Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VFE8

Protein Details
Accession A0A1S8VFE8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-402LEKVRRPARIALRRRKSDEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
217-221RKGRK
387-398RRPARIALRRRK
Subcellular Location(s) cyto 9.5, nucl 9, cyto_mito 8.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences DVFLGHVIYTGARSRNPHSNRAADLQLYLLPQFTIKHYYATIEVRIPSEYLTYRGNIAVRKSAVWGTDIYTDDSDIVAMIIHSGHYRPVDAPDPTPEERAHSSHRGDGYAGRNLGSKERSSSTVHRTSVVTQDLDVLSPISSHVLPLIAIPDLQTSSTSVLYPDHDLHVTLRILPKLLKYTGSTRYGLDSRGWGGSHDGESMAVEKVERVERGSVGRKGRKVFSKRWGELAKAVTKEEAAVIFDGGLIERHIDTEFDDDFGDLTVVFSEYGGEACIKYTPKIMLDWPSHMLNMLTEIKPPVRQLSSTTAMLPQSSVETPVSDTTATEMATPNSLKFSRQELKEMESWPYWRVKLRKFICFLETVDGVRHELRKDDVSGLTYRLEKVRRPARIALRRRKSDEPLTTLSSTVKAEHRDLHGSISASAPSSATTSTIEAVTPSVADKMMSEVALVASGILPNALSWTEAGLCVHAHGSKPLLVLPVHRVYWRKSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.4
3 0.44
4 0.51
5 0.53
6 0.56
7 0.57
8 0.58
9 0.56
10 0.46
11 0.42
12 0.35
13 0.3
14 0.25
15 0.21
16 0.16
17 0.12
18 0.13
19 0.13
20 0.15
21 0.19
22 0.18
23 0.2
24 0.21
25 0.23
26 0.26
27 0.28
28 0.28
29 0.26
30 0.27
31 0.26
32 0.26
33 0.24
34 0.2
35 0.21
36 0.19
37 0.18
38 0.19
39 0.18
40 0.19
41 0.21
42 0.24
43 0.23
44 0.25
45 0.29
46 0.28
47 0.28
48 0.29
49 0.28
50 0.26
51 0.24
52 0.22
53 0.17
54 0.21
55 0.22
56 0.22
57 0.2
58 0.19
59 0.18
60 0.17
61 0.14
62 0.09
63 0.07
64 0.05
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.12
75 0.16
76 0.21
77 0.22
78 0.23
79 0.26
80 0.32
81 0.32
82 0.34
83 0.3
84 0.29
85 0.31
86 0.33
87 0.34
88 0.34
89 0.35
90 0.37
91 0.38
92 0.34
93 0.32
94 0.34
95 0.32
96 0.31
97 0.29
98 0.25
99 0.26
100 0.26
101 0.3
102 0.27
103 0.24
104 0.22
105 0.24
106 0.27
107 0.29
108 0.35
109 0.38
110 0.42
111 0.42
112 0.4
113 0.39
114 0.38
115 0.39
116 0.36
117 0.28
118 0.2
119 0.22
120 0.2
121 0.19
122 0.17
123 0.11
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.16
156 0.15
157 0.15
158 0.17
159 0.15
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.19
165 0.18
166 0.18
167 0.23
168 0.28
169 0.31
170 0.3
171 0.26
172 0.29
173 0.28
174 0.27
175 0.23
176 0.18
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.16
200 0.21
201 0.24
202 0.3
203 0.35
204 0.38
205 0.39
206 0.43
207 0.48
208 0.49
209 0.51
210 0.53
211 0.58
212 0.55
213 0.6
214 0.57
215 0.49
216 0.47
217 0.44
218 0.38
219 0.29
220 0.29
221 0.21
222 0.19
223 0.18
224 0.14
225 0.1
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.14
270 0.19
271 0.2
272 0.22
273 0.23
274 0.22
275 0.21
276 0.2
277 0.18
278 0.11
279 0.13
280 0.14
281 0.12
282 0.12
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.17
287 0.17
288 0.15
289 0.15
290 0.18
291 0.23
292 0.26
293 0.25
294 0.25
295 0.23
296 0.22
297 0.21
298 0.18
299 0.12
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.23
324 0.28
325 0.29
326 0.34
327 0.32
328 0.36
329 0.39
330 0.39
331 0.35
332 0.29
333 0.29
334 0.27
335 0.28
336 0.26
337 0.29
338 0.34
339 0.37
340 0.45
341 0.49
342 0.54
343 0.54
344 0.55
345 0.51
346 0.47
347 0.42
348 0.36
349 0.32
350 0.24
351 0.22
352 0.2
353 0.19
354 0.18
355 0.2
356 0.16
357 0.17
358 0.19
359 0.2
360 0.21
361 0.23
362 0.21
363 0.22
364 0.22
365 0.22
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.22
370 0.24
371 0.25
372 0.33
373 0.4
374 0.44
375 0.48
376 0.55
377 0.6
378 0.67
379 0.75
380 0.76
381 0.78
382 0.8
383 0.81
384 0.79
385 0.76
386 0.75
387 0.72
388 0.68
389 0.62
390 0.59
391 0.54
392 0.48
393 0.41
394 0.34
395 0.27
396 0.24
397 0.23
398 0.22
399 0.24
400 0.28
401 0.31
402 0.33
403 0.33
404 0.33
405 0.32
406 0.29
407 0.27
408 0.24
409 0.2
410 0.16
411 0.16
412 0.13
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.11
432 0.12
433 0.12
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.06
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.08
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.13
458 0.13
459 0.13
460 0.15
461 0.17
462 0.19
463 0.19
464 0.2
465 0.21
466 0.2
467 0.23
468 0.28
469 0.31
470 0.31
471 0.34
472 0.37