Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8W711

Protein Details
Accession A0A1S8W711    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-175EAKTARKAESNKRKKPNPNDAATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-173GKRKTEAKTARKAESNKRKKPNPNDA
Subcellular Location(s) cyto 21, cyto_nucl 13.833, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
Amino Acid Sequences MINSNDETGFVGATATTTTTATTATTTNATGTTTTTEDIVSYPSSTHAGSIEDLSTPGENAQAAPSAQWPHDVHVEYSLKHNAYIYTGDNGTSYSYDPALSAWIPVFDEELIKAQQSAYGVDEPEAPDFRSAIDTDDIGDMDIQGSAGKRKTEAKTARKAESNKRKKPNPNDAATKKRINTAVYVTGLPHDATVDELVVVFSKCGLILEDPVSATPKIKLYSDAAGVFKGDALVIFFKEESVQLAVDLLDDTLLREDDGVRIHVQKAVFQEKPANDIQTNAAGTDSSSKTSVENSTGDKKSTSNIRQKMENRLGWYESEQAKNGPKANKVVVLRHMFTLKELDDDPTLLLDLKQDVREECERLGQVTNVVLFDLEEEGIMTIRFKEIEAAALCVAVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.08
7 0.09
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.13
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.12
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.11
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.14
38 0.13
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.21
56 0.21
57 0.22
58 0.27
59 0.28
60 0.25
61 0.3
62 0.32
63 0.27
64 0.31
65 0.33
66 0.28
67 0.27
68 0.27
69 0.2
70 0.2
71 0.21
72 0.18
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.12
80 0.11
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.08
134 0.1
135 0.1
136 0.12
137 0.19
138 0.21
139 0.31
140 0.4
141 0.45
142 0.53
143 0.58
144 0.6
145 0.6
146 0.64
147 0.65
148 0.66
149 0.69
150 0.69
151 0.73
152 0.78
153 0.81
154 0.85
155 0.85
156 0.82
157 0.78
158 0.78
159 0.76
160 0.76
161 0.72
162 0.67
163 0.56
164 0.52
165 0.48
166 0.39
167 0.34
168 0.29
169 0.27
170 0.23
171 0.23
172 0.18
173 0.16
174 0.16
175 0.13
176 0.1
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.15
213 0.14
214 0.12
215 0.1
216 0.08
217 0.06
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.12
249 0.13
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.2
254 0.25
255 0.24
256 0.24
257 0.3
258 0.27
259 0.32
260 0.31
261 0.29
262 0.22
263 0.23
264 0.23
265 0.21
266 0.2
267 0.16
268 0.14
269 0.11
270 0.11
271 0.15
272 0.15
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.17
278 0.18
279 0.15
280 0.17
281 0.2
282 0.27
283 0.29
284 0.29
285 0.28
286 0.26
287 0.28
288 0.36
289 0.4
290 0.42
291 0.48
292 0.5
293 0.58
294 0.62
295 0.68
296 0.67
297 0.62
298 0.56
299 0.52
300 0.51
301 0.43
302 0.41
303 0.38
304 0.34
305 0.33
306 0.29
307 0.3
308 0.34
309 0.37
310 0.41
311 0.38
312 0.38
313 0.4
314 0.42
315 0.45
316 0.43
317 0.43
318 0.45
319 0.46
320 0.44
321 0.42
322 0.41
323 0.34
324 0.32
325 0.31
326 0.23
327 0.2
328 0.19
329 0.19
330 0.18
331 0.19
332 0.18
333 0.14
334 0.14
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.12
339 0.15
340 0.17
341 0.18
342 0.19
343 0.24
344 0.29
345 0.3
346 0.27
347 0.3
348 0.29
349 0.29
350 0.31
351 0.25
352 0.23
353 0.22
354 0.23
355 0.16
356 0.16
357 0.13
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.12
373 0.12
374 0.19
375 0.19
376 0.21
377 0.2