Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VYC8

Protein Details
Accession A0A1S8VYC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
454-485QNTHDEISAKRPRRRRKHSKRSHNKSDTVHADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
463-476KRPRRRRKHSKRSH
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.833, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014886  La_xRRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF08777  RRM_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS51939  XRRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTEYIELAQRVGQSLSDLLSDGALAFDYVLLYRLKQASDGWLDITDLLPMMPETDDEAIVAYASRKHCSALLDVSEDGAYVRRLTPFPDHTLLDARTVYVERLPSSSTDASIRLAFDSFGQIEQVVVPRHGGIAKRFPGYAFVVFVNSDSADKAVQHYSHSWKPMTSTLNIPEFLKCEATSPSGYRVMTKIEWNVRTMEYALLQSSKQELLVQTKADQLGQHHHATFVSGVVCAFGGVHKDTTAKYIKNLFEIVSPIAFVDFKFGQNKGHVRFKTAYDALKAESFFSRQSIIQSHKSCTGVIASNLNPTLLLDESCISIRILKGREEKEYWRLIRNTQGNTNVITTTSQNQKRNNAASHVTFNDADENTTLDGTTIIDASTRDIPMHLENSKPQPPKKHIKFDVSESGEEEDAIQDGVVDGSQHSRSTVSKCHFPKRSAADCDETMDHECISVQNTHDEISAKRPRRRRKHSKRSHNKSDTVHADTTSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.12
4 0.12
5 0.1
6 0.09
7 0.09
8 0.07
9 0.06
10 0.06
11 0.05
12 0.04
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.14
20 0.16
21 0.16
22 0.18
23 0.19
24 0.23
25 0.27
26 0.28
27 0.24
28 0.22
29 0.22
30 0.21
31 0.2
32 0.13
33 0.09
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.12
50 0.14
51 0.16
52 0.16
53 0.18
54 0.2
55 0.22
56 0.25
57 0.25
58 0.25
59 0.26
60 0.26
61 0.25
62 0.22
63 0.2
64 0.16
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.17
72 0.24
73 0.27
74 0.32
75 0.35
76 0.34
77 0.33
78 0.38
79 0.36
80 0.31
81 0.27
82 0.21
83 0.19
84 0.19
85 0.18
86 0.14
87 0.15
88 0.14
89 0.15
90 0.16
91 0.15
92 0.2
93 0.2
94 0.18
95 0.18
96 0.18
97 0.18
98 0.19
99 0.18
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.1
104 0.13
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.13
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.14
118 0.16
119 0.16
120 0.23
121 0.27
122 0.28
123 0.28
124 0.27
125 0.28
126 0.29
127 0.26
128 0.19
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.12
134 0.1
135 0.09
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.1
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.18
145 0.23
146 0.27
147 0.3
148 0.28
149 0.26
150 0.27
151 0.31
152 0.3
153 0.26
154 0.26
155 0.27
156 0.29
157 0.29
158 0.28
159 0.23
160 0.22
161 0.21
162 0.18
163 0.14
164 0.12
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.2
171 0.2
172 0.2
173 0.19
174 0.2
175 0.19
176 0.2
177 0.22
178 0.26
179 0.27
180 0.27
181 0.28
182 0.24
183 0.24
184 0.22
185 0.17
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.13
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.15
205 0.13
206 0.16
207 0.2
208 0.21
209 0.19
210 0.19
211 0.18
212 0.18
213 0.16
214 0.11
215 0.08
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.12
230 0.15
231 0.14
232 0.16
233 0.22
234 0.22
235 0.23
236 0.23
237 0.19
238 0.17
239 0.18
240 0.16
241 0.1
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.12
251 0.13
252 0.14
253 0.19
254 0.24
255 0.25
256 0.33
257 0.31
258 0.34
259 0.35
260 0.35
261 0.38
262 0.35
263 0.32
264 0.25
265 0.26
266 0.23
267 0.22
268 0.21
269 0.15
270 0.14
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.13
277 0.16
278 0.2
279 0.27
280 0.29
281 0.3
282 0.32
283 0.32
284 0.3
285 0.26
286 0.24
287 0.18
288 0.17
289 0.18
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.13
295 0.11
296 0.11
297 0.08
298 0.08
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.14
308 0.15
309 0.2
310 0.28
311 0.29
312 0.34
313 0.36
314 0.39
315 0.4
316 0.46
317 0.43
318 0.43
319 0.42
320 0.4
321 0.45
322 0.47
323 0.44
324 0.41
325 0.43
326 0.37
327 0.37
328 0.36
329 0.27
330 0.22
331 0.19
332 0.16
333 0.17
334 0.25
335 0.31
336 0.36
337 0.41
338 0.46
339 0.52
340 0.56
341 0.54
342 0.49
343 0.46
344 0.43
345 0.43
346 0.38
347 0.34
348 0.28
349 0.26
350 0.25
351 0.21
352 0.19
353 0.15
354 0.15
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.09
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.14
372 0.16
373 0.21
374 0.19
375 0.19
376 0.24
377 0.31
378 0.39
379 0.43
380 0.46
381 0.5
382 0.57
383 0.66
384 0.71
385 0.75
386 0.74
387 0.76
388 0.75
389 0.72
390 0.74
391 0.66
392 0.58
393 0.49
394 0.43
395 0.34
396 0.3
397 0.23
398 0.14
399 0.1
400 0.09
401 0.07
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.05
408 0.08
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.13
413 0.16
414 0.21
415 0.29
416 0.3
417 0.38
418 0.45
419 0.55
420 0.6
421 0.59
422 0.64
423 0.65
424 0.69
425 0.67
426 0.65
427 0.61
428 0.55
429 0.56
430 0.48
431 0.41
432 0.36
433 0.3
434 0.24
435 0.18
436 0.18
437 0.15
438 0.16
439 0.17
440 0.14
441 0.18
442 0.19
443 0.19
444 0.21
445 0.22
446 0.21
447 0.28
448 0.37
449 0.42
450 0.49
451 0.58
452 0.67
453 0.76
454 0.86
455 0.88
456 0.89
457 0.92
458 0.95
459 0.97
460 0.97
461 0.97
462 0.97
463 0.95
464 0.91
465 0.86
466 0.84
467 0.8
468 0.75
469 0.66