Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8VEJ5

Protein Details
Accession A0A1S8VEJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-226HMSRRDRRDDRKPAKRSENREKRTRKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-225MSRRDRRDDRKPAKRSENREKRTRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045183  Ebi-like  
IPR006594  LisH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MTDDCVLVPHNAVLLSWSLCKKTLLALSFQTPSWIGTAPYPGWGLQCSSLRVGSKGCAVVLPLVRLFPTKLQVSSITAFGCNQKVMSITSDEVNYLVYRYLLESGFSHSTFSFQHETAIHRAEIKGSSVRPGALISLLQKGLQYLEVETHIQENGNEKRCIAPFTLLGPHECQIVPTEFDEDYDDGFNGSKRGKRTDDQHMSRRDRRDDRKPAKRSENREKRTRKESSTIDDSIDTNAPKQEASEHKRIDGENEMDLDGPINGLPQEFSTSDVQSLTGHQSEVFVCSWNPIETLLATGSGDGTARIWSMDEDSEGKFPSPVLLQHCSQPGETKDVTTLDWSPDGIYLATGSYDGLARIWHKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.16
4 0.19
5 0.19
6 0.21
7 0.22
8 0.21
9 0.24
10 0.29
11 0.26
12 0.28
13 0.3
14 0.33
15 0.34
16 0.33
17 0.29
18 0.23
19 0.22
20 0.19
21 0.17
22 0.14
23 0.14
24 0.19
25 0.17
26 0.18
27 0.19
28 0.18
29 0.18
30 0.18
31 0.18
32 0.18
33 0.21
34 0.21
35 0.22
36 0.25
37 0.25
38 0.25
39 0.25
40 0.22
41 0.23
42 0.21
43 0.2
44 0.16
45 0.16
46 0.19
47 0.19
48 0.2
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.17
53 0.18
54 0.16
55 0.19
56 0.2
57 0.2
58 0.22
59 0.23
60 0.26
61 0.25
62 0.24
63 0.2
64 0.18
65 0.18
66 0.19
67 0.19
68 0.15
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.11
82 0.09
83 0.08
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.14
92 0.16
93 0.16
94 0.17
95 0.14
96 0.16
97 0.15
98 0.19
99 0.17
100 0.15
101 0.18
102 0.18
103 0.21
104 0.23
105 0.24
106 0.21
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.16
112 0.17
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.14
141 0.19
142 0.24
143 0.23
144 0.23
145 0.26
146 0.26
147 0.28
148 0.22
149 0.18
150 0.13
151 0.16
152 0.19
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.12
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.11
178 0.13
179 0.18
180 0.21
181 0.25
182 0.3
183 0.4
184 0.48
185 0.51
186 0.57
187 0.61
188 0.65
189 0.68
190 0.68
191 0.65
192 0.65
193 0.67
194 0.69
195 0.71
196 0.74
197 0.79
198 0.8
199 0.8
200 0.81
201 0.81
202 0.8
203 0.8
204 0.81
205 0.78
206 0.81
207 0.81
208 0.77
209 0.78
210 0.75
211 0.68
212 0.65
213 0.62
214 0.59
215 0.57
216 0.51
217 0.43
218 0.38
219 0.33
220 0.28
221 0.25
222 0.19
223 0.14
224 0.14
225 0.13
226 0.11
227 0.11
228 0.15
229 0.22
230 0.29
231 0.37
232 0.36
233 0.38
234 0.4
235 0.4
236 0.37
237 0.34
238 0.29
239 0.22
240 0.22
241 0.2
242 0.18
243 0.18
244 0.15
245 0.09
246 0.07
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.08
254 0.08
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.15
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.15
270 0.13
271 0.11
272 0.1
273 0.12
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.11
278 0.12
279 0.1
280 0.12
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.13
299 0.15
300 0.17
301 0.17
302 0.17
303 0.15
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.17
308 0.21
309 0.24
310 0.25
311 0.29
312 0.34
313 0.33
314 0.32
315 0.34
316 0.31
317 0.34
318 0.33
319 0.3
320 0.28
321 0.27
322 0.27
323 0.25
324 0.24
325 0.2
326 0.21
327 0.2
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.14
332 0.12
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.1