FuNGI

A0A1S8VY42

Protein Details

Accession

A0A1S8VY42

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
627-652	IARELEKQKEHRSKKRARTSFANVGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
633-643	KQKEHRSKKRA

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MNNNAFAAPTAPATGSVGSTGSAEQLQNPLYQHALQQVVSQLLLQGFSPAQAQAQAHIYVQQNVQQLVAQQQQQYQQQHQQQPTQQQPYNGTLPSTAPDIQKQQQQQQQQQQQQQQQIPPAIPPSTYETHRLIAAGAGVMPHHIMKVPSPKFDLRSFKPPVRMARQDPYKIRQEQYRLDSIRQGKEFKPAVHPTNPDGTPVPSGINSAIDTTKVAPFGNAAKQKQNLFKKKTRTYYLSRDHEDTGNSDLFGPDADGILASVNARHGDPDRHPWVLQDDEDQYYTGNLEGSQGSNYMLFVFVNGGFKVIPASKFYKFMPRMTYRTLTADEAEEQMKAKPRSKVSSHSDRWVMRNKEIADGEKPLSLMQKLRTNMADGNESKDGLMKIKREAEPGLDYTEEFADDEEINFGIDDADDAREASRRMFGEDRANQRFEDEDDVDAELEKLHKGKVAKKIAKSLLKHEKNDVYDMDEDNPYASDEEEEEDPGEEEGRKDDATAQQQSLAAKREADLIMKIRRDVAIAPTKPLTQRSGVNSGSQSPLASSPISANSQSLPIPSTLTRTASNTAVDPNNGGKSRSKSGGQSGSPSSTGSISSSSESKRRRESSTPIGSSGKLSPPPPPAPAQVIARELEKQKEHRSKKRARTSFANVGDTPSSPSSQPGQSGQPQRQPTPRSSSQPSTISSTSPNSQSYRQHTPRSGSYSSAVSSTSPIPGSSPPRSGGGDRTGGALLTDEDIIRVIKAKNGAVITVKEIVAQVRHFLQSNPANKDLLRQIMRRVIVHDKETGVVTLKDQYRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.12
3	0.11
4	0.11
5	0.1
6	0.1
7	0.1
8	0.1
9	0.12
10	0.12
11	0.12
12	0.16
13	0.17
14	0.19
15	0.2
16	0.2
17	0.2
18	0.21
19	0.21
20	0.23
21	0.25
22	0.22
23	0.23
24	0.24
25	0.23
26	0.22
27	0.2
28	0.16
29	0.14
30	0.14
31	0.12
32	0.11
33	0.1
34	0.11
35	0.12
36	0.1
37	0.1
38	0.13
39	0.14
40	0.14
41	0.18
42	0.18
43	0.17
44	0.23
45	0.24
46	0.24
47	0.25
48	0.28
49	0.28
50	0.27
51	0.27
52	0.22
53	0.22
54	0.25
55	0.29
56	0.27
57	0.26
58	0.3
59	0.35
60	0.42
61	0.45
62	0.45
63	0.49
64	0.55
65	0.61
66	0.63
67	0.64
68	0.63
69	0.68
70	0.71
71	0.71
72	0.64
73	0.6
74	0.6
75	0.57
76	0.55
77	0.46
78	0.37
79	0.29
80	0.27
81	0.25
82	0.24
83	0.22
84	0.2
85	0.24
86	0.29
87	0.33
88	0.39
89	0.43
90	0.48
91	0.51
92	0.58
93	0.64
94	0.67
95	0.72
96	0.74
97	0.77
98	0.77
99	0.77
100	0.76
101	0.73
102	0.66
103	0.62
104	0.57
105	0.49
106	0.42
107	0.39
108	0.32
109	0.25
110	0.24
111	0.25
112	0.25
113	0.27
114	0.29
115	0.28
116	0.29
117	0.29
118	0.27
119	0.2
120	0.17
121	0.15
122	0.11
123	0.08
124	0.07
125	0.06
126	0.06
127	0.07
128	0.06
129	0.06
130	0.07
131	0.08
132	0.13
133	0.23
134	0.26
135	0.29
136	0.34
137	0.37
138	0.4
139	0.47
140	0.51
141	0.46
142	0.52
143	0.56
144	0.56
145	0.6
146	0.61
147	0.63
148	0.63
149	0.65
150	0.62
151	0.65
152	0.68
153	0.68
154	0.69
155	0.66
156	0.66
157	0.64
158	0.61
159	0.58
160	0.56
161	0.56
162	0.56
163	0.59
164	0.53
165	0.49
166	0.53
167	0.52
168	0.53
169	0.49
170	0.48
171	0.4
172	0.46
173	0.48
174	0.43
175	0.45
176	0.44
177	0.46
178	0.48
179	0.49
180	0.43
181	0.47
182	0.45
183	0.38
184	0.33
185	0.29
186	0.25
187	0.23
188	0.21
189	0.14
190	0.15
191	0.13
192	0.13
193	0.11
194	0.11
195	0.11
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.1
203	0.11
204	0.15
205	0.22
206	0.27
207	0.28
208	0.32
209	0.37
210	0.42
211	0.49
212	0.56
213	0.58
214	0.6
215	0.65
216	0.69
217	0.74
218	0.77
219	0.76
220	0.72
221	0.69
222	0.71
223	0.74
224	0.71
225	0.66
226	0.61
227	0.56
228	0.51
229	0.44
230	0.36
231	0.29
232	0.22
233	0.19
234	0.16
235	0.13
236	0.11
237	0.1
238	0.09
239	0.05
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.05
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.1
253	0.14
254	0.17
255	0.25
256	0.28
257	0.29
258	0.29
259	0.29
260	0.3
261	0.28
262	0.26
263	0.21
264	0.19
265	0.19
266	0.19
267	0.18
268	0.14
269	0.12
270	0.12
271	0.09
272	0.06
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.1
295	0.1
296	0.12
297	0.16
298	0.17
299	0.19
300	0.2
301	0.29
302	0.29
303	0.32
304	0.37
305	0.38
306	0.41
307	0.43
308	0.45
309	0.36
310	0.36
311	0.35
312	0.27
313	0.23
314	0.2
315	0.16
316	0.15
317	0.14
318	0.11
319	0.1
320	0.11
321	0.18
322	0.2
323	0.23
324	0.27
325	0.31
326	0.37
327	0.39
328	0.46
329	0.46
330	0.54
331	0.52
332	0.51
333	0.53
334	0.49
335	0.5
336	0.51
337	0.47
338	0.38
339	0.41
340	0.37
341	0.36
342	0.35
343	0.33
344	0.25
345	0.25
346	0.23
347	0.18
348	0.18
349	0.14
350	0.14
351	0.13
352	0.14
353	0.14
354	0.19
355	0.19
356	0.21
357	0.21
358	0.21
359	0.22
360	0.21
361	0.23
362	0.17
363	0.2
364	0.19
365	0.19
366	0.16
367	0.16
368	0.15
369	0.14
370	0.16
371	0.14
372	0.16
373	0.22
374	0.23
375	0.23
376	0.24
377	0.23
378	0.22
379	0.21
380	0.2
381	0.14
382	0.13
383	0.12
384	0.11
385	0.09
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.06
405	0.07
406	0.07
407	0.1
408	0.1
409	0.13
410	0.15
411	0.17
412	0.24
413	0.29
414	0.36
415	0.37
416	0.37
417	0.34
418	0.33
419	0.32
420	0.24
421	0.23
422	0.16
423	0.13
424	0.12
425	0.13
426	0.12
427	0.11
428	0.1
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.09
435	0.11
436	0.17
437	0.27
438	0.37
439	0.42
440	0.44
441	0.51
442	0.56
443	0.6
444	0.55
445	0.55
446	0.56
447	0.56
448	0.55
449	0.52
450	0.5
451	0.45
452	0.45
453	0.37
454	0.29
455	0.24
456	0.24
457	0.21
458	0.16
459	0.15
460	0.13
461	0.12
462	0.1
463	0.08
464	0.07
465	0.05
466	0.06
467	0.07
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.07
474	0.08
475	0.06
476	0.06
477	0.07
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.11
482	0.15
483	0.2
484	0.23
485	0.22
486	0.22
487	0.23
488	0.24
489	0.24
490	0.23
491	0.18
492	0.15
493	0.15
494	0.18
495	0.17
496	0.17
497	0.16
498	0.18
499	0.23
500	0.23
501	0.23
502	0.2
503	0.2
504	0.2
505	0.19
506	0.21
507	0.25
508	0.25
509	0.27
510	0.27
511	0.29
512	0.3
513	0.31
514	0.27
515	0.2
516	0.24
517	0.26
518	0.31
519	0.3
520	0.31
521	0.3
522	0.29
523	0.28
524	0.23
525	0.19
526	0.13
527	0.13
528	0.12
529	0.11
530	0.1
531	0.09
532	0.12
533	0.14
534	0.13
535	0.13
536	0.12
537	0.14
538	0.13
539	0.13
540	0.11
541	0.1
542	0.12
543	0.11
544	0.15
545	0.15
546	0.17
547	0.18
548	0.2
549	0.22
550	0.21
551	0.21
552	0.18
553	0.2
554	0.19
555	0.18
556	0.17
557	0.17
558	0.21
559	0.21
560	0.22
561	0.23
562	0.26
563	0.31
564	0.33
565	0.32
566	0.3
567	0.37
568	0.42
569	0.38
570	0.38
571	0.36
572	0.35
573	0.33
574	0.3
575	0.24
576	0.17
577	0.16
578	0.13
579	0.11
580	0.1
581	0.12
582	0.15
583	0.17
584	0.24
585	0.29
586	0.34
587	0.41
588	0.45
589	0.5
590	0.53
591	0.58
592	0.61
593	0.66
594	0.62
595	0.56
596	0.53
597	0.47
598	0.43
599	0.39
600	0.33
601	0.26
602	0.25
603	0.27
604	0.32
605	0.35
606	0.35
607	0.35
608	0.33
609	0.34
610	0.37
611	0.35
612	0.31
613	0.31
614	0.29
615	0.27
616	0.29
617	0.27
618	0.29
619	0.31
620	0.33
621	0.42
622	0.51
623	0.6
624	0.65
625	0.74
626	0.78
627	0.84
628	0.89
629	0.87
630	0.83
631	0.82
632	0.81
633	0.8
634	0.75
635	0.69
636	0.58
637	0.54
638	0.48
639	0.4
640	0.35
641	0.26
642	0.23
643	0.17
644	0.2
645	0.21
646	0.21
647	0.23
648	0.22
649	0.26
650	0.33
651	0.41
652	0.45
653	0.49
654	0.52
655	0.55
656	0.6
657	0.59
658	0.57
659	0.57
660	0.58
661	0.57
662	0.6
663	0.6
664	0.58
665	0.58
666	0.55
667	0.52
668	0.46
669	0.41
670	0.37
671	0.35
672	0.32
673	0.32
674	0.33
675	0.3
676	0.35
677	0.41
678	0.44
679	0.51
680	0.54
681	0.59
682	0.6
683	0.62
684	0.64
685	0.64
686	0.58
687	0.5
688	0.45
689	0.4
690	0.35
691	0.3
692	0.24
693	0.17
694	0.18
695	0.16
696	0.17
697	0.15
698	0.14
699	0.15
700	0.2
701	0.27
702	0.29
703	0.32
704	0.31
705	0.33
706	0.36
707	0.36
708	0.36
709	0.34
710	0.33
711	0.3
712	0.3
713	0.27
714	0.24
715	0.22
716	0.17
717	0.12
718	0.1
719	0.11
720	0.08
721	0.08
722	0.09
723	0.09
724	0.09
725	0.12
726	0.12
727	0.15
728	0.19
729	0.2
730	0.24
731	0.24
732	0.26
733	0.25
734	0.26
735	0.26
736	0.26
737	0.25
738	0.21
739	0.21
740	0.21
741	0.21
742	0.2
743	0.2
744	0.2
745	0.22
746	0.23
747	0.22
748	0.29
749	0.34
750	0.41
751	0.44
752	0.43
753	0.43
754	0.42
755	0.47
756	0.44
757	0.46
758	0.44
759	0.4
760	0.44
761	0.5
762	0.54
763	0.49
764	0.48
765	0.48
766	0.47
767	0.48
768	0.45
769	0.39
770	0.37
771	0.37
772	0.33
773	0.27
774	0.22
775	0.21
776	0.25

A0A1S8VY42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer