Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VMR5

Protein Details
Accession A0A1S8VMR5    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24AETIKSLNTHNKKNQKHATHITTHydrophilic
84-107QKETGSDRARSKRRQRSVSPTEEGHydrophilic
174-193IERPRFKKTKRENKNMPMEAHydrophilic
279-298EEKAKCQHLKREWRKAEDVRBasic
329-358GVDLDKVLEKRRKKNASREHRHIPAQRRARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-203ERPRFKKTKRENKNMPMEATSKKPVSRKR
336-358LEKRRKKNASREHRHIPAQRRAR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MAETIKSLNTHNKKNQKHATHITTTAAGTNSKAPQPSRASATKINRDSLAELSFKDLLSVRSSVGQKTFNKIWTKTSETGLLSQKETGSDRARSKRRQRSVSPTEEGHSDDPDHDLISGDDQKDTSDDDSGSDSDDDSLDDDSDEEDDNNGPRDQYGKRIEKGQPSDTALDKGIERPRFKKTKRENKNMPMEATSKKPVSRKRQVVEVVKKISRDPRFEGYTGKFNEDLFQRSYGFIGDYERSEIEMLKGEIRSESNPERRLELQRTMTSKTSRLSTNEEKAKCQHLKREWRKAEDVRVQQGKTPFFLKNSELKRRRLEDKFKSLSEKGVDLDKVLEKRRKKNASREHRHIPAQRRAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.83
3 0.8
4 0.82
5 0.82
6 0.79
7 0.75
8 0.7
9 0.62
10 0.54
11 0.46
12 0.4
13 0.31
14 0.24
15 0.2
16 0.23
17 0.24
18 0.25
19 0.29
20 0.27
21 0.34
22 0.4
23 0.42
24 0.44
25 0.44
26 0.46
27 0.51
28 0.59
29 0.61
30 0.58
31 0.57
32 0.52
33 0.5
34 0.46
35 0.41
36 0.35
37 0.26
38 0.22
39 0.23
40 0.23
41 0.21
42 0.2
43 0.18
44 0.16
45 0.18
46 0.18
47 0.15
48 0.2
49 0.22
50 0.23
51 0.25
52 0.31
53 0.3
54 0.36
55 0.4
56 0.41
57 0.46
58 0.45
59 0.47
60 0.46
61 0.51
62 0.47
63 0.45
64 0.43
65 0.38
66 0.42
67 0.42
68 0.37
69 0.31
70 0.3
71 0.28
72 0.25
73 0.26
74 0.26
75 0.24
76 0.29
77 0.35
78 0.44
79 0.52
80 0.6
81 0.69
82 0.74
83 0.79
84 0.81
85 0.81
86 0.82
87 0.82
88 0.8
89 0.74
90 0.64
91 0.56
92 0.49
93 0.44
94 0.34
95 0.26
96 0.19
97 0.16
98 0.16
99 0.14
100 0.13
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.11
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.11
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.12
141 0.12
142 0.19
143 0.27
144 0.3
145 0.31
146 0.38
147 0.42
148 0.46
149 0.5
150 0.44
151 0.39
152 0.36
153 0.37
154 0.31
155 0.28
156 0.21
157 0.17
158 0.15
159 0.17
160 0.2
161 0.24
162 0.25
163 0.27
164 0.34
165 0.43
166 0.45
167 0.51
168 0.56
169 0.62
170 0.7
171 0.77
172 0.79
173 0.78
174 0.86
175 0.78
176 0.69
177 0.61
178 0.53
179 0.45
180 0.39
181 0.34
182 0.25
183 0.26
184 0.31
185 0.36
186 0.43
187 0.51
188 0.56
189 0.54
190 0.6
191 0.64
192 0.68
193 0.67
194 0.64
195 0.6
196 0.53
197 0.52
198 0.47
199 0.48
200 0.44
201 0.4
202 0.38
203 0.38
204 0.4
205 0.4
206 0.43
207 0.37
208 0.39
209 0.36
210 0.34
211 0.28
212 0.25
213 0.28
214 0.24
215 0.25
216 0.19
217 0.2
218 0.18
219 0.17
220 0.18
221 0.15
222 0.13
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.1
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.15
240 0.15
241 0.18
242 0.25
243 0.3
244 0.35
245 0.35
246 0.38
247 0.41
248 0.47
249 0.46
250 0.45
251 0.44
252 0.45
253 0.47
254 0.47
255 0.48
256 0.43
257 0.41
258 0.37
259 0.34
260 0.32
261 0.32
262 0.37
263 0.4
264 0.46
265 0.51
266 0.51
267 0.51
268 0.51
269 0.56
270 0.56
271 0.53
272 0.54
273 0.55
274 0.65
275 0.72
276 0.8
277 0.78
278 0.77
279 0.81
280 0.78
281 0.78
282 0.76
283 0.72
284 0.7
285 0.69
286 0.63
287 0.59
288 0.59
289 0.51
290 0.44
291 0.41
292 0.34
293 0.3
294 0.33
295 0.33
296 0.36
297 0.43
298 0.51
299 0.54
300 0.59
301 0.65
302 0.68
303 0.73
304 0.74
305 0.76
306 0.75
307 0.79
308 0.78
309 0.73
310 0.74
311 0.66
312 0.62
313 0.54
314 0.46
315 0.37
316 0.36
317 0.33
318 0.26
319 0.29
320 0.29
321 0.32
322 0.38
323 0.45
324 0.48
325 0.57
326 0.67
327 0.74
328 0.77
329 0.82
330 0.84
331 0.88
332 0.9
333 0.89
334 0.88
335 0.85
336 0.86
337 0.83
338 0.82