSLGLHEKIQGGYAGFQGTWVPLKSAIALAEAYKVGDELRTLFEYDTKSGEAEKHVVARVKRSAPIATRREAGGDSSNDSSSEGDELDRPRRTPSRTPRHAPTPPTSIRSPRTRRKRLFSAETADEDDNTHRDREVITGGRTARTAAITKAAAYRSLSTPKRLIQEGRSEAATNNTSAHPVSTSSAGRGNTATSMATTASATDATRHRTTASRQGDDSSQLFQICGVTDTPQWRRGSSGKRTLYNACDAKWSSDRLASHSASPTGNQQMSISSDSDSVDSSSLSSPLGELDLEVGSTAWSLSLEVQGLKMKLRDMERGQQRLRKLLLEAKIDDRDIDRGYRKVIHAAKRSRSDDDGDIYGWEGDFSHDDRVPQQLEENDSGDACGDSYPRGFSEMESQNRCSRSAVLTASKVSRRFNNESERDRQHEQLAIGRFVRAVKRSKSKMMDRIRSMRLPLQPLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.07
5 0.05
6 0.06
7 0.07
8 0.09
9 0.1
10 0.11
11 0.17
12 0.18
13 0.2
14 0.22
15 0.25
16 0.33
17 0.38
18 0.45
19 0.43
20 0.47
21 0.53
22 0.53
23 0.52
24 0.43
25 0.41
26 0.41
27 0.38
28 0.37
29 0.3
30 0.27
31 0.25
32 0.24
33 0.22
34 0.16
35 0.15
36 0.13
37 0.16
38 0.16
39 0.19
40 0.19
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.11
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.15
50 0.16
51 0.17
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.29
56 0.32
57 0.29
58 0.31
59 0.3
60 0.31
61 0.31
62 0.28
63 0.2
64 0.18
65 0.15
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.13
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.15
93 0.14
94 0.15
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.2
115 0.23
116 0.25
117 0.31
118 0.35
119 0.34
120 0.37
121 0.41
122 0.48
123 0.5
124 0.49
125 0.45
126 0.48
127 0.49
128 0.48
129 0.49
130 0.49
131 0.51
132 0.57
133 0.6
134 0.61
135 0.6
136 0.61
137 0.62
138 0.52
139 0.45
140 0.39
141 0.34
142 0.29
143 0.28
144 0.24
145 0.17
146 0.17
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.11
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.14
158 0.12
159 0.1
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.19
164 0.19
165 0.21
166 0.26
167 0.29
168 0.3
169 0.37
170 0.43
171 0.44
172 0.45
173 0.44
174 0.43
175 0.44
176 0.41
177 0.4
178 0.39
179 0.37
180 0.38
181 0.36
182 0.32
183 0.28
184 0.24
185 0.17
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.18
190 0.19
191 0.21
192 0.26
193 0.27
194 0.3
195 0.32
196 0.37
197 0.36
198 0.45
199 0.44
200 0.39
201 0.41
202 0.39
203 0.35
204 0.3
205 0.26
206 0.16
207 0.15
208 0.15
209 0.13
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.13
246 0.14
247 0.15
248 0.15
249 0.13
250 0.12
251 0.13
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.16
258 0.19
259 0.19
260 0.23
261 0.26
262 0.26
263 0.28
264 0.27
265 0.29
266 0.3
267 0.39
268 0.38
269 0.35
270 0.34
271 0.32
272 0.31
273 0.27
274 0.24
275 0.18
276 0.15
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.14
281 0.15
282 0.13
283 0.09
284 0.09
285 0.07
286 0.06
287 0.09
288 0.11
289 0.17
290 0.18
291 0.18
292 0.22
293 0.27
294 0.32
295 0.39
296 0.47
297 0.52
298 0.59
299 0.64
300 0.65
301 0.68
302 0.68
303 0.63
304 0.57
305 0.54
306 0.48
307 0.47
308 0.44
309 0.4
310 0.41
311 0.46
312 0.5
313 0.51
314 0.6
315 0.67
316 0.71
317 0.73
318 0.77
319 0.74
320 0.72
321 0.66
322 0.61
323 0.52
324 0.48
325 0.43
326 0.34
327 0.27
328 0.21
329 0.18
330 0.14
331 0.13
332 0.12
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.16
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.16
345 0.13
346 0.12
347 0.12
348 0.09
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.14
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.14
358 0.22
359 0.23
360 0.23
361 0.26
362 0.28
363 0.3
364 0.31
365 0.31
366 0.27
367 0.34
368 0.34
369 0.33
370 0.3
371 0.27
372 0.25
373 0.26
374 0.23
375 0.15
376 0.13
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.1
385 0.11
386 0.11
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.14
391 0.14
392 0.11
393 0.12
394 0.1
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.09
405 0.11
406 0.16
407 0.17
408 0.17
409 0.18
410 0.21
411 0.25
412 0.32
413 0.36
414 0.33
415 0.33
416 0.34
417 0.34
418 0.34
419 0.31
420 0.23
421 0.18
422 0.15
423 0.15
424 0.13
425 0.12
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.17
432 0.2
433 0.26
434 0.26
435 0.25
436 0.29
437 0.34
438 0.41
439 0.44
440 0.5
441 0.5
442 0.52
443 0.55
444 0.55
445 0.51
446 0.51
447 0.44
448 0.34
449 0.34
450 0.32
451 0.32
452 0.31
453 0.31
454 0.24
455 0.26
456 0.26
457 0.25
458 0.3
459 0.27
460 0.27
461 0.26
462 0.27
463 0.23
464 0.23
465 0.23
466 0.23
467 0.22
468 0.2
469 0.18
470 0.17
471 0.19
472 0.21
473 0.17
474 0.13
475 0.13
476 0.13
477 0.14
478 0.13
479 0.11
480 0.09
481 0.08
482 0.09
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.03
501 0.03
502 0.04
503 0.05
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.09
508 0.12
509 0.13
510 0.14
511 0.15
512 0.15
513 0.19
514 0.22
515 0.28
516 0.3
517 0.38
518 0.45
519 0.53
520 0.57
521 0.57
522 0.57
523 0.57
524 0.54
525 0.46
526 0.41
527 0.4
528 0.41
529 0.41
530 0.4
531 0.39
532 0.39
533 0.37
534 0.35
535 0.29
536 0.26
537 0.23
538 0.26
539 0.25
540 0.24
541 0.27
542 0.31
543 0.31
544 0.36
545 0.42
546 0.45
547 0.51
548 0.58
549 0.63
550 0.67
551 0.7
552 0.66
553 0.61
554 0.56
555 0.5
556 0.45
557 0.38
558 0.3
559 0.26
560 0.23
561 0.2
562 0.15
563 0.12
564 0.08
565 0.08
566 0.1
567 0.11
568 0.15
569 0.16
570 0.17
571 0.18
572 0.24
573 0.24
574 0.22
575 0.25
576 0.24
577 0.28
578 0.29
579 0.29
580 0.24
581 0.23
582 0.22
583 0.18
584 0.14
585 0.1
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.1
590 0.11
591 0.11
592 0.14
593 0.14
594 0.14
595 0.23
596 0.3
597 0.37
598 0.4
599 0.44
600 0.47
601 0.49
602 0.49
603 0.41
604 0.36
605 0.31
606 0.32
607 0.34
608 0.33
609 0.35
610 0.38
611 0.43
612 0.45
613 0.46
614 0.45
615 0.47
616 0.5
617 0.54
618 0.57
619 0.62
620 0.65
621 0.68
622 0.72
623 0.71
624 0.69
625 0.67
626 0.62
627 0.55
628 0.51
629 0.46
630 0.44
631 0.42
632 0.4
633 0.36
634 0.33
635 0.31
636 0.3
637 0.34
638 0.34
639 0.37
640 0.42
641 0.52
642 0.57
643 0.65
644 0.71
645 0.74
646 0.78
647 0.81
648 0.82
649 0.8
650 0.82
651 0.8
652 0.75
653 0.71
654 0.68
655 0.64