Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VPM4

Protein Details
Accession A0A1S8VPM4    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-35MKYIREKERIYKRKGDKIYKRRRRRISPFFCSDDFBasic
138-159ALPRNFVRTKAKSRSRAKLPSYHydrophilic
781-800QYSGNPTSARRRRSRGIEDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-25KERIYKRKGDKIYKRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006224  PsdUridine_synth_RluA-like_CS  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01129  PSI_RLU  
CDD cd02869  PseudoU_synth_RluA_like  
Amino Acid Sequences MKYIREKERIYKRKGDKIYKRRRRRISPFFCSDDFFSVSSLFLQLSDMFRLAAQRRSIASGVPIASRRTHRDSLSLTIQGVMPCRCMFSLAASPPSSLVSTPLWHSVSLSRHNYSDDQRHQLRCLHQQIQCRYASTRALPRNFVRTKAKSRSRAKLPSYSASPSPLDLVKGIYNPPESMSKRTAARWAKVAPALRSASTAPGQPHTLKTTHKWPESLSSSSAHHRFRSPNTRDPVPADSASIHPVDVRKTMYVKSFTVDSTCHLWTLLDFLSKVSPMSVPETRQKIKKNLVWVTGSAHARHVRIHPRGVLYTGDVVNVAYANKAYNPMIEFRDTEDAIKKLKMRVLYKDEHIFVIDKEHGLASQGGSKINLHLDKLIEHLEKDSSKMPRLVHRLDKNTSGAMIIARTKEAAVRVSAMFRESDQISRKYLALVVPPLHESANMQDGDQCEIVSGIVSNGREAPHERMELVEWFDKHKPPVSANGDPVRKAVTRVTLLQSKPVASVVCLQPLTGRKHQLRLHCAHALNAYIVGDYKYGQGCSKAFKGHVSDWMNIPMHLHLYQISIKNWYRDGSDLTVSASLPDYFRRTMMSAGLEPAVMRSIDTDALLYPTYKFMSFEDHMAKHRWQSPQPGDMVDDEGVLTISKRMPLLMDQVSDGVSRFLKSDKRDTITVGDVVVKSDKDGEMAVCLMEPAVEDVGPVGKYRLRRDGNSVLADIELAEGQTVDDFMGNLAHLKQDHCDYQGDMKRVDKKHAQASGIRIGGFYDESTGGVVLVDKELSRPQYSGNPTSARRRRSRGIEDDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.86
3 0.86
4 0.87
5 0.91
6 0.92
7 0.94
8 0.94
9 0.95
10 0.95
11 0.94
12 0.95
13 0.94
14 0.92
15 0.89
16 0.85
17 0.76
18 0.69
19 0.6
20 0.53
21 0.45
22 0.35
23 0.29
24 0.23
25 0.21
26 0.18
27 0.16
28 0.11
29 0.09
30 0.1
31 0.11
32 0.13
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.21
38 0.23
39 0.27
40 0.27
41 0.29
42 0.3
43 0.34
44 0.34
45 0.28
46 0.28
47 0.26
48 0.25
49 0.26
50 0.27
51 0.25
52 0.3
53 0.34
54 0.39
55 0.42
56 0.46
57 0.43
58 0.47
59 0.49
60 0.5
61 0.5
62 0.45
63 0.38
64 0.33
65 0.34
66 0.29
67 0.29
68 0.23
69 0.21
70 0.19
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.18
76 0.26
77 0.26
78 0.31
79 0.3
80 0.3
81 0.29
82 0.3
83 0.25
84 0.17
85 0.17
86 0.14
87 0.15
88 0.17
89 0.22
90 0.21
91 0.2
92 0.22
93 0.25
94 0.28
95 0.35
96 0.38
97 0.35
98 0.35
99 0.39
100 0.42
101 0.43
102 0.47
103 0.45
104 0.49
105 0.53
106 0.55
107 0.55
108 0.57
109 0.56
110 0.55
111 0.57
112 0.57
113 0.54
114 0.6
115 0.63
116 0.63
117 0.58
118 0.51
119 0.45
120 0.41
121 0.41
122 0.38
123 0.41
124 0.44
125 0.46
126 0.49
127 0.51
128 0.57
129 0.55
130 0.55
131 0.56
132 0.55
133 0.61
134 0.66
135 0.72
136 0.72
137 0.78
138 0.81
139 0.82
140 0.83
141 0.79
142 0.78
143 0.74
144 0.7
145 0.65
146 0.59
147 0.51
148 0.45
149 0.4
150 0.31
151 0.28
152 0.23
153 0.19
154 0.16
155 0.17
156 0.15
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.17
162 0.19
163 0.25
164 0.25
165 0.29
166 0.31
167 0.32
168 0.33
169 0.35
170 0.42
171 0.41
172 0.41
173 0.42
174 0.4
175 0.4
176 0.43
177 0.45
178 0.37
179 0.37
180 0.36
181 0.3
182 0.3
183 0.26
184 0.25
185 0.22
186 0.23
187 0.19
188 0.2
189 0.23
190 0.22
191 0.25
192 0.25
193 0.26
194 0.27
195 0.29
196 0.37
197 0.42
198 0.43
199 0.41
200 0.39
201 0.44
202 0.46
203 0.44
204 0.36
205 0.3
206 0.29
207 0.35
208 0.39
209 0.35
210 0.32
211 0.34
212 0.37
213 0.44
214 0.53
215 0.52
216 0.55
217 0.57
218 0.59
219 0.56
220 0.54
221 0.49
222 0.43
223 0.37
224 0.29
225 0.25
226 0.22
227 0.22
228 0.19
229 0.15
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.17
237 0.2
238 0.23
239 0.25
240 0.24
241 0.23
242 0.23
243 0.21
244 0.21
245 0.19
246 0.16
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.14
251 0.13
252 0.11
253 0.14
254 0.12
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.14
265 0.15
266 0.18
267 0.24
268 0.31
269 0.34
270 0.4
271 0.45
272 0.47
273 0.53
274 0.53
275 0.56
276 0.54
277 0.54
278 0.5
279 0.44
280 0.4
281 0.38
282 0.36
283 0.27
284 0.26
285 0.24
286 0.23
287 0.25
288 0.28
289 0.3
290 0.33
291 0.35
292 0.33
293 0.33
294 0.33
295 0.32
296 0.27
297 0.19
298 0.19
299 0.16
300 0.13
301 0.11
302 0.1
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.12
315 0.13
316 0.14
317 0.15
318 0.15
319 0.19
320 0.17
321 0.18
322 0.18
323 0.18
324 0.18
325 0.2
326 0.19
327 0.18
328 0.2
329 0.25
330 0.25
331 0.31
332 0.36
333 0.36
334 0.38
335 0.39
336 0.38
337 0.32
338 0.3
339 0.23
340 0.17
341 0.17
342 0.14
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.06
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.14
357 0.14
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.15
364 0.12
365 0.11
366 0.12
367 0.13
368 0.12
369 0.14
370 0.17
371 0.16
372 0.17
373 0.21
374 0.21
375 0.26
376 0.32
377 0.35
378 0.39
379 0.43
380 0.46
381 0.45
382 0.46
383 0.4
384 0.34
385 0.3
386 0.21
387 0.15
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.08
398 0.07
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.1
407 0.09
408 0.13
409 0.16
410 0.18
411 0.19
412 0.2
413 0.2
414 0.17
415 0.18
416 0.15
417 0.13
418 0.14
419 0.13
420 0.13
421 0.14
422 0.14
423 0.12
424 0.11
425 0.1
426 0.09
427 0.12
428 0.11
429 0.11
430 0.12
431 0.12
432 0.15
433 0.14
434 0.13
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.06
439 0.05
440 0.03
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.09
447 0.11
448 0.15
449 0.16
450 0.17
451 0.16
452 0.16
453 0.17
454 0.17
455 0.18
456 0.16
457 0.14
458 0.17
459 0.2
460 0.21
461 0.21
462 0.24
463 0.23
464 0.22
465 0.31
466 0.34
467 0.34
468 0.37
469 0.43
470 0.4
471 0.39
472 0.38
473 0.32
474 0.25
475 0.24
476 0.21
477 0.18
478 0.19
479 0.21
480 0.25
481 0.28
482 0.27
483 0.3
484 0.29
485 0.25
486 0.23
487 0.22
488 0.18
489 0.13
490 0.18
491 0.14
492 0.17
493 0.16
494 0.16
495 0.18
496 0.24
497 0.29
498 0.29
499 0.36
500 0.34
501 0.42
502 0.46
503 0.5
504 0.52
505 0.49
506 0.5
507 0.49
508 0.47
509 0.4
510 0.37
511 0.31
512 0.23
513 0.2
514 0.14
515 0.08
516 0.09
517 0.07
518 0.07
519 0.06
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.11
524 0.13
525 0.14
526 0.17
527 0.2
528 0.2
529 0.2
530 0.22
531 0.26
532 0.25
533 0.33
534 0.33
535 0.31
536 0.3
537 0.35
538 0.32
539 0.27
540 0.26
541 0.18
542 0.17
543 0.15
544 0.14
545 0.09
546 0.11
547 0.16
548 0.18
549 0.18
550 0.23
551 0.24
552 0.26
553 0.27
554 0.26
555 0.23
556 0.22
557 0.24
558 0.21
559 0.2
560 0.18
561 0.18
562 0.17
563 0.16
564 0.14
565 0.12
566 0.1
567 0.09
568 0.12
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.16
573 0.16
574 0.16
575 0.18
576 0.19
577 0.16
578 0.17
579 0.17
580 0.15
581 0.13
582 0.12
583 0.11
584 0.08
585 0.07
586 0.06
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.09
593 0.1
594 0.09
595 0.09
596 0.1
597 0.11
598 0.11
599 0.12
600 0.11
601 0.18
602 0.19
603 0.23
604 0.27
605 0.28
606 0.31
607 0.34
608 0.35
609 0.34
610 0.39
611 0.41
612 0.39
613 0.47
614 0.49
615 0.5
616 0.5
617 0.45
618 0.4
619 0.35
620 0.33
621 0.23
622 0.18
623 0.12
624 0.11
625 0.1
626 0.08
627 0.08
628 0.07
629 0.08
630 0.09
631 0.09
632 0.09
633 0.11
634 0.13
635 0.19
636 0.19
637 0.19
638 0.18
639 0.18
640 0.19
641 0.18
642 0.16
643 0.12
644 0.1
645 0.1
646 0.1
647 0.14
648 0.2
649 0.24
650 0.33
651 0.39
652 0.42
653 0.43
654 0.45
655 0.45
656 0.42
657 0.38
658 0.29
659 0.25
660 0.21
661 0.21
662 0.21
663 0.17
664 0.14
665 0.16
666 0.15
667 0.12
668 0.13
669 0.12
670 0.11
671 0.12
672 0.11
673 0.08
674 0.08
675 0.07
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.09
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.12
688 0.18
689 0.24
690 0.34
691 0.37
692 0.4
693 0.47
694 0.54
695 0.57
696 0.55
697 0.5
698 0.4
699 0.35
700 0.32
701 0.24
702 0.16
703 0.09
704 0.06
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.07
717 0.08
718 0.1
719 0.12
720 0.13
721 0.15
722 0.2
723 0.22
724 0.23
725 0.25
726 0.24
727 0.33
728 0.39
729 0.39
730 0.37
731 0.41
732 0.48
733 0.49
734 0.54
735 0.53
736 0.53
737 0.59
738 0.62
739 0.6
740 0.56
741 0.59
742 0.59
743 0.53
744 0.46
745 0.36
746 0.31
747 0.28
748 0.24
749 0.18
750 0.13
751 0.11
752 0.11
753 0.12
754 0.11
755 0.1
756 0.09
757 0.09
758 0.07
759 0.08
760 0.09
761 0.08
762 0.11
763 0.16
764 0.2
765 0.21
766 0.21
767 0.23
768 0.31
769 0.39
770 0.41
771 0.43
772 0.46
773 0.49
774 0.59
775 0.64
776 0.65
777 0.66
778 0.69
779 0.72
780 0.76
781 0.81