Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VXB7

Protein Details
Accession A0A1S8VXB7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
205-224GHNQSHPRRKQQHLPHAWEIHydrophilic
479-503LLSSCKPSRTHPSRKCPRRPFENIIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12254  RRM_hnRNPH_ESRPs_RBM12_like  
Amino Acid Sequences MSSQSKAVGAERLRPSQPTIHTGNPTPKDLGCIGNLDSTYSFRANMRDSPTDEQRVNHTHHPLLLLDTAELPRSNVKVTDYVTTVPMNNSLISSYAGLLHDMGSVQSPPETNPGHGHKAEQRHHAWSSAYSTQISTLQQRKQQRPTIPAFMDANSRPNWAQSLGSPTELSQLSADDMDGATPRFESIHQQIDHIFPTATIAHSHGHNQSHPRRKQQHLPHAWEIHDLPQRPNIYSQQQRVAVEMPLPLSPRGQALSEHYLTGSATPYEDSTPLVESSSAATLVVSTLNPSESGEVEGKTEPQLKISSLELLFTSRLSIPFNAHFSVLKIVNINWDLTTQDVLVFFGEPQIPIYHRAPHYHHSIHIIMDRTTGKTLGECFVEFPTQSMASQALRTHRRGFLKGRPVSVEPSTQDELYHALFPNLKASLEQSEERISQPLYEKVSDPLVQTALSDTSTSISPDQECRPELVYMAREDIFTLLSSCKPSRTHPSRKCPRRPFENIISILAKVPWHRANLIPILQRDHLFEMAKLGTESLLFQVQRVNSTIDIKFLEQFVRASLCVPLFTEKQKLIVLATAHLKCPPELERYVYMPIEQDDPSLITSSTLLATAPPVQDRPPVAAFQFQSLISRGNSLGNIPTPDLGLKHRSESLNDLQARTSSLSLENAPLLRQSFHRCISSARSSPAPSDIGLQGTQLTGSALVPSPSSSSSSPAVSKQSTSLDHMQHGSMTNLSDRHQGTYKQYSGHTQFGNINVDALRSIIMGLEQDLLTLRQKYDTVVAEYTQELTETKKVHQHLMDHNKRLEYMCEIMLRRCSEYEGQQSGGCFRTPIIGVSSDLETPPSTMDSSLSNPLSFARESLYGNGYVQGHS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.45
4 0.47
5 0.44
6 0.43
7 0.44
8 0.47
9 0.51
10 0.57
11 0.54
12 0.53
13 0.5
14 0.44
15 0.42
16 0.39
17 0.36
18 0.28
19 0.26
20 0.24
21 0.25
22 0.25
23 0.22
24 0.21
25 0.2
26 0.22
27 0.2
28 0.2
29 0.18
30 0.23
31 0.25
32 0.3
33 0.35
34 0.37
35 0.41
36 0.47
37 0.52
38 0.54
39 0.52
40 0.47
41 0.48
42 0.48
43 0.49
44 0.48
45 0.46
46 0.42
47 0.42
48 0.42
49 0.35
50 0.33
51 0.29
52 0.23
53 0.18
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.15
59 0.17
60 0.18
61 0.19
62 0.18
63 0.2
64 0.23
65 0.25
66 0.27
67 0.25
68 0.25
69 0.26
70 0.26
71 0.24
72 0.21
73 0.21
74 0.19
75 0.17
76 0.16
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.17
97 0.19
98 0.19
99 0.26
100 0.32
101 0.37
102 0.37
103 0.41
104 0.4
105 0.49
106 0.52
107 0.54
108 0.52
109 0.51
110 0.52
111 0.49
112 0.44
113 0.37
114 0.37
115 0.32
116 0.3
117 0.25
118 0.24
119 0.23
120 0.24
121 0.24
122 0.26
123 0.3
124 0.34
125 0.41
126 0.5
127 0.58
128 0.64
129 0.7
130 0.69
131 0.69
132 0.7
133 0.72
134 0.64
135 0.59
136 0.52
137 0.44
138 0.44
139 0.37
140 0.35
141 0.27
142 0.28
143 0.24
144 0.24
145 0.24
146 0.2
147 0.19
148 0.17
149 0.23
150 0.22
151 0.23
152 0.22
153 0.2
154 0.24
155 0.22
156 0.21
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.14
173 0.18
174 0.26
175 0.26
176 0.27
177 0.28
178 0.3
179 0.3
180 0.25
181 0.2
182 0.11
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.17
191 0.2
192 0.22
193 0.25
194 0.33
195 0.41
196 0.5
197 0.55
198 0.62
199 0.66
200 0.7
201 0.76
202 0.78
203 0.79
204 0.78
205 0.8
206 0.78
207 0.73
208 0.67
209 0.59
210 0.5
211 0.46
212 0.41
213 0.35
214 0.29
215 0.32
216 0.33
217 0.31
218 0.34
219 0.31
220 0.35
221 0.4
222 0.43
223 0.43
224 0.46
225 0.45
226 0.43
227 0.39
228 0.31
229 0.25
230 0.22
231 0.16
232 0.14
233 0.15
234 0.14
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.16
242 0.21
243 0.21
244 0.21
245 0.2
246 0.19
247 0.18
248 0.17
249 0.13
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.19
287 0.16
288 0.17
289 0.18
290 0.17
291 0.18
292 0.18
293 0.2
294 0.15
295 0.15
296 0.13
297 0.14
298 0.13
299 0.11
300 0.12
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.15
307 0.18
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.18
313 0.16
314 0.14
315 0.13
316 0.12
317 0.15
318 0.16
319 0.15
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.13
339 0.14
340 0.19
341 0.2
342 0.24
343 0.27
344 0.29
345 0.35
346 0.32
347 0.32
348 0.3
349 0.29
350 0.27
351 0.27
352 0.25
353 0.18
354 0.2
355 0.19
356 0.16
357 0.16
358 0.15
359 0.12
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.12
378 0.17
379 0.21
380 0.23
381 0.26
382 0.3
383 0.33
384 0.35
385 0.39
386 0.4
387 0.46
388 0.46
389 0.44
390 0.42
391 0.4
392 0.39
393 0.35
394 0.3
395 0.2
396 0.23
397 0.22
398 0.2
399 0.18
400 0.15
401 0.15
402 0.14
403 0.14
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.12
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.15
421 0.12
422 0.11
423 0.13
424 0.15
425 0.15
426 0.15
427 0.15
428 0.15
429 0.17
430 0.17
431 0.15
432 0.13
433 0.12
434 0.11
435 0.1
436 0.09
437 0.08
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.11
448 0.13
449 0.15
450 0.15
451 0.16
452 0.17
453 0.16
454 0.16
455 0.15
456 0.15
457 0.13
458 0.14
459 0.13
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.09
464 0.07
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.11
469 0.11
470 0.14
471 0.15
472 0.18
473 0.28
474 0.37
475 0.47
476 0.53
477 0.64
478 0.72
479 0.81
480 0.88
481 0.88
482 0.86
483 0.84
484 0.83
485 0.79
486 0.76
487 0.74
488 0.64
489 0.57
490 0.5
491 0.41
492 0.33
493 0.26
494 0.19
495 0.12
496 0.15
497 0.16
498 0.16
499 0.17
500 0.18
501 0.21
502 0.23
503 0.27
504 0.25
505 0.23
506 0.26
507 0.26
508 0.25
509 0.23
510 0.22
511 0.2
512 0.17
513 0.15
514 0.15
515 0.14
516 0.13
517 0.11
518 0.1
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.09
524 0.08
525 0.09
526 0.12
527 0.12
528 0.13
529 0.14
530 0.15
531 0.13
532 0.17
533 0.17
534 0.16
535 0.17
536 0.16
537 0.15
538 0.15
539 0.15
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.1
545 0.1
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.13
551 0.13
552 0.16
553 0.19
554 0.17
555 0.19
556 0.2
557 0.19
558 0.16
559 0.17
560 0.15
561 0.14
562 0.2
563 0.19
564 0.19
565 0.21
566 0.21
567 0.18
568 0.2
569 0.2
570 0.19
571 0.2
572 0.23
573 0.24
574 0.26
575 0.29
576 0.26
577 0.23
578 0.19
579 0.19
580 0.17
581 0.14
582 0.12
583 0.1
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.1
588 0.07
589 0.07
590 0.08
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.05
595 0.07
596 0.09
597 0.1
598 0.11
599 0.11
600 0.12
601 0.16
602 0.17
603 0.2
604 0.19
605 0.19
606 0.19
607 0.23
608 0.22
609 0.21
610 0.21
611 0.17
612 0.17
613 0.17
614 0.18
615 0.14
616 0.15
617 0.14
618 0.13
619 0.14
620 0.13
621 0.14
622 0.13
623 0.15
624 0.13
625 0.13
626 0.12
627 0.13
628 0.13
629 0.14
630 0.17
631 0.17
632 0.19
633 0.24
634 0.24
635 0.26
636 0.3
637 0.32
638 0.36
639 0.36
640 0.34
641 0.3
642 0.3
643 0.29
644 0.25
645 0.2
646 0.13
647 0.13
648 0.14
649 0.14
650 0.15
651 0.15
652 0.14
653 0.14
654 0.14
655 0.14
656 0.13
657 0.16
658 0.22
659 0.26
660 0.29
661 0.31
662 0.29
663 0.32
664 0.38
665 0.42
666 0.39
667 0.36
668 0.37
669 0.36
670 0.37
671 0.37
672 0.3
673 0.22
674 0.22
675 0.2
676 0.19
677 0.17
678 0.16
679 0.13
680 0.12
681 0.11
682 0.08
683 0.07
684 0.05
685 0.05
686 0.07
687 0.07
688 0.07
689 0.08
690 0.08
691 0.1
692 0.1
693 0.14
694 0.13
695 0.15
696 0.17
697 0.19
698 0.21
699 0.22
700 0.26
701 0.25
702 0.25
703 0.25
704 0.27
705 0.27
706 0.31
707 0.34
708 0.31
709 0.33
710 0.33
711 0.31
712 0.28
713 0.27
714 0.22
715 0.17
716 0.15
717 0.15
718 0.15
719 0.17
720 0.22
721 0.21
722 0.24
723 0.27
724 0.3
725 0.34
726 0.41
727 0.42
728 0.39
729 0.4
730 0.44
731 0.45
732 0.47
733 0.41
734 0.35
735 0.36
736 0.37
737 0.39
738 0.31
739 0.28
740 0.22
741 0.21
742 0.18
743 0.15
744 0.11
745 0.07
746 0.07
747 0.06
748 0.06
749 0.06
750 0.07
751 0.08
752 0.08
753 0.08
754 0.09
755 0.1
756 0.13
757 0.15
758 0.15
759 0.15
760 0.16
761 0.17
762 0.22
763 0.24
764 0.25
765 0.24
766 0.24
767 0.24
768 0.24
769 0.24
770 0.19
771 0.16
772 0.12
773 0.14
774 0.19
775 0.19
776 0.22
777 0.27
778 0.29
779 0.35
780 0.39
781 0.42
782 0.48
783 0.57
784 0.63
785 0.64
786 0.65
787 0.6
788 0.58
789 0.53
790 0.45
791 0.38
792 0.32
793 0.28
794 0.3
795 0.31
796 0.32
797 0.37
798 0.37
799 0.35
800 0.32
801 0.33
802 0.32
803 0.37
804 0.42
805 0.39
806 0.39
807 0.37
808 0.38
809 0.37
810 0.34
811 0.27
812 0.19
813 0.15
814 0.18
815 0.18
816 0.19
817 0.18
818 0.18
819 0.19
820 0.21
821 0.23
822 0.19
823 0.18
824 0.18
825 0.15
826 0.14
827 0.14
828 0.14
829 0.13
830 0.12
831 0.13
832 0.15
833 0.18
834 0.25
835 0.25
836 0.23
837 0.22
838 0.24
839 0.26
840 0.24
841 0.2
842 0.17
843 0.18
844 0.2
845 0.23
846 0.25
847 0.22
848 0.22
849 0.26