Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VIW8

Protein Details
Accession A0A1S8VIW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-424TPPMADVRRRRFRKRISKKAIEDVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-191ARVGRSIRGGRGSRGGRLR
407-418RRRRFRKRISKK
Subcellular Location(s) extr 10, cyto 8, cyto_nucl 8, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MVSFVFKVRAAAEANAATGTTGTTTGTGATTGTGATTADSTLSTTADISSNSNAQEGSRSGQQGAAITTTNTGAASKTASAHGSTRAKVTIKGHASGSHTTGTGTGTPGTPGTHVGSSESQQAAAAIPRTITFKTPTGPSPLGASLSTTTTTTTNNTTTTTPTTGTPSSAKAARVGRSIRGGRGSRGGRLRGRTTATATATTTASTATTTTTTTASASVGKQAGAATTTTNAASALPHKPTAASKEDEALSEAPIEDHLILRVPASLAPRLRLHVQKRDLPPTALSLRFSDARKGEATFIGIASTATAGSNTGSNTGSNAGSTIQKTDQAPLVLPMQLVDLPCIIESLKTIDNKQFYKVADVAQMIVVSDPVDPTAANTTTTSSSRSRASADGSWPDGLTPPMADVRRRRFRKRISKKAIEDVEQEIERLLLADADAVDVKYDVHDRRDGDGSTIGGGSVGDALDGSEMADLMDKDGDSASMIEKNSHAGDASRGGAGGSGLAGDADDGDDQDSDLAAEIQEALDAEDDANSQDGDDDKESEDDDEEEDDDNDAQGDDGDNESEDGGPEDVEGDDREDAHLKKQANLLQHEIQDLERKLVEKNAQASSQVNPIMRKRFEEIVGKLTSELDIKRQQLETIQAELVDNEGDDPMDQMIEQMDQMDQDEAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.14
5 0.11
6 0.1
7 0.07
8 0.07
9 0.06
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.09
33 0.1
34 0.11
35 0.13
36 0.15
37 0.17
38 0.17
39 0.18
40 0.16
41 0.15
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.21
46 0.22
47 0.22
48 0.23
49 0.24
50 0.22
51 0.21
52 0.19
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.1
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.13
66 0.14
67 0.16
68 0.17
69 0.25
70 0.28
71 0.28
72 0.29
73 0.31
74 0.32
75 0.35
76 0.36
77 0.37
78 0.36
79 0.37
80 0.36
81 0.36
82 0.39
83 0.36
84 0.35
85 0.27
86 0.24
87 0.21
88 0.2
89 0.18
90 0.15
91 0.14
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.11
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.16
103 0.18
104 0.18
105 0.23
106 0.21
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.15
111 0.16
112 0.16
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.14
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.18
121 0.21
122 0.24
123 0.25
124 0.3
125 0.3
126 0.28
127 0.28
128 0.27
129 0.25
130 0.22
131 0.21
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.18
144 0.18
145 0.2
146 0.22
147 0.22
148 0.2
149 0.19
150 0.23
151 0.21
152 0.23
153 0.21
154 0.2
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.24
159 0.28
160 0.28
161 0.32
162 0.32
163 0.32
164 0.37
165 0.39
166 0.36
167 0.39
168 0.38
169 0.34
170 0.4
171 0.39
172 0.37
173 0.41
174 0.44
175 0.42
176 0.46
177 0.47
178 0.43
179 0.45
180 0.41
181 0.39
182 0.38
183 0.35
184 0.31
185 0.28
186 0.25
187 0.22
188 0.19
189 0.15
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.1
222 0.12
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.17
228 0.21
229 0.22
230 0.2
231 0.19
232 0.22
233 0.22
234 0.21
235 0.21
236 0.17
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.09
253 0.13
254 0.13
255 0.16
256 0.17
257 0.18
258 0.22
259 0.28
260 0.31
261 0.36
262 0.4
263 0.45
264 0.49
265 0.53
266 0.51
267 0.45
268 0.4
269 0.36
270 0.35
271 0.29
272 0.25
273 0.2
274 0.2
275 0.22
276 0.22
277 0.23
278 0.19
279 0.2
280 0.2
281 0.2
282 0.19
283 0.16
284 0.16
285 0.12
286 0.11
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.07
335 0.1
336 0.11
337 0.13
338 0.16
339 0.2
340 0.21
341 0.23
342 0.23
343 0.2
344 0.23
345 0.22
346 0.2
347 0.18
348 0.18
349 0.16
350 0.13
351 0.12
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.12
368 0.13
369 0.16
370 0.14
371 0.16
372 0.16
373 0.17
374 0.18
375 0.17
376 0.2
377 0.19
378 0.21
379 0.21
380 0.21
381 0.21
382 0.18
383 0.17
384 0.14
385 0.12
386 0.09
387 0.07
388 0.06
389 0.1
390 0.12
391 0.16
392 0.23
393 0.32
394 0.42
395 0.49
396 0.56
397 0.61
398 0.71
399 0.78
400 0.82
401 0.84
402 0.84
403 0.87
404 0.83
405 0.83
406 0.76
407 0.67
408 0.58
409 0.5
410 0.43
411 0.33
412 0.29
413 0.2
414 0.16
415 0.13
416 0.1
417 0.07
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.1
430 0.11
431 0.14
432 0.18
433 0.19
434 0.22
435 0.26
436 0.25
437 0.22
438 0.22
439 0.19
440 0.16
441 0.15
442 0.11
443 0.08
444 0.08
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.05
466 0.06
467 0.07
468 0.1
469 0.1
470 0.11
471 0.11
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.12
476 0.09
477 0.11
478 0.12
479 0.13
480 0.11
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.07
486 0.04
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.04
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.05
520 0.06
521 0.07
522 0.1
523 0.11
524 0.12
525 0.12
526 0.13
527 0.14
528 0.14
529 0.14
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.1
538 0.09
539 0.09
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.08
553 0.07
554 0.07
555 0.06
556 0.07
557 0.07
558 0.08
559 0.08
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.12
564 0.16
565 0.17
566 0.2
567 0.25
568 0.24
569 0.28
570 0.34
571 0.35
572 0.38
573 0.41
574 0.43
575 0.43
576 0.43
577 0.4
578 0.35
579 0.33
580 0.34
581 0.3
582 0.26
583 0.23
584 0.23
585 0.23
586 0.29
587 0.32
588 0.3
589 0.35
590 0.36
591 0.35
592 0.36
593 0.36
594 0.32
595 0.33
596 0.31
597 0.29
598 0.3
599 0.36
600 0.43
601 0.44
602 0.45
603 0.44
604 0.45
605 0.47
606 0.5
607 0.47
608 0.45
609 0.44
610 0.41
611 0.36
612 0.32
613 0.28
614 0.23
615 0.21
616 0.21
617 0.26
618 0.28
619 0.32
620 0.33
621 0.33
622 0.33
623 0.4
624 0.36
625 0.33
626 0.31
627 0.27
628 0.26
629 0.25
630 0.22
631 0.14
632 0.11
633 0.08
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.08
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.08
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.1