Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VJW7

Protein Details
Accession A0A1S8VJW7    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-274QSYDRSRTRRRSTDRSHSKSRSRSRDRRRTYSRDLSRSHydrophilic
280-326LSRSPRRRDLSRSPRRRDRSRSPRRRDRSRSPRRRDLSRSPRRRDLSBasic
374-399TDEATQKKKGWSKKKVDSLFKNSSSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-350RTRRRSTDRSHSKSRSRSRDRRRTYSRDLSRSPRRRDLSRSPRRRDLSRSPRRRDRSRSPRRRDRSRSPRRRDLSRSPRRRDLSRSPRRRDLSRSPRRRDLSRSPRRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSDQPYERKNIHGTNPQFLIEKILRERIYECAYWKEKLFGASAETLVDRAVELQSIGGQFGSQKPTDFICLVLKMLQLQPDDQIITLFLNTKDFKYLTALAAFYIRLTDSHSRIYQRLEPLLEDRRKLRNRTNVGGYELTFMDQFISDLLTEDRMCDTILPRLTKRYMLEDQGDLELRTSIFDGELDDMADGEESSKKSPMYTPEDSSMAPQSIPAPLTSASKIPTQTEPPRHPSSQSYDRSRTRRRSTDRSHSKSRSRSRDRRRTYSRDLSRSPRRRDLSRSPRRRDLSRSPRRRDRSRSPRRRDRSRSPRRRDLSRSPRRRDLSRSPRRRDLSRSPRRRDLSRSPRRRDLSGNQESKTTADTAPILNSQTVTDEATQKKKGWSKKKVDSLFKNSSSKNEPHSSVRQVKRTGAENSESLSVDEANSIRASLGLKPLQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.56
3 0.53
4 0.47
5 0.4
6 0.4
7 0.32
8 0.34
9 0.32
10 0.38
11 0.36
12 0.37
13 0.38
14 0.37
15 0.39
16 0.36
17 0.34
18 0.36
19 0.39
20 0.4
21 0.39
22 0.37
23 0.34
24 0.33
25 0.32
26 0.24
27 0.24
28 0.23
29 0.22
30 0.2
31 0.18
32 0.15
33 0.14
34 0.12
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.13
48 0.18
49 0.16
50 0.17
51 0.18
52 0.2
53 0.24
54 0.22
55 0.2
56 0.19
57 0.2
58 0.2
59 0.2
60 0.19
61 0.18
62 0.19
63 0.21
64 0.19
65 0.18
66 0.19
67 0.19
68 0.19
69 0.16
70 0.14
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.12
75 0.1
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.2
80 0.19
81 0.2
82 0.21
83 0.23
84 0.2
85 0.21
86 0.2
87 0.17
88 0.18
89 0.17
90 0.12
91 0.1
92 0.08
93 0.07
94 0.12
95 0.17
96 0.18
97 0.23
98 0.26
99 0.29
100 0.3
101 0.35
102 0.35
103 0.34
104 0.35
105 0.31
106 0.3
107 0.32
108 0.4
109 0.39
110 0.36
111 0.36
112 0.43
113 0.49
114 0.53
115 0.56
116 0.57
117 0.6
118 0.64
119 0.66
120 0.58
121 0.56
122 0.52
123 0.44
124 0.36
125 0.29
126 0.23
127 0.16
128 0.13
129 0.1
130 0.08
131 0.07
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.13
146 0.17
147 0.2
148 0.2
149 0.25
150 0.26
151 0.28
152 0.29
153 0.3
154 0.29
155 0.29
156 0.31
157 0.27
158 0.27
159 0.24
160 0.24
161 0.17
162 0.14
163 0.11
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.13
187 0.18
188 0.24
189 0.26
190 0.28
191 0.28
192 0.29
193 0.29
194 0.28
195 0.23
196 0.16
197 0.12
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.16
213 0.2
214 0.26
215 0.33
216 0.36
217 0.4
218 0.45
219 0.44
220 0.43
221 0.4
222 0.41
223 0.43
224 0.46
225 0.46
226 0.49
227 0.55
228 0.62
229 0.67
230 0.69
231 0.67
232 0.7
233 0.71
234 0.74
235 0.76
236 0.78
237 0.81
238 0.78
239 0.8
240 0.77
241 0.78
242 0.77
243 0.78
244 0.78
245 0.78
246 0.81
247 0.83
248 0.86
249 0.86
250 0.87
251 0.87
252 0.84
253 0.83
254 0.83
255 0.8
256 0.77
257 0.74
258 0.73
259 0.74
260 0.76
261 0.73
262 0.72
263 0.68
264 0.65
265 0.69
266 0.71
267 0.71
268 0.72
269 0.76
270 0.74
271 0.79
272 0.79
273 0.75
274 0.72
275 0.72
276 0.72
277 0.73
278 0.76
279 0.76
280 0.82
281 0.86
282 0.87
283 0.85
284 0.85
285 0.85
286 0.86
287 0.88
288 0.89
289 0.91
290 0.91
291 0.93
292 0.91
293 0.91
294 0.91
295 0.91
296 0.92
297 0.9
298 0.91
299 0.86
300 0.86
301 0.83
302 0.83
303 0.83
304 0.82
305 0.83
306 0.8
307 0.83
308 0.79
309 0.75
310 0.72
311 0.72
312 0.72
313 0.73
314 0.76
315 0.74
316 0.79
317 0.79
318 0.75
319 0.72
320 0.72
321 0.72
322 0.73
323 0.76
324 0.74
325 0.79
326 0.79
327 0.75
328 0.72
329 0.72
330 0.72
331 0.73
332 0.76
333 0.74
334 0.79
335 0.78
336 0.73
337 0.7
338 0.68
339 0.68
340 0.68
341 0.67
342 0.58
343 0.56
344 0.52
345 0.45
346 0.38
347 0.29
348 0.19
349 0.15
350 0.16
351 0.16
352 0.18
353 0.19
354 0.18
355 0.16
356 0.16
357 0.14
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.2
363 0.25
364 0.32
365 0.35
366 0.36
367 0.43
368 0.49
369 0.56
370 0.6
371 0.65
372 0.69
373 0.76
374 0.84
375 0.85
376 0.88
377 0.88
378 0.86
379 0.85
380 0.81
381 0.78
382 0.69
383 0.67
384 0.63
385 0.58
386 0.56
387 0.53
388 0.51
389 0.51
390 0.57
391 0.6
392 0.63
393 0.66
394 0.67
395 0.64
396 0.66
397 0.64
398 0.63
399 0.59
400 0.54
401 0.5
402 0.43
403 0.42
404 0.39
405 0.35
406 0.28
407 0.24
408 0.18
409 0.15
410 0.17
411 0.14
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.11
416 0.12
417 0.14
418 0.14
419 0.21