FuNGI

A0A1S8VHC7

Protein Details

Accession

A0A1S8VHC7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
533-552	DEKFQEKRRLANRNRPRHVV	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11, cyto 10.5, nucl 8.5, cysk 4, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026847 VPS13 IPR031645 VPS13_DH-like IPR009543 VPS13_VAB
Pfam	View protein in Pfam PF06650 SHR-BD PF16909 VPS13_C

Amino Acid Sequences

MALSHVDDDAFELNIRLSSAKSDWSNGFSMTQLGTVYVKVGQIDSSVEHLIRVEITLVKASLNITLSKQDGRWPLKIENNTNVDISLWQQLSSTNYVIPRKTSLPYAWDHPSVGHKRLVIQVNGKEQIIDTSHLGKQKTFQYPVAGASRFGMLVIELIAEGPTTIVRLKPPPDADLAPPKHSLAISPSASNPPNEAKVLHTVQLRMEGIGISLISQDMQEIAYASARTLVFVWTDTEEVQALSFSLMWLQIDNQMYGCMNPIFVYPTVLPKEGKDEWQPVLMLSLCKSKDTSFGVDYYKWFTLLLQELSVDLDEDFLYALTNFLRFDNSDSASSEKDGAKDQLYDSTSSDSLVVRHDDSINLFFEKFLLHPMQVNMSFSRTSTAASAASARPQSSGIMSFILEVLTMTIGNIHDAPIRLNALELEHPIVSAPQLLDLITRFYSQEILGQVHKVIGAADFLGNPVGLFNNVASGVSDMFYEPLQGFEITRPQDFGLGVARGASSLVIKTVFGVTDTLSKFAGSIGKGLSVITMDEKFQEKRRLANRNRPRHVVYGMTSGAASLIRSVTSGVTGVVSQPLRGAQESGVEGFFKGLGKGLVGIVAKPMIGVMDLATNVSEGIKNTTTVFDTELDRQRLPRFIGKDKILQPYDHREALGQSWLKSIENGRYFHEHYIAHLEIRIDDLVAVVTESRVLMARIKKLRIEWDISFE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.1
4	0.1
5	0.13
6	0.14
7	0.2
8	0.22
9	0.26
10	0.27
11	0.3
12	0.32
13	0.29
14	0.28
15	0.22
16	0.23
17	0.18
18	0.17
19	0.13
20	0.13
21	0.12
22	0.11
23	0.12
24	0.11
25	0.12
26	0.12
27	0.12
28	0.11
29	0.11
30	0.12
31	0.12
32	0.14
33	0.15
34	0.14
35	0.14
36	0.14
37	0.14
38	0.13
39	0.12
40	0.1
41	0.11
42	0.12
43	0.14
44	0.13
45	0.13
46	0.13
47	0.13
48	0.15
49	0.14
50	0.15
51	0.15
52	0.18
53	0.2
54	0.22
55	0.22
56	0.26
57	0.34
58	0.37
59	0.41
60	0.42
61	0.46
62	0.52
63	0.59
64	0.58
65	0.57
66	0.56
67	0.53
68	0.48
69	0.42
70	0.34
71	0.27
72	0.23
73	0.21
74	0.17
75	0.15
76	0.15
77	0.17
78	0.2
79	0.22
80	0.21
81	0.18
82	0.23
83	0.27
84	0.28
85	0.29
86	0.3
87	0.3
88	0.31
89	0.33
90	0.3
91	0.3
92	0.31
93	0.35
94	0.35
95	0.34
96	0.32
97	0.29
98	0.36
99	0.38
100	0.38
101	0.36
102	0.31
103	0.33
104	0.4
105	0.44
106	0.38
107	0.4
108	0.42
109	0.46
110	0.47
111	0.44
112	0.36
113	0.31
114	0.29
115	0.24
116	0.21
117	0.16
118	0.18
119	0.21
120	0.25
121	0.26
122	0.23
123	0.26
124	0.33
125	0.39
126	0.38
127	0.37
128	0.38
129	0.39
130	0.42
131	0.43
132	0.35
133	0.28
134	0.25
135	0.24
136	0.19
137	0.17
138	0.13
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.05
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.04
147	0.04
148	0.04
149	0.04
150	0.04
151	0.06
152	0.07
153	0.1
154	0.15
155	0.18
156	0.24
157	0.26
158	0.27
159	0.3
160	0.31
161	0.33
162	0.38
163	0.39
164	0.36
165	0.35
166	0.33
167	0.31
168	0.29
169	0.25
170	0.19
171	0.23
172	0.21
173	0.21
174	0.23
175	0.26
176	0.27
177	0.27
178	0.25
179	0.22
180	0.23
181	0.22
182	0.21
183	0.18
184	0.23
185	0.24
186	0.26
187	0.24
188	0.23
189	0.23
190	0.27
191	0.25
192	0.18
193	0.17
194	0.13
195	0.11
196	0.1
197	0.09
198	0.05
199	0.05
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.05
208	0.05
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.1
213	0.1
214	0.11
215	0.1
216	0.11
217	0.09
218	0.1
219	0.12
220	0.09
221	0.1
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.1
238	0.11
239	0.11
240	0.1
241	0.11
242	0.11
243	0.11
244	0.12
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.09
250	0.09
251	0.11
252	0.1
253	0.15
254	0.17
255	0.18
256	0.18
257	0.16
258	0.22
259	0.21
260	0.24
261	0.23
262	0.24
263	0.24
264	0.25
265	0.25
266	0.18
267	0.19
268	0.16
269	0.13
270	0.11
271	0.15
272	0.14
273	0.14
274	0.15
275	0.14
276	0.18
277	0.2
278	0.22
279	0.18
280	0.2
281	0.22
282	0.22
283	0.22
284	0.22
285	0.19
286	0.16
287	0.14
288	0.12
289	0.13
290	0.14
291	0.14
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.07
298	0.04
299	0.05
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.09
314	0.12
315	0.13
316	0.14
317	0.14
318	0.16
319	0.15
320	0.15
321	0.15
322	0.13
323	0.12
324	0.13
325	0.13
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.15
330	0.15
331	0.15
332	0.14
333	0.14
334	0.14
335	0.13
336	0.13
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.1
346	0.11
347	0.11
348	0.1
349	0.1
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.13
360	0.13
361	0.14
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.11
366	0.12
367	0.09
368	0.1
369	0.09
370	0.09
371	0.08
372	0.08
373	0.1
374	0.09
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.11
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.06
390	0.04
391	0.04
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.04
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.07
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.08
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.06
417	0.07
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.11
432	0.11
433	0.12
434	0.12
435	0.13
436	0.13
437	0.12
438	0.12
439	0.09
440	0.07
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.05
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.06
465	0.06
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.09
473	0.15
474	0.15
475	0.16
476	0.16
477	0.15
478	0.17
479	0.16
480	0.16
481	0.13
482	0.12
483	0.11
484	0.11
485	0.1
486	0.08
487	0.09
488	0.08
489	0.05
490	0.05
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.13
501	0.14
502	0.14
503	0.14
504	0.14
505	0.13
506	0.14
507	0.17
508	0.1
509	0.12
510	0.11
511	0.12
512	0.12
513	0.12
514	0.11
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.08
520	0.1
521	0.14
522	0.17
523	0.24
524	0.32
525	0.31
526	0.39
527	0.47
528	0.56
529	0.61
530	0.7
531	0.73
532	0.76
533	0.81
534	0.78
535	0.74
536	0.68
537	0.62
538	0.56
539	0.48
540	0.42
541	0.37
542	0.31
543	0.26
544	0.21
545	0.18
546	0.14
547	0.11
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.07
560	0.12
561	0.12
562	0.11
563	0.11
564	0.13
565	0.14
566	0.15
567	0.15
568	0.11
569	0.14
570	0.15
571	0.16
572	0.15
573	0.13
574	0.13
575	0.12
576	0.12
577	0.09
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.08
582	0.09
583	0.08
584	0.11
585	0.11
586	0.11
587	0.11
588	0.11
589	0.1
590	0.09
591	0.09
592	0.06
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.06
597	0.06
598	0.07
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.08
604	0.07
605	0.13
606	0.13
607	0.14
608	0.15
609	0.17
610	0.18
611	0.17
612	0.19
613	0.16
614	0.18
615	0.25
616	0.32
617	0.34
618	0.35
619	0.38
620	0.39
621	0.43
622	0.44
623	0.44
624	0.42
625	0.46
626	0.53
627	0.53
628	0.58
629	0.59
630	0.64
631	0.59
632	0.55
633	0.54
634	0.55
635	0.57
636	0.5
637	0.44
638	0.36
639	0.35
640	0.34
641	0.37
642	0.3
643	0.25
644	0.26
645	0.27
646	0.26
647	0.27
648	0.29
649	0.3
650	0.33
651	0.34
652	0.35
653	0.4
654	0.43
655	0.43
656	0.43
657	0.34
658	0.31
659	0.37
660	0.34
661	0.28
662	0.27
663	0.25
664	0.2
665	0.23
666	0.2
667	0.13
668	0.11
669	0.11
670	0.09
671	0.08
672	0.08
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.07
678	0.08
679	0.09
680	0.15
681	0.21
682	0.3
683	0.37
684	0.41
685	0.45
686	0.48
687	0.55
688	0.55
689	0.56

A0A1S8VHC7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer