Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VQQ9

Protein Details
Accession A0A1S8VQQ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-252KKAGASVKPHRNNKVSKHRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-180HKGRSKKGKTKGKTTGRAK
226-251KRGKSGVKKAGASVKPHRNNKVSKHR
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 10.5, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014886  La_xRRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08777  RRM_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51939  XRRM  
Amino Acid Sequences MVQTLAATHTYEDTVIQVHAKSKSNVNTDVVALSTAKKSYPKGKVVEFRVVSDVAETLERPMIQALFEKFASVKSVEFVKGNMIGYVQFKKPVAEEAISVIMSMGGIRIDDEVIQLRALSGDEERLYWTVVQEKLRINGPRTSAGVDLEHAVKFAKQTMAAHKGRSKKGKTKGKTTGRAKNSALTGRYHTSVVSSLNADAPNVSEGNGDMVDAISDTTLQSALGIKRGKSGVKKAGASVKPHRNNKVSKHRGTPGASSMKDLLEGFDRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.12
4 0.12
5 0.16
6 0.21
7 0.25
8 0.27
9 0.33
10 0.39
11 0.43
12 0.45
13 0.43
14 0.39
15 0.36
16 0.34
17 0.27
18 0.21
19 0.16
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.17
25 0.21
26 0.3
27 0.38
28 0.43
29 0.46
30 0.53
31 0.6
32 0.62
33 0.67
34 0.58
35 0.52
36 0.47
37 0.43
38 0.34
39 0.26
40 0.21
41 0.12
42 0.12
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.14
57 0.15
58 0.17
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.13
67 0.15
68 0.15
69 0.13
70 0.11
71 0.11
72 0.14
73 0.17
74 0.16
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.18
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.15
85 0.14
86 0.14
87 0.1
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.1
117 0.13
118 0.14
119 0.16
120 0.17
121 0.18
122 0.23
123 0.25
124 0.23
125 0.24
126 0.25
127 0.24
128 0.23
129 0.23
130 0.19
131 0.17
132 0.15
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.16
146 0.25
147 0.26
148 0.29
149 0.32
150 0.39
151 0.45
152 0.52
153 0.52
154 0.53
155 0.62
156 0.69
157 0.69
158 0.72
159 0.75
160 0.76
161 0.8
162 0.79
163 0.78
164 0.73
165 0.74
166 0.65
167 0.59
168 0.53
169 0.48
170 0.41
171 0.34
172 0.33
173 0.29
174 0.29
175 0.25
176 0.21
177 0.18
178 0.17
179 0.16
180 0.14
181 0.12
182 0.11
183 0.14
184 0.14
185 0.13
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.09
209 0.1
210 0.17
211 0.19
212 0.19
213 0.24
214 0.27
215 0.32
216 0.34
217 0.42
218 0.45
219 0.49
220 0.5
221 0.5
222 0.57
223 0.56
224 0.57
225 0.58
226 0.6
227 0.63
228 0.7
229 0.74
230 0.72
231 0.76
232 0.79
233 0.81
234 0.8
235 0.78
236 0.78
237 0.77
238 0.77
239 0.73
240 0.67
241 0.64
242 0.63
243 0.55
244 0.51
245 0.46
246 0.38
247 0.36
248 0.31
249 0.25