Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8W4B0

Protein Details
Accession A0A1S8W4B0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
409-434RDEDEHRREMRKKRKQDAKNRLEGHHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-438HRREMRKKRKQDAKNRLEGHHGQKA
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPALFRWLSTKYPKVTSQCVEETPVTIGDQTIPVDASQPNPNGAEYDCLYLDMNGIIHPCCHPEDRPAPTTEDEMYIEIFKYIDRIMSIIRPRKVLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEEQLKNEAEDRIRKELEEKGHMAQDPVTKKQHFDSNCITPGTPFMDQLAICLRYYVAKKLNEDAGWDGLKVIISDASIPGEGEHKIMDYIRRQRNQPGYDPQTHHVLYGLDADLIMLALATHEPHFNILREDVFFKDGKQNGCFVCGQVGHMAAQCTGKPKEVIGKFGEQTTATVEKPYIFLHVGILREYLEIELAVPDLSFEWNLERAIDDWVFLCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDQLIKLWKQYLSTWGGFLTDSGDLDLKRVEEMIIELGKVEDVTFQKRRDEDEHRREMRKKRKQDAKNRLEGHHGQKAAAHAKRVHLDEAPEIMTRMADIESFPVRNVDAHQRGDANRMAIRKPSGTKQANVAAAEMLRNRLSAAKKSTTLPASTPSASLDQEATVKSIDAAASSHKRPAEENLTLSPTVTDVKDTMVIPASHDVVKAPLSKRMAIEESDHPINDAHILKDETASSVDTPMQSTETPDAAKIENVVADNVEVMEEEEEEEEEEVVIESMSVAASVPVHIPVPVLDTAKEAAPEVDSDDEAPEDNVRLWESGWKQRYYRKKFQVELDDSTFREAVVTAYVEGLCWVLKYYYQGVQSWKWFYPYHYAPFASDCGFISRLTISFEIGTPFLPVEQLMGVLPAASQSHIPPSLRPLMTEPTSEILDFYPLDFPIDLNGKKYTWQGVALLPFIDETRLLKAIVPIYDQFTEDETRRNTLGSEIVVVGGSHALFDDFCELYGRGVNNTEMVPIDPVKGGRFFGFVRPEDVFTVPGSRYSSPLVELGMPDIENNNSLSAKYQMPVTPDGYKYQAALLPGVQMPLRVLDESDRYAVRMGYNSRRGRGGRGGRGGSTYINRGGAQRVTGLGPSRGSDQQRPLQNNNNNNDRGNGYNNGRHDSRRGGYNDGGYHGDSSHSNNGNSFRGGYGNHNGQAGHYRGRGGNMHLHASRTSDQPYMGGGGYGSYSNNGRNQSYASHSGGYSVAEHSSGYSSDYSSHHRHQSAGNQQGMQYAPAGHHSYNGGQHSSYGQGYNQQPQEQHYSSNGYDAGQQQYSAQPVHDQPLTQGAALVTNLLSQLTGGQSAVNSAPPASAYQPTWSSHEPPAAYQQGNTAYPSYSSSSSGGGRGGYGGYQNSNPPQRPTGNLGWNRNVANGRRGASSAPPSRGARGRYGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.53
3 0.56
4 0.61
5 0.58
6 0.57
7 0.54
8 0.51
9 0.5
10 0.43
11 0.39
12 0.33
13 0.3
14 0.23
15 0.19
16 0.17
17 0.14
18 0.15
19 0.14
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.14
24 0.15
25 0.17
26 0.22
27 0.23
28 0.25
29 0.25
30 0.25
31 0.24
32 0.24
33 0.25
34 0.19
35 0.21
36 0.18
37 0.19
38 0.19
39 0.17
40 0.17
41 0.13
42 0.12
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.14
49 0.17
50 0.21
51 0.21
52 0.29
53 0.37
54 0.43
55 0.47
56 0.46
57 0.47
58 0.45
59 0.46
60 0.39
61 0.33
62 0.27
63 0.24
64 0.22
65 0.19
66 0.17
67 0.15
68 0.13
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.13
76 0.21
77 0.3
78 0.36
79 0.39
80 0.4
81 0.41
82 0.44
83 0.44
84 0.41
85 0.36
86 0.35
87 0.33
88 0.3
89 0.3
90 0.26
91 0.26
92 0.24
93 0.19
94 0.13
95 0.15
96 0.22
97 0.29
98 0.39
99 0.47
100 0.56
101 0.66
102 0.74
103 0.8
104 0.82
105 0.78
106 0.76
107 0.76
108 0.74
109 0.74
110 0.76
111 0.72
112 0.66
113 0.65
114 0.58
115 0.48
116 0.43
117 0.37
118 0.32
119 0.34
120 0.37
121 0.4
122 0.4
123 0.4
124 0.4
125 0.42
126 0.44
127 0.43
128 0.41
129 0.37
130 0.41
131 0.41
132 0.38
133 0.35
134 0.35
135 0.34
136 0.37
137 0.41
138 0.37
139 0.39
140 0.42
141 0.47
142 0.42
143 0.44
144 0.45
145 0.45
146 0.48
147 0.47
148 0.43
149 0.35
150 0.36
151 0.33
152 0.27
153 0.2
154 0.17
155 0.19
156 0.18
157 0.2
158 0.23
159 0.2
160 0.19
161 0.18
162 0.17
163 0.2
164 0.22
165 0.28
166 0.29
167 0.32
168 0.35
169 0.39
170 0.45
171 0.39
172 0.4
173 0.35
174 0.32
175 0.28
176 0.25
177 0.21
178 0.16
179 0.16
180 0.13
181 0.11
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.16
198 0.23
199 0.32
200 0.41
201 0.46
202 0.49
203 0.57
204 0.65
205 0.65
206 0.64
207 0.64
208 0.62
209 0.66
210 0.67
211 0.6
212 0.57
213 0.52
214 0.45
215 0.36
216 0.28
217 0.21
218 0.2
219 0.18
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.06
226 0.03
227 0.02
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.1
235 0.13
236 0.13
237 0.15
238 0.16
239 0.17
240 0.18
241 0.2
242 0.19
243 0.19
244 0.18
245 0.18
246 0.24
247 0.27
248 0.3
249 0.29
250 0.32
251 0.3
252 0.33
253 0.31
254 0.24
255 0.24
256 0.2
257 0.19
258 0.16
259 0.17
260 0.14
261 0.15
262 0.16
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.18
267 0.18
268 0.2
269 0.19
270 0.19
271 0.27
272 0.28
273 0.32
274 0.3
275 0.34
276 0.33
277 0.33
278 0.33
279 0.24
280 0.23
281 0.23
282 0.22
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.16
288 0.16
289 0.14
290 0.12
291 0.12
292 0.14
293 0.17
294 0.17
295 0.16
296 0.16
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.1
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.13
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.09
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.09
349 0.07
350 0.1
351 0.12
352 0.11
353 0.12
354 0.13
355 0.13
356 0.15
357 0.16
358 0.18
359 0.22
360 0.22
361 0.22
362 0.2
363 0.2
364 0.18
365 0.17
366 0.13
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.1
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.16
391 0.21
392 0.23
393 0.27
394 0.29
395 0.33
396 0.36
397 0.44
398 0.49
399 0.54
400 0.63
401 0.65
402 0.7
403 0.74
404 0.77
405 0.78
406 0.78
407 0.78
408 0.78
409 0.82
410 0.85
411 0.88
412 0.9
413 0.88
414 0.87
415 0.81
416 0.73
417 0.69
418 0.65
419 0.6
420 0.55
421 0.46
422 0.36
423 0.34
424 0.36
425 0.37
426 0.33
427 0.3
428 0.26
429 0.29
430 0.33
431 0.33
432 0.31
433 0.24
434 0.24
435 0.21
436 0.21
437 0.19
438 0.15
439 0.14
440 0.12
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.07
448 0.09
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.13
455 0.19
456 0.22
457 0.23
458 0.24
459 0.27
460 0.27
461 0.3
462 0.29
463 0.22
464 0.2
465 0.21
466 0.2
467 0.2
468 0.22
469 0.21
470 0.23
471 0.25
472 0.33
473 0.34
474 0.34
475 0.35
476 0.39
477 0.38
478 0.35
479 0.31
480 0.22
481 0.19
482 0.19
483 0.15
484 0.12
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.13
489 0.16
490 0.19
491 0.24
492 0.25
493 0.27
494 0.28
495 0.33
496 0.3
497 0.29
498 0.24
499 0.23
500 0.23
501 0.21
502 0.2
503 0.17
504 0.17
505 0.16
506 0.15
507 0.12
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.1
512 0.08
513 0.08
514 0.07
515 0.07
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.09
520 0.13
521 0.14
522 0.17
523 0.18
524 0.18
525 0.19
526 0.24
527 0.26
528 0.24
529 0.25
530 0.24
531 0.26
532 0.25
533 0.24
534 0.19
535 0.13
536 0.12
537 0.1
538 0.09
539 0.06
540 0.07
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.11
545 0.11
546 0.11
547 0.12
548 0.13
549 0.11
550 0.11
551 0.1
552 0.08
553 0.1
554 0.14
555 0.14
556 0.17
557 0.19
558 0.2
559 0.2
560 0.22
561 0.22
562 0.19
563 0.21
564 0.19
565 0.21
566 0.21
567 0.2
568 0.18
569 0.16
570 0.15
571 0.15
572 0.13
573 0.09
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.12
578 0.12
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.07
583 0.07
584 0.08
585 0.07
586 0.08
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.09
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.09
598 0.08
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.06
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.04
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.03
619 0.03
620 0.03
621 0.03
622 0.03
623 0.03
624 0.02
625 0.02
626 0.02
627 0.02
628 0.02
629 0.02
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.07
639 0.08
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.09
646 0.07
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.06
664 0.06
665 0.1
666 0.13
667 0.2
668 0.24
669 0.26
670 0.28
671 0.35
672 0.45
673 0.5
674 0.57
675 0.59
676 0.62
677 0.64
678 0.68
679 0.71
680 0.65
681 0.6
682 0.54
683 0.46
684 0.39
685 0.37
686 0.3
687 0.2
688 0.15
689 0.11
690 0.07
691 0.06
692 0.06
693 0.05
694 0.06
695 0.06
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.05
704 0.07
705 0.09
706 0.12
707 0.14
708 0.16
709 0.19
710 0.21
711 0.24
712 0.26
713 0.24
714 0.24
715 0.23
716 0.22
717 0.27
718 0.28
719 0.28
720 0.27
721 0.27
722 0.24
723 0.25
724 0.25
725 0.18
726 0.15
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.11
732 0.1
733 0.09
734 0.11
735 0.11
736 0.09
737 0.09
738 0.09
739 0.09
740 0.09
741 0.09
742 0.07
743 0.07
744 0.06
745 0.06
746 0.05
747 0.05
748 0.04
749 0.04
750 0.04
751 0.04
752 0.04
753 0.04
754 0.04
755 0.04
756 0.04
757 0.04
758 0.05
759 0.05
760 0.08
761 0.1
762 0.11
763 0.11
764 0.15
765 0.21
766 0.21
767 0.21
768 0.22
769 0.24
770 0.25
771 0.25
772 0.22
773 0.17
774 0.17
775 0.16
776 0.14
777 0.1
778 0.1
779 0.09
780 0.09
781 0.08
782 0.08
783 0.09
784 0.08
785 0.08
786 0.09
787 0.14
788 0.13
789 0.14
790 0.16
791 0.15
792 0.17
793 0.19
794 0.19
795 0.15
796 0.16
797 0.15
798 0.16
799 0.18
800 0.16
801 0.15
802 0.12
803 0.11
804 0.1
805 0.09
806 0.07
807 0.06
808 0.08
809 0.09
810 0.09
811 0.09
812 0.12
813 0.14
814 0.14
815 0.15
816 0.13
817 0.16
818 0.16
819 0.16
820 0.14
821 0.14
822 0.16
823 0.14
824 0.19
825 0.18
826 0.19
827 0.19
828 0.18
829 0.17
830 0.16
831 0.17
832 0.11
833 0.11
834 0.09
835 0.09
836 0.09
837 0.08
838 0.07
839 0.06
840 0.05
841 0.04
842 0.04
843 0.04
844 0.03
845 0.04
846 0.07
847 0.06
848 0.07
849 0.09
850 0.09
851 0.1
852 0.13
853 0.13
854 0.11
855 0.12
856 0.12
857 0.12
858 0.11
859 0.12
860 0.09
861 0.09
862 0.1
863 0.09
864 0.1
865 0.09
866 0.1
867 0.11
868 0.12
869 0.12
870 0.11
871 0.13
872 0.13
873 0.18
874 0.23
875 0.22
876 0.24
877 0.25
878 0.25
879 0.25
880 0.25
881 0.2
882 0.15
883 0.17
884 0.14
885 0.15
886 0.17
887 0.15
888 0.16
889 0.17
890 0.17
891 0.16
892 0.16
893 0.14
894 0.12
895 0.12
896 0.11
897 0.1
898 0.09
899 0.08
900 0.09
901 0.08
902 0.08
903 0.09
904 0.09
905 0.08
906 0.09
907 0.1
908 0.12
909 0.12
910 0.12
911 0.14
912 0.15
913 0.18
914 0.2
915 0.22
916 0.24
917 0.24
918 0.25
919 0.25
920 0.24
921 0.21
922 0.2
923 0.19
924 0.15
925 0.15
926 0.13
927 0.13
928 0.12
929 0.13
930 0.11
931 0.09
932 0.09
933 0.1
934 0.11
935 0.08
936 0.09
937 0.1
938 0.13
939 0.14
940 0.16
941 0.15
942 0.14
943 0.15
944 0.15
945 0.14
946 0.16
947 0.2
948 0.26
949 0.36
950 0.38
951 0.39
952 0.44
953 0.44
954 0.45
955 0.49
956 0.49
957 0.47
958 0.51
959 0.51
960 0.46
961 0.46
962 0.42
963 0.35
964 0.29
965 0.24
966 0.19
967 0.19
968 0.19
969 0.19
970 0.21
971 0.19
972 0.17
973 0.15
974 0.15
975 0.14
976 0.15
977 0.16
978 0.15
979 0.15
980 0.15
981 0.18
982 0.22
983 0.26
984 0.29
985 0.34
986 0.39
987 0.45
988 0.5
989 0.52
990 0.57
991 0.6
992 0.62
993 0.62
994 0.64
995 0.59
996 0.54
997 0.5
998 0.43
999 0.38
1000 0.34
1001 0.33
1002 0.3
1003 0.32
1004 0.33
1005 0.36
1006 0.35
1007 0.34
1008 0.34
1009 0.35
1010 0.33
1011 0.36
1012 0.37
1013 0.37
1014 0.38
1015 0.41
1016 0.38
1017 0.34
1018 0.33
1019 0.26
1020 0.24
1021 0.19
1022 0.17
1023 0.14
1024 0.17
1025 0.22
1026 0.24
1027 0.24
1028 0.26
1029 0.29
1030 0.3
1031 0.29
1032 0.26
1033 0.19
1034 0.18
1035 0.19
1036 0.21
1037 0.24
1038 0.26
1039 0.27
1040 0.27
1041 0.26
1042 0.25
1043 0.3
1044 0.28
1045 0.26
1046 0.22
1047 0.24
1048 0.24
1049 0.27
1050 0.28
1051 0.25
1052 0.3
1053 0.28
1054 0.33
1055 0.31
1056 0.32
1057 0.3
1058 0.32
1059 0.31
1060 0.26
1061 0.27
1062 0.23
1063 0.22
1064 0.21
1065 0.21
1066 0.19
1067 0.16
1068 0.13
1069 0.09
1070 0.08
1071 0.09
1072 0.09
1073 0.08
1074 0.08
1075 0.09
1076 0.12
1077 0.17
1078 0.2
1079 0.2
1080 0.21
1081 0.22
1082 0.24
1083 0.29
1084 0.31
1085 0.28
1086 0.27
1087 0.26
1088 0.26
1089 0.25
1090 0.23
1091 0.18
1092 0.14
1093 0.12
1094 0.1
1095 0.1
1096 0.1
1097 0.11
1098 0.1
1099 0.11
1100 0.1
1101 0.1
1102 0.13
1103 0.16
1104 0.21
1105 0.26
1106 0.32
1107 0.38
1108 0.38
1109 0.4
1110 0.42
1111 0.49
1112 0.53
1113 0.54
1114 0.52
1115 0.46
1116 0.45
1117 0.46
1118 0.41
1119 0.32
1120 0.23
1121 0.16
1122 0.13
1123 0.17
1124 0.2
1125 0.16
1126 0.17
1127 0.19
1128 0.21
1129 0.26
1130 0.28
1131 0.25
1132 0.22
1133 0.23
1134 0.23
1135 0.24
1136 0.22
1137 0.18
1138 0.15
1139 0.22
1140 0.25
1141 0.32
1142 0.35
1143 0.35
1144 0.35
1145 0.37
1146 0.46
1147 0.39
1148 0.38
1149 0.33
1150 0.34
1151 0.31
1152 0.33
1153 0.29
1154 0.21
1155 0.24
1156 0.25
1157 0.27
1158 0.22
1159 0.22
1160 0.2
1161 0.23
1162 0.25
1163 0.22
1164 0.19
1165 0.19
1166 0.2
1167 0.25
1168 0.25
1169 0.22
1170 0.21
1171 0.27
1172 0.28
1173 0.23
1174 0.22
1175 0.17
1176 0.18
1177 0.17
1178 0.17
1179 0.09
1180 0.09
1181 0.09
1182 0.08
1183 0.07
1184 0.05
1185 0.07
1186 0.07
1187 0.08
1188 0.08
1189 0.08
1190 0.08
1191 0.1
1192 0.11
1193 0.11
1194 0.11
1195 0.1
1196 0.1
1197 0.11
1198 0.13
1199 0.14
1200 0.17
1201 0.16
1202 0.21
1203 0.24
1204 0.26
1205 0.31
1206 0.33
1207 0.34
1208 0.35
1209 0.39
1210 0.36
1211 0.35
1212 0.41
1213 0.42
1214 0.39
1215 0.34
1216 0.35
1217 0.34
1218 0.34
1219 0.34
1220 0.27
1221 0.21
1222 0.21
1223 0.24
1224 0.23
1225 0.19
1226 0.2
1227 0.2
1228 0.21
1229 0.22
1230 0.23
1231 0.21
1232 0.17
1233 0.16
1234 0.14
1235 0.14
1236 0.12
1237 0.13
1238 0.14
1239 0.15
1240 0.17
1241 0.22
1242 0.29
1243 0.37
1244 0.39
1245 0.41
1246 0.46
1247 0.47
1248 0.5
1249 0.53
1250 0.53
1251 0.55
1252 0.6
1253 0.63
1254 0.62
1255 0.63
1256 0.59
1257 0.57
1258 0.55
1259 0.49
1260 0.47
1261 0.46
1262 0.42
1263 0.39
1264 0.4
1265 0.36
1266 0.37
1267 0.43
1268 0.43
1269 0.41
1270 0.46
1271 0.46
1272 0.51
1273 0.55
1274 0.52