FuNGI

A0A1S8VMX5

Protein Details

Accession

A0A1S8VMX5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
75-102	LQSNSQGLRQKKPRQSQQQEQMQHRQGS	Hydrophilic
117-145	TSGSNGRGQRQQRHPQQQQQQQQQQQQQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 8.5, cyto_nucl 8.5, cyto 7.5, mito 5, pero 2, plas 1, extr 1, E.R. 1, golg 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MSFDPRCCFSFPFESTTMSFFGFSTALPADAGLQPHPPPEGHQSEQRNQPEQRNQSEQRNQTNGQAGGQSIQQQLQSNSQGLRQKKPRQSQQQEQMQHRQGSSPRSTKGAASNTGGTSGSNGRGQRQQRHPQQQQQQQQQQQQQQQYQQGLSNFATSAAGVDGDRLDEQLRERYERTVDGYTDNELLAHGLASGIDDDNPNANNETFGHEAVPLASRHGSSQQTPDGSPMSASKQLQQKNELAIALQQRRLMRQQEEEREKGNSGFGINHAMPGSSSSGGGGGIASGHPHMLQQQQQQQYQRQMQQQQHQQQQQQQHQQQLQQQQLHQQQQQLQQQQQLQQQQQHLQQQQQRHQQQQQQQQQQAYNGTYAGVPPEGIPTNIPISNLHEIEAQMQRQARMGASVSPATNNMMMMGLPSNSLPGKISPGIHPHSQMHLHPGVYAGARPMQDGGFPQPSPQNRSSMMNMLEVEAAIRSRQAQFGMHPQASLQQSVAQRSLSPPVNAAEIEAMMSAQYNGGAQQMRFNPSSPLQQQSSHLNYEQAHPSMQHLAQQASRSMPALNQPYYESSPPAHHSPNLMVLEEQFRRQQIDTSRNYQKMQPQPSNMQGQLDSMQHNANAAPEQSQQRLETRQPLPLHELQYAAELENEIGFEDAEYMPTSETDTKVNDRIVHAAELSRQEELIDERDVPIFSVDADDDFPALGVSRNADPKPNAADHRSKGAHHTMLQKKHMNQRERRQADQRVPINLTHRERDQPAPDDQHLPREERYNGLMRKFEMEYIAKIQVSNLFTEDPFKDDFYCQQRPREQTLALEGTLGKITPKSARNPKKVIQVLTSSTSETRIGGLSGGSVLSARVVLKNIEQVYTAILEIEYLERTKGPENSFSTEKGIEYQDALARLVSSLKAFEPASETSQSPFVCMFNFTKGIRAFLRSLRFLDSDQVMRMLSVLLIRFECLKVSNISTGTNSDEVDIFMSLVISLLVGVVSDASMIAVISLARIVLERHNMAWFAKSKAGLSILTMLLSRAEVLKQGAAGHSLPSDQELGMWSEIYNFMFQSMQGHFSALFPTNALSPDNVCVWQFMSAIAVGASGIDHQRVLVTEVRENVMHASKTGDPKALDNVNLFLNALGLGISAAQLAAMPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.38
3	0.38
4	0.34
5	0.26
6	0.23
7	0.17
8	0.17
9	0.14
10	0.12
11	0.14
12	0.13
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.15
18	0.17
19	0.14
20	0.17
21	0.17
22	0.19
23	0.21
24	0.19
25	0.21
26	0.28
27	0.34
28	0.34
29	0.42
30	0.49
31	0.55
32	0.64
33	0.66
34	0.66
35	0.64
36	0.69
37	0.71
38	0.71
39	0.71
40	0.72
41	0.71
42	0.73
43	0.78
44	0.77
45	0.76
46	0.75
47	0.68
48	0.64
49	0.66
50	0.56
51	0.48
52	0.41
53	0.32
54	0.27
55	0.27
56	0.26
57	0.2
58	0.21
59	0.22
60	0.25
61	0.26
62	0.31
63	0.32
64	0.31
65	0.3
66	0.34
67	0.38
68	0.39
69	0.47
70	0.51
71	0.58
72	0.65
73	0.74
74	0.79
75	0.84
76	0.89
77	0.9
78	0.9
79	0.89
80	0.88
81	0.85
82	0.85
83	0.81
84	0.75
85	0.65
86	0.6
87	0.55
88	0.55
89	0.56
90	0.52
91	0.47
92	0.47
93	0.47
94	0.45
95	0.48
96	0.46
97	0.41
98	0.38
99	0.4
100	0.36
101	0.37
102	0.33
103	0.25
104	0.22
105	0.2
106	0.2
107	0.2
108	0.21
109	0.23
110	0.31
111	0.39
112	0.46
113	0.53
114	0.61
115	0.67
116	0.77
117	0.83
118	0.85
119	0.88
120	0.87
121	0.87
122	0.87
123	0.86
124	0.84
125	0.83
126	0.82
127	0.8
128	0.78
129	0.76
130	0.72
131	0.68
132	0.67
133	0.62
134	0.55
135	0.51
136	0.44
137	0.4
138	0.34
139	0.29
140	0.22
141	0.19
142	0.17
143	0.13
144	0.12
145	0.08
146	0.08
147	0.06
148	0.07
149	0.07
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.09
154	0.1
155	0.13
156	0.19
157	0.22
158	0.25
159	0.26
160	0.29
161	0.31
162	0.31
163	0.33
164	0.3
165	0.28
166	0.27
167	0.27
168	0.26
169	0.24
170	0.21
171	0.16
172	0.13
173	0.12
174	0.09
175	0.08
176	0.05
177	0.04
178	0.04
179	0.05
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.07
184	0.08
185	0.1
186	0.11
187	0.12
188	0.13
189	0.13
190	0.13
191	0.14
192	0.18
193	0.17
194	0.17
195	0.16
196	0.14
197	0.14
198	0.14
199	0.16
200	0.11
201	0.12
202	0.13
203	0.12
204	0.14
205	0.19
206	0.21
207	0.21
208	0.26
209	0.28
210	0.3
211	0.3
212	0.3
213	0.26
214	0.24
215	0.22
216	0.19
217	0.18
218	0.22
219	0.22
220	0.26
221	0.32
222	0.37
223	0.4
224	0.43
225	0.42
226	0.4
227	0.41
228	0.36
229	0.28
230	0.27
231	0.31
232	0.31
233	0.29
234	0.3
235	0.29
236	0.32
237	0.38
238	0.4
239	0.35
240	0.41
241	0.47
242	0.54
243	0.6
244	0.59
245	0.56
246	0.52
247	0.49
248	0.41
249	0.33
250	0.23
251	0.17
252	0.15
253	0.14
254	0.17
255	0.16
256	0.17
257	0.16
258	0.14
259	0.13
260	0.14
261	0.16
262	0.1
263	0.1
264	0.08
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.06
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.08
278	0.13
279	0.18
280	0.24
281	0.32
282	0.38
283	0.43
284	0.48
285	0.51
286	0.55
287	0.57
288	0.56
289	0.56
290	0.58
291	0.6
292	0.63
293	0.67
294	0.68
295	0.69
296	0.69
297	0.66
298	0.64
299	0.67
300	0.67
301	0.68
302	0.63
303	0.62
304	0.59
305	0.59
306	0.59
307	0.57
308	0.56
309	0.49
310	0.46
311	0.46
312	0.51
313	0.52
314	0.49
315	0.45
316	0.45
317	0.49
318	0.55
319	0.53
320	0.48
321	0.47
322	0.48
323	0.5
324	0.49
325	0.48
326	0.45
327	0.44
328	0.45
329	0.45
330	0.47
331	0.49
332	0.47
333	0.47
334	0.47
335	0.5
336	0.54
337	0.59
338	0.6
339	0.59
340	0.63
341	0.64
342	0.68
343	0.71
344	0.72
345	0.7
346	0.69
347	0.65
348	0.6
349	0.55
350	0.5
351	0.4
352	0.31
353	0.22
354	0.18
355	0.14
356	0.12
357	0.1
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.1
366	0.13
367	0.14
368	0.14
369	0.12
370	0.16
371	0.2
372	0.2
373	0.19
374	0.17
375	0.16
376	0.2
377	0.22
378	0.18
379	0.17
380	0.18
381	0.17
382	0.17
383	0.18
384	0.14
385	0.12
386	0.13
387	0.12
388	0.12
389	0.14
390	0.13
391	0.12
392	0.13
393	0.12
394	0.12
395	0.1
396	0.08
397	0.07
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.07
405	0.06
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.1
410	0.12
411	0.14
412	0.15
413	0.2
414	0.24
415	0.24
416	0.27
417	0.25
418	0.26
419	0.27
420	0.25
421	0.25
422	0.23
423	0.22
424	0.19
425	0.18
426	0.16
427	0.14
428	0.14
429	0.09
430	0.1
431	0.1
432	0.1
433	0.1
434	0.09
435	0.09
436	0.1
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.15
441	0.19
442	0.22
443	0.28
444	0.28
445	0.27
446	0.25
447	0.29
448	0.29
449	0.29
450	0.28
451	0.23
452	0.22
453	0.19
454	0.18
455	0.14
456	0.12
457	0.08
458	0.07
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.06
463	0.08
464	0.09
465	0.09
466	0.11
467	0.19
468	0.24
469	0.23
470	0.22
471	0.21
472	0.25
473	0.25
474	0.24
475	0.16
476	0.16
477	0.17
478	0.19
479	0.2
480	0.15
481	0.14
482	0.15
483	0.2
484	0.17
485	0.15
486	0.15
487	0.15
488	0.15
489	0.15
490	0.14
491	0.09
492	0.07
493	0.07
494	0.05
495	0.04
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.05
504	0.07
505	0.07
506	0.11
507	0.14
508	0.17
509	0.18
510	0.18
511	0.19
512	0.19
513	0.25
514	0.23
515	0.24
516	0.23
517	0.23
518	0.25
519	0.28
520	0.29
521	0.25
522	0.24
523	0.22
524	0.21
525	0.23
526	0.23
527	0.18
528	0.15
529	0.14
530	0.15
531	0.15
532	0.15
533	0.16
534	0.14
535	0.15
536	0.16
537	0.17
538	0.17
539	0.14
540	0.15
541	0.11
542	0.1
543	0.1
544	0.13
545	0.16
546	0.16
547	0.15
548	0.16
549	0.18
550	0.2
551	0.2
552	0.16
553	0.13
554	0.15
555	0.17
556	0.19
557	0.18
558	0.16
559	0.17
560	0.16
561	0.21
562	0.2
563	0.17
564	0.14
565	0.14
566	0.18
567	0.17
568	0.18
569	0.13
570	0.13
571	0.14
572	0.15
573	0.18
574	0.2
575	0.28
576	0.3
577	0.36
578	0.42
579	0.43
580	0.44
581	0.42
582	0.44
583	0.43
584	0.48
585	0.45
586	0.42
587	0.43
588	0.46
589	0.47
590	0.4
591	0.33
592	0.25
593	0.22
594	0.2
595	0.18
596	0.14
597	0.11
598	0.11
599	0.1
600	0.11
601	0.1
602	0.08
603	0.07
604	0.07
605	0.08
606	0.11
607	0.13
608	0.14
609	0.15
610	0.16
611	0.18
612	0.21
613	0.21
614	0.26
615	0.25
616	0.3
617	0.29
618	0.3
619	0.33
620	0.34
621	0.34
622	0.26
623	0.26
624	0.19
625	0.21
626	0.19
627	0.14
628	0.1
629	0.07
630	0.07
631	0.06
632	0.06
633	0.04
634	0.04
635	0.03
636	0.03
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.08
645	0.08
646	0.09
647	0.1
648	0.12
649	0.14
650	0.16
651	0.18
652	0.17
653	0.17
654	0.19
655	0.18
656	0.17
657	0.15
658	0.13
659	0.14
660	0.15
661	0.15
662	0.12
663	0.11
664	0.1
665	0.11
666	0.11
667	0.12
668	0.1
669	0.09
670	0.1
671	0.11
672	0.11
673	0.1
674	0.09
675	0.07
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.05
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.05
684	0.05
685	0.04
686	0.05
687	0.05
688	0.04
689	0.06
690	0.08
691	0.13
692	0.13
693	0.17
694	0.17
695	0.19
696	0.23
697	0.25
698	0.26
699	0.27
700	0.33
701	0.31
702	0.38
703	0.37
704	0.34
705	0.34
706	0.36
707	0.34
708	0.31
709	0.4
710	0.4
711	0.44
712	0.5
713	0.51
714	0.51
715	0.58
716	0.62
717	0.61
718	0.63
719	0.68
720	0.72
721	0.72
722	0.72
723	0.71
724	0.71
725	0.69
726	0.69
727	0.63
728	0.56
729	0.53
730	0.5
731	0.47
732	0.46
733	0.42
734	0.36
735	0.35
736	0.34
737	0.36
738	0.38
739	0.38
740	0.34
741	0.35
742	0.37
743	0.37
744	0.4
745	0.37
746	0.39
747	0.36
748	0.35
749	0.32
750	0.33
751	0.32
752	0.27
753	0.3
754	0.31
755	0.32
756	0.32
757	0.33
758	0.28
759	0.31
760	0.29
761	0.26
762	0.22
763	0.2
764	0.19
765	0.21
766	0.22
767	0.19
768	0.18
769	0.18
770	0.19
771	0.18
772	0.17
773	0.15
774	0.13
775	0.13
776	0.17
777	0.17
778	0.14
779	0.15
780	0.15
781	0.15
782	0.15
783	0.22
784	0.26
785	0.35
786	0.36
787	0.42
788	0.48
789	0.52
790	0.57
791	0.55
792	0.48
793	0.41
794	0.43
795	0.38
796	0.31
797	0.27
798	0.2
799	0.17
800	0.16
801	0.14
802	0.08
803	0.07
804	0.09
805	0.14
806	0.18
807	0.26
808	0.37
809	0.47
810	0.55
811	0.62
812	0.65
813	0.69
814	0.7
815	0.64
816	0.57
817	0.52
818	0.47
819	0.44
820	0.39
821	0.3
822	0.25
823	0.24
824	0.21
825	0.16
826	0.14
827	0.11
828	0.1
829	0.09
830	0.08
831	0.06
832	0.06
833	0.06
834	0.05
835	0.04
836	0.04
837	0.04
838	0.05
839	0.05
840	0.06
841	0.08
842	0.09
843	0.1
844	0.16
845	0.16
846	0.16
847	0.16
848	0.15
849	0.15
850	0.15
851	0.14
852	0.08
853	0.07
854	0.07
855	0.06
856	0.07
857	0.07
858	0.07
859	0.08
860	0.08
861	0.1
862	0.14
863	0.19
864	0.21
865	0.27
866	0.31
867	0.36
868	0.37
869	0.37
870	0.36
871	0.32
872	0.29
873	0.25
874	0.23
875	0.18
876	0.17
877	0.17
878	0.16
879	0.17
880	0.16
881	0.14
882	0.12
883	0.12
884	0.12
885	0.1
886	0.08
887	0.09
888	0.09
889	0.12
890	0.12
891	0.12
892	0.15
893	0.16
894	0.19
895	0.2
896	0.21
897	0.19
898	0.24
899	0.23
900	0.2
901	0.19
902	0.16
903	0.15
904	0.18
905	0.18
906	0.17
907	0.22
908	0.21
909	0.27
910	0.26
911	0.3
912	0.28
913	0.3
914	0.29
915	0.31
916	0.37
917	0.32
918	0.34
919	0.34
920	0.33
921	0.3
922	0.32
923	0.29
924	0.25
925	0.24
926	0.23
927	0.19
928	0.17
929	0.16
930	0.12
931	0.09
932	0.09
933	0.09
934	0.1
935	0.1
936	0.11
937	0.12
938	0.12
939	0.13
940	0.12
941	0.14
942	0.15
943	0.17
944	0.21
945	0.2
946	0.21
947	0.21
948	0.21
949	0.22
950	0.21
951	0.19
952	0.16
953	0.15
954	0.14
955	0.14
956	0.12
957	0.09
958	0.07
959	0.07
960	0.06
961	0.05
962	0.05
963	0.04
964	0.03
965	0.03
966	0.03
967	0.03
968	0.03
969	0.03
970	0.03
971	0.03
972	0.03
973	0.03
974	0.03
975	0.03
976	0.03
977	0.03
978	0.03
979	0.03
980	0.04
981	0.04
982	0.04
983	0.05
984	0.06
985	0.1
986	0.15
987	0.17
988	0.18
989	0.2
990	0.21
991	0.21
992	0.25
993	0.24
994	0.23
995	0.26
996	0.25
997	0.24
998	0.26
999	0.27
1000	0.22
1001	0.21
1002	0.21
1003	0.17
1004	0.17
1005	0.16
1006	0.14
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.11
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.1
1013	0.11
1014	0.12
1015	0.12
1016	0.13
1017	0.14
1018	0.15
1019	0.15
1020	0.14
1021	0.13
1022	0.13
1023	0.12
1024	0.13
1025	0.13
1026	0.1
1027	0.11
1028	0.11
1029	0.13
1030	0.13
1031	0.13
1032	0.11
1033	0.12
1034	0.13
1035	0.14
1036	0.13
1037	0.1
1038	0.11
1039	0.11
1040	0.11
1041	0.14
1042	0.14
1043	0.16
1044	0.15
1045	0.16
1046	0.16
1047	0.16
1048	0.2
1049	0.18
1050	0.16
1051	0.13
1052	0.14
1053	0.15
1054	0.16
1055	0.16
1056	0.14
1057	0.13
1058	0.16
1059	0.17
1060	0.18
1061	0.16
1062	0.16
1063	0.16
1064	0.17
1065	0.15
1066	0.13
1067	0.12
1068	0.11
1069	0.11
1070	0.1
1071	0.08
1072	0.06
1073	0.06
1074	0.06
1075	0.06
1076	0.07
1077	0.08
1078	0.08
1079	0.08
1080	0.09
1081	0.1
1082	0.13
1083	0.17
1084	0.19
1085	0.22
1086	0.24
1087	0.27
1088	0.26
1089	0.26
1090	0.27
1091	0.27
1092	0.25
1093	0.22
1094	0.23
1095	0.27
1096	0.34
1097	0.36
1098	0.36
1099	0.32
1100	0.34
1101	0.41
1102	0.41
1103	0.38
1104	0.32
1105	0.31
1106	0.28
1107	0.27
1108	0.25
1109	0.17
1110	0.13
1111	0.11
1112	0.09
1113	0.06
1114	0.05
1115	0.05
1116	0.04
1117	0.05
1118	0.04
1119	0.04
1120	0.04

A0A1S8VMX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer