FuNGI

A0A1S8VYL7

Protein Details

Accession

A0A1S8VYL7

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
73-127	MEAPATRTRKRGKKAKPKAQPQQRQPSPQRGQPSPQKRPSRKLPLKQQPASPPKP	Hydrophilic
392-414	TKPTETRKSRGARKREKARECAG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
79-135	RTRKRGKKAKPKAQPQQRQPSPQRGQPSPQKRPSRKLPLKQQPASPPKPRTKIVVRR
313-318	RKSASK
322-324	KAK
398-409	RKSRGARKREKA
540-564	RGGRGRGRGREGHRGSSKRGGIKDK

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 10.5, cyto_nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MGINLAAKMNKTMCKTSDAIEQIWFCMYKCVVPSCSFSLFCAESRLDCGSCVLCKSLLVATPNPPSSGLLVHMEAPATRTRKRGKKAKPKAQPQQRQPSPQRGQPSPQKRPSRKLPLKQQPASPPKPRTKIVVRRLPPALPRDIFLESIAKWASCIGWSDYVAGKLTKSRLVKEHVLSRAYLCFLDTNSLLDFFKSYNGHLFVDDKGTEHHAVVEFAPFQRFSNKPKAVDPQMNTLDSDLDYLAFLHSLGKNPDEMDTSLSIKNVSAPNSDGTEGAGERRIAIAAGLDSFVEQPQQQCKTTPLLDAIRAEKARKSASKTEDKAKQSLGIKSKKASSASLVPGSVKISKREASAKASQGSALSSSLPLQALRSHSTSHDSLGKGMLDPPPTLTKPTETRKSRGARKREKARECAGAPSASAVIDTVESTPKAIQYTVVSNPSHSLGTQLPHSEESAHGSIVYSQQHHTRGRRSVEESGMSDSLGSLESMAGSRDGIRGKEGHKTGRGRGATHGSIRTAVLDPSSVSGQSFEKKDNQESTVRGGRGRGRGREGHRGSSKRGGIKDKGGAFLPNTTVSVSTGLDSTPSSRSESVRAKKSVTNLTSGSSGAATQPASSGVTRIVLTKRDGTTTAFEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.39
3	0.38
4	0.42
5	0.4
6	0.36
7	0.36
8	0.35
9	0.3
10	0.31
11	0.29
12	0.21
13	0.22
14	0.21
15	0.19
16	0.23
17	0.27
18	0.28
19	0.3
20	0.35
21	0.34
22	0.39
23	0.36
24	0.33
25	0.33
26	0.31
27	0.29
28	0.29
29	0.25
30	0.21
31	0.24
32	0.27
33	0.22
34	0.2
35	0.22
36	0.2
37	0.21
38	0.21
39	0.19
40	0.16
41	0.16
42	0.17
43	0.18
44	0.2
45	0.22
46	0.23
47	0.27
48	0.34
49	0.35
50	0.34
51	0.32
52	0.29
53	0.26
54	0.24
55	0.21
56	0.17
57	0.17
58	0.17
59	0.17
60	0.16
61	0.15
62	0.16
63	0.2
64	0.21
65	0.24
66	0.3
67	0.4
68	0.49
69	0.59
70	0.67
71	0.71
72	0.78
73	0.87
74	0.89
75	0.9
76	0.92
77	0.93
78	0.94
79	0.93
80	0.92
81	0.92
82	0.89
83	0.89
84	0.85
85	0.86
86	0.8
87	0.76
88	0.73
89	0.67
90	0.67
91	0.67
92	0.71
93	0.7
94	0.74
95	0.79
96	0.79
97	0.83
98	0.85
99	0.86
100	0.86
101	0.85
102	0.87
103	0.87
104	0.89
105	0.85
106	0.82
107	0.81
108	0.81
109	0.79
110	0.77
111	0.75
112	0.74
113	0.76
114	0.7
115	0.68
116	0.68
117	0.7
118	0.71
119	0.73
120	0.66
121	0.67
122	0.68
123	0.64
124	0.59
125	0.54
126	0.51
127	0.41
128	0.39
129	0.35
130	0.34
131	0.3
132	0.25
133	0.23
134	0.16
135	0.19
136	0.18
137	0.14
138	0.13
139	0.12
140	0.12
141	0.1
142	0.12
143	0.11
144	0.13
145	0.14
146	0.16
147	0.17
148	0.17
149	0.18
150	0.16
151	0.14
152	0.15
153	0.17
154	0.21
155	0.22
156	0.25
157	0.28
158	0.34
159	0.4
160	0.41
161	0.46
162	0.45
163	0.44
164	0.41
165	0.37
166	0.33
167	0.28
168	0.23
169	0.16
170	0.12
171	0.11
172	0.13
173	0.12
174	0.12
175	0.11
176	0.12
177	0.12
178	0.11
179	0.11
180	0.09
181	0.13
182	0.12
183	0.12
184	0.15
185	0.18
186	0.18
187	0.18
188	0.19
189	0.16
190	0.18
191	0.18
192	0.14
193	0.13
194	0.16
195	0.16
196	0.14
197	0.15
198	0.13
199	0.13
200	0.13
201	0.13
202	0.11
203	0.11
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.16
208	0.18
209	0.22
210	0.32
211	0.36
212	0.37
213	0.4
214	0.47
215	0.47
216	0.52
217	0.48
218	0.45
219	0.44
220	0.42
221	0.38
222	0.32
223	0.26
224	0.19
225	0.18
226	0.09
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.05
233	0.07
234	0.07
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.12
243	0.12
244	0.13
245	0.15
246	0.15
247	0.14
248	0.14
249	0.11
250	0.15
251	0.15
252	0.15
253	0.13
254	0.14
255	0.15
256	0.16
257	0.17
258	0.13
259	0.11
260	0.1
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.07
281	0.13
282	0.16
283	0.16
284	0.17
285	0.19
286	0.22
287	0.22
288	0.21
289	0.2
290	0.19
291	0.2
292	0.2
293	0.2
294	0.2
295	0.2
296	0.2
297	0.17
298	0.18
299	0.21
300	0.22
301	0.26
302	0.3
303	0.35
304	0.44
305	0.45
306	0.5
307	0.54
308	0.53
309	0.49
310	0.43
311	0.41
312	0.35
313	0.38
314	0.39
315	0.37
316	0.36
317	0.36
318	0.38
319	0.36
320	0.34
321	0.29
322	0.24
323	0.24
324	0.25
325	0.24
326	0.22
327	0.19
328	0.18
329	0.19
330	0.21
331	0.17
332	0.16
333	0.18
334	0.19
335	0.21
336	0.26
337	0.27
338	0.28
339	0.32
340	0.33
341	0.31
342	0.3
343	0.28
344	0.23
345	0.21
346	0.16
347	0.11
348	0.08
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.09
356	0.12
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.2
362	0.19
363	0.19
364	0.21
365	0.18
366	0.18
367	0.18
368	0.17
369	0.14
370	0.15
371	0.16
372	0.13
373	0.13
374	0.15
375	0.18
376	0.18
377	0.2
378	0.19
379	0.2
380	0.26
381	0.33
382	0.41
383	0.41
384	0.44
385	0.5
386	0.58
387	0.63
388	0.65
389	0.69
390	0.69
391	0.76
392	0.83
393	0.85
394	0.84
395	0.81
396	0.77
397	0.74
398	0.64
399	0.58
400	0.5
401	0.4
402	0.32
403	0.26
404	0.21
405	0.13
406	0.12
407	0.07
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.06
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.1
419	0.1
420	0.11
421	0.15
422	0.17
423	0.22
424	0.21
425	0.2
426	0.21
427	0.21
428	0.2
429	0.15
430	0.15
431	0.12
432	0.14
433	0.15
434	0.16
435	0.16
436	0.17
437	0.17
438	0.15
439	0.14
440	0.17
441	0.16
442	0.14
443	0.13
444	0.12
445	0.13
446	0.15
447	0.17
448	0.14
449	0.15
450	0.19
451	0.25
452	0.31
453	0.36
454	0.4
455	0.45
456	0.48
457	0.52
458	0.53
459	0.52
460	0.5
461	0.48
462	0.42
463	0.38
464	0.34
465	0.28
466	0.22
467	0.17
468	0.13
469	0.1
470	0.08
471	0.05
472	0.04
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.1
480	0.12
481	0.12
482	0.14
483	0.17
484	0.19
485	0.27
486	0.3
487	0.32
488	0.38
489	0.42
490	0.45
491	0.5
492	0.5
493	0.44
494	0.45
495	0.46
496	0.43
497	0.43
498	0.4
499	0.32
500	0.31
501	0.3
502	0.27
503	0.21
504	0.18
505	0.14
506	0.12
507	0.11
508	0.12
509	0.13
510	0.11
511	0.1
512	0.11
513	0.13
514	0.18
515	0.2
516	0.21
517	0.28
518	0.32
519	0.38
520	0.4
521	0.41
522	0.41
523	0.41
524	0.45
525	0.45
526	0.42
527	0.37
528	0.37
529	0.4
530	0.45
531	0.5
532	0.49
533	0.48
534	0.55
535	0.59
536	0.66
537	0.63
538	0.64
539	0.65
540	0.64
541	0.63
542	0.64
543	0.64
544	0.6
545	0.62
546	0.6
547	0.56
548	0.59
549	0.6
550	0.54
551	0.5
552	0.45
553	0.41
554	0.35
555	0.32
556	0.28
557	0.22
558	0.2
559	0.18
560	0.18
561	0.16
562	0.17
563	0.14
564	0.12
565	0.11
566	0.1
567	0.11
568	0.11
569	0.12
570	0.13
571	0.14
572	0.18
573	0.2
574	0.23
575	0.3
576	0.4
577	0.46
578	0.52
579	0.54
580	0.54
581	0.55
582	0.6
583	0.62
584	0.54
585	0.5
586	0.43
587	0.42
588	0.39
589	0.35
590	0.29
591	0.19
592	0.17
593	0.13
594	0.14
595	0.12
596	0.11
597	0.11
598	0.11
599	0.13
600	0.13
601	0.13
602	0.12
603	0.14
604	0.14
605	0.18
606	0.21
607	0.23
608	0.27
609	0.33
610	0.33
611	0.34
612	0.36
613	0.35

A0A1S8VYL7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer