Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VEM5

Protein Details
Accession A0A1S8VEM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
393-431RYLECIPKNKRRKGDPETPERHRKCSKRAWDAHVRSWRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-419KNKRRKGDPETPERHRKCSK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026502  SLBP1/SLBP2  
IPR029344  SLBP_RNA_bind  
IPR038294  SLBP_RNA_bind_sf  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF15247  SLBP_RNA_bind  
Amino Acid Sequences MMAHSTVCDHPRIGHDRTVDGHMDGSDTDTMDTHTECRPTAVLMSGLAHRQTSLQQQGDCPMVDAGPVLFLPKDKSSSNSRHPPMETQQLPEQPAYSYYDDGQSSAHEASRWSDVPPLPSQQQQQQQQQQQQQQYLDSAEPPLVGALHLPHLHPQQQPPPPASAGAGPDWIPFYSHSHLLLPSAPYYHDPHNNNNNNLPQMPHAYHHINASSDNLIPISCSPMECAPLLPTPHMLQPQMIPLSHHNQSQPLSVSMLSISHHQWNPHSYRRFNRAAGQTRLSASCKSSRSYQQQQVAFDINLASQDHPHYDYSYPITSTIYDGYCAGEDWHEVQSAADSIDTGASTEINSTVESLLTQSSRASSLPNEPSSEERRLEQRQKQIDYGKNTIGYLRYLECIPKNKRRKGDPETPERHRKCSKRAWDAHVRSWRRRLHQYDPPGDSSFDGEVDVGQHAVLELGHFSETSVNLSEMGLYDGVKRMSECALSRTDLPTSSSAFDTIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.39
4 0.42
5 0.43
6 0.36
7 0.31
8 0.28
9 0.22
10 0.21
11 0.17
12 0.17
13 0.14
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.12
18 0.13
19 0.14
20 0.14
21 0.16
22 0.18
23 0.18
24 0.2
25 0.19
26 0.19
27 0.19
28 0.19
29 0.16
30 0.15
31 0.17
32 0.17
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.15
37 0.16
38 0.18
39 0.24
40 0.3
41 0.32
42 0.32
43 0.34
44 0.37
45 0.38
46 0.35
47 0.28
48 0.2
49 0.16
50 0.14
51 0.13
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.13
59 0.15
60 0.18
61 0.18
62 0.22
63 0.3
64 0.38
65 0.47
66 0.53
67 0.54
68 0.56
69 0.58
70 0.61
71 0.58
72 0.6
73 0.52
74 0.47
75 0.5
76 0.48
77 0.48
78 0.42
79 0.36
80 0.27
81 0.26
82 0.26
83 0.21
84 0.18
85 0.17
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.18
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.18
98 0.18
99 0.16
100 0.21
101 0.22
102 0.25
103 0.27
104 0.3
105 0.28
106 0.32
107 0.35
108 0.36
109 0.43
110 0.47
111 0.53
112 0.58
113 0.62
114 0.66
115 0.7
116 0.7
117 0.67
118 0.63
119 0.55
120 0.47
121 0.41
122 0.35
123 0.28
124 0.21
125 0.17
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.14
138 0.17
139 0.22
140 0.24
141 0.28
142 0.33
143 0.39
144 0.41
145 0.39
146 0.39
147 0.35
148 0.33
149 0.29
150 0.22
151 0.18
152 0.15
153 0.15
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.1
159 0.1
160 0.13
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.14
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.13
173 0.16
174 0.19
175 0.25
176 0.26
177 0.34
178 0.44
179 0.49
180 0.49
181 0.5
182 0.48
183 0.42
184 0.4
185 0.33
186 0.24
187 0.22
188 0.21
189 0.18
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.19
195 0.16
196 0.15
197 0.16
198 0.14
199 0.12
200 0.11
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.12
215 0.13
216 0.12
217 0.13
218 0.12
219 0.15
220 0.16
221 0.14
222 0.12
223 0.12
224 0.15
225 0.15
226 0.14
227 0.13
228 0.14
229 0.18
230 0.19
231 0.2
232 0.17
233 0.19
234 0.2
235 0.2
236 0.19
237 0.15
238 0.14
239 0.12
240 0.12
241 0.09
242 0.09
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.13
247 0.14
248 0.15
249 0.16
250 0.21
251 0.26
252 0.32
253 0.36
254 0.36
255 0.41
256 0.47
257 0.5
258 0.46
259 0.48
260 0.49
261 0.51
262 0.51
263 0.47
264 0.41
265 0.39
266 0.39
267 0.34
268 0.26
269 0.2
270 0.22
271 0.22
272 0.22
273 0.26
274 0.32
275 0.38
276 0.46
277 0.51
278 0.52
279 0.53
280 0.52
281 0.5
282 0.44
283 0.35
284 0.27
285 0.2
286 0.13
287 0.11
288 0.11
289 0.09
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.14
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.19
351 0.24
352 0.26
353 0.26
354 0.27
355 0.32
356 0.35
357 0.38
358 0.32
359 0.28
360 0.34
361 0.41
362 0.49
363 0.51
364 0.55
365 0.59
366 0.61
367 0.65
368 0.66
369 0.64
370 0.61
371 0.59
372 0.52
373 0.45
374 0.42
375 0.38
376 0.31
377 0.25
378 0.2
379 0.17
380 0.16
381 0.16
382 0.2
383 0.23
384 0.31
385 0.39
386 0.47
387 0.56
388 0.63
389 0.7
390 0.75
391 0.8
392 0.79
393 0.81
394 0.8
395 0.81
396 0.81
397 0.82
398 0.84
399 0.77
400 0.77
401 0.76
402 0.74
403 0.72
404 0.74
405 0.76
406 0.76
407 0.81
408 0.81
409 0.82
410 0.81
411 0.81
412 0.81
413 0.78
414 0.75
415 0.75
416 0.74
417 0.71
418 0.75
419 0.72
420 0.71
421 0.73
422 0.75
423 0.75
424 0.72
425 0.69
426 0.61
427 0.55
428 0.47
429 0.4
430 0.3
431 0.22
432 0.17
433 0.12
434 0.1
435 0.11
436 0.11
437 0.08
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.09
450 0.1
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.13
456 0.13
457 0.11
458 0.12
459 0.1
460 0.09
461 0.11
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.15
467 0.17
468 0.22
469 0.22
470 0.22
471 0.25
472 0.27
473 0.29
474 0.3
475 0.3
476 0.26
477 0.28
478 0.27
479 0.26
480 0.26
481 0.25