FuNGI

A0A1V2LB85

Protein Details

Accession

A0A1V2LB85

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-31	FEKSHNRSNSKNTIRRPNATE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain IPR025852 SM_dom_ATX
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD PF14438 SM-ATX

Amino Acid Sequences

MSKPQAHRNSFEKSHNRSNSKNTIRRPNATEKSNGSTDKINNSGSNGNANASTEVLQDETFQAHQHDRVLFLIMNSIGAEIIITTNDGGSKSGILESIDPKYLKIVLKTEGKVQTINFDDVVDFEIVNVDLFNNSFTKKAAGGFKTDTDISHRATSTQRRQEVEKWVPDASIPMGTSLEGLSLEDDSGAQWDQFATNEKKFGIKSEYDEHFYTTRINKNDPDYQKRLKEADRLAREIEGGITDNHHLAEERGIVLDDSGLDEEDKYSGVARKPSTAKGDALFASLINKGQDNKNLIFESQSKGSKYPLVPGAEKNRAFENVKKLNNMKEINSLKEFSQTFKIPAKFPEDLLPIVTKDKHKQEEILKKADAESAKASAKSSPKVDAPKTVTDTKTTPDVPTPQSKTSTRTNTPAATPTAPNAQLKRGDTKHKLNPKAMAFTPSFTPSNFGSPNPVVPTPQFSPHIPKNSPRLAHTPQRKRSAATFFAQGRAPSAEKKRSLGEDFNFFHGAEAEFKANKPDGKFYLERPFVTAPIWSDEEKPFKSLFPDPESIRSSVPSMHPHQMAPYQPIPMMQSPQMFYGAPQFPNMRMSPQQPQPMLSPSDPNFIQAQRMQPMYMQPGGIPMNPGAPMPYQRYPQGAGYPGPGGPMPQMIPPHSGGRMGYKNH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.75
3	0.77
4	0.74
5	0.77
6	0.78
7	0.79
8	0.79
9	0.77
10	0.79
11	0.8
12	0.81
13	0.79
14	0.79
15	0.77
16	0.73
17	0.7
18	0.64
19	0.62
20	0.61
21	0.55
22	0.47
23	0.46
24	0.45
25	0.45
26	0.44
27	0.41
28	0.36
29	0.38
30	0.39
31	0.33
32	0.34
33	0.28
34	0.25
35	0.23
36	0.23
37	0.2
38	0.18
39	0.17
40	0.13
41	0.12
42	0.12
43	0.12
44	0.11
45	0.11
46	0.12
47	0.12
48	0.13
49	0.15
50	0.17
51	0.19
52	0.23
53	0.23
54	0.22
55	0.22
56	0.24
57	0.21
58	0.18
59	0.2
60	0.15
61	0.15
62	0.13
63	0.12
64	0.09
65	0.08
66	0.08
67	0.04
68	0.05
69	0.04
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.07
74	0.07
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.09
79	0.09
80	0.1
81	0.1
82	0.13
83	0.15
84	0.17
85	0.22
86	0.21
87	0.2
88	0.22
89	0.26
90	0.25
91	0.26
92	0.26
93	0.28
94	0.35
95	0.36
96	0.42
97	0.43
98	0.42
99	0.4
100	0.37
101	0.37
102	0.33
103	0.33
104	0.26
105	0.21
106	0.19
107	0.18
108	0.2
109	0.14
110	0.1
111	0.08
112	0.09
113	0.08
114	0.08
115	0.08
116	0.05
117	0.05
118	0.06
119	0.07
120	0.08
121	0.08
122	0.09
123	0.1
124	0.12
125	0.12
126	0.17
127	0.23
128	0.23
129	0.28
130	0.29
131	0.3
132	0.32
133	0.31
134	0.27
135	0.25
136	0.27
137	0.25
138	0.26
139	0.25
140	0.24
141	0.31
142	0.4
143	0.43
144	0.5
145	0.52
146	0.51
147	0.55
148	0.59
149	0.62
150	0.6
151	0.55
152	0.49
153	0.44
154	0.41
155	0.37
156	0.32
157	0.23
158	0.18
159	0.13
160	0.11
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.09
165	0.08
166	0.06
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.04
174	0.06
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.14
182	0.17
183	0.18
184	0.2
185	0.21
186	0.24
187	0.23
188	0.26
189	0.25
190	0.22
191	0.25
192	0.3
193	0.33
194	0.34
195	0.34
196	0.33
197	0.28
198	0.27
199	0.27
200	0.25
201	0.29
202	0.28
203	0.3
204	0.31
205	0.36
206	0.45
207	0.48
208	0.5
209	0.51
210	0.56
211	0.56
212	0.57
213	0.56
214	0.5
215	0.5
216	0.5
217	0.52
218	0.5
219	0.48
220	0.45
221	0.4
222	0.37
223	0.3
224	0.22
225	0.13
226	0.1
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.08
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.06
242	0.06
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.1
255	0.12
256	0.16
257	0.17
258	0.22
259	0.25
260	0.28
261	0.32
262	0.3
263	0.3
264	0.26
265	0.28
266	0.22
267	0.21
268	0.17
269	0.12
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.12
277	0.16
278	0.19
279	0.19
280	0.22
281	0.22
282	0.21
283	0.21
284	0.21
285	0.2
286	0.2
287	0.21
288	0.19
289	0.19
290	0.2
291	0.22
292	0.21
293	0.23
294	0.23
295	0.24
296	0.24
297	0.28
298	0.34
299	0.36
300	0.36
301	0.33
302	0.29
303	0.3
304	0.31
305	0.3
306	0.33
307	0.33
308	0.35
309	0.37
310	0.38
311	0.38
312	0.43
313	0.41
314	0.33
315	0.34
316	0.34
317	0.33
318	0.33
319	0.3
320	0.23
321	0.27
322	0.25
323	0.19
324	0.21
325	0.19
326	0.2
327	0.25
328	0.27
329	0.23
330	0.25
331	0.29
332	0.25
333	0.25
334	0.27
335	0.22
336	0.21
337	0.21
338	0.19
339	0.14
340	0.15
341	0.17
342	0.15
343	0.19
344	0.25
345	0.27
346	0.27
347	0.32
348	0.39
349	0.46
350	0.48
351	0.48
352	0.42
353	0.39
354	0.38
355	0.37
356	0.28
357	0.2
358	0.16
359	0.15
360	0.16
361	0.16
362	0.16
363	0.17
364	0.2
365	0.21
366	0.21
367	0.21
368	0.23
369	0.29
370	0.3
371	0.33
372	0.34
373	0.35
374	0.38
375	0.4
376	0.36
377	0.33
378	0.33
379	0.27
380	0.27
381	0.24
382	0.21
383	0.19
384	0.23
385	0.24
386	0.31
387	0.33
388	0.32
389	0.35
390	0.36
391	0.37
392	0.41
393	0.45
394	0.4
395	0.4
396	0.41
397	0.38
398	0.38
399	0.37
400	0.32
401	0.27
402	0.24
403	0.21
404	0.22
405	0.23
406	0.24
407	0.22
408	0.23
409	0.25
410	0.27
411	0.33
412	0.32
413	0.39
414	0.43
415	0.5
416	0.55
417	0.6
418	0.64
419	0.6
420	0.62
421	0.57
422	0.55
423	0.48
424	0.44
425	0.35
426	0.3
427	0.29
428	0.26
429	0.24
430	0.18
431	0.2
432	0.17
433	0.21
434	0.21
435	0.19
436	0.21
437	0.21
438	0.23
439	0.24
440	0.23
441	0.19
442	0.19
443	0.24
444	0.21
445	0.24
446	0.24
447	0.22
448	0.3
449	0.35
450	0.42
451	0.39
452	0.43
453	0.47
454	0.51
455	0.51
456	0.47
457	0.49
458	0.47
459	0.54
460	0.59
461	0.62
462	0.63
463	0.7
464	0.68
465	0.63
466	0.63
467	0.61
468	0.55
469	0.47
470	0.46
471	0.38
472	0.4
473	0.38
474	0.32
475	0.26
476	0.25
477	0.24
478	0.24
479	0.3
480	0.35
481	0.36
482	0.38
483	0.4
484	0.42
485	0.45
486	0.45
487	0.4
488	0.41
489	0.41
490	0.42
491	0.39
492	0.34
493	0.29
494	0.24
495	0.21
496	0.15
497	0.15
498	0.15
499	0.15
500	0.15
501	0.19
502	0.2
503	0.23
504	0.23
505	0.27
506	0.27
507	0.33
508	0.35
509	0.36
510	0.44
511	0.44
512	0.42
513	0.41
514	0.39
515	0.33
516	0.32
517	0.28
518	0.2
519	0.2
520	0.23
521	0.19
522	0.21
523	0.25
524	0.32
525	0.31
526	0.32
527	0.28
528	0.27
529	0.3
530	0.33
531	0.34
532	0.34
533	0.39
534	0.38
535	0.44
536	0.46
537	0.43
538	0.38
539	0.33
540	0.28
541	0.26
542	0.28
543	0.28
544	0.3
545	0.35
546	0.35
547	0.34
548	0.36
549	0.37
550	0.36
551	0.36
552	0.32
553	0.28
554	0.27
555	0.28
556	0.29
557	0.27
558	0.27
559	0.24
560	0.26
561	0.25
562	0.26
563	0.26
564	0.22
565	0.2
566	0.25
567	0.27
568	0.24
569	0.26
570	0.27
571	0.26
572	0.32
573	0.32
574	0.29
575	0.28
576	0.33
577	0.38
578	0.44
579	0.5
580	0.46
581	0.48
582	0.46
583	0.46
584	0.46
585	0.39
586	0.39
587	0.33
588	0.38
589	0.36
590	0.35
591	0.34
592	0.29
593	0.33
594	0.29
595	0.33
596	0.32
597	0.33
598	0.31
599	0.3
600	0.33
601	0.33
602	0.31
603	0.26
604	0.21
605	0.25
606	0.26
607	0.25
608	0.22
609	0.17
610	0.18
611	0.18
612	0.18
613	0.15
614	0.16
615	0.2
616	0.25
617	0.3
618	0.31
619	0.33
620	0.37
621	0.38
622	0.39
623	0.4
624	0.37
625	0.33
626	0.32
627	0.32
628	0.28
629	0.26
630	0.22
631	0.18
632	0.15
633	0.17
634	0.15
635	0.17
636	0.21
637	0.22
638	0.26
639	0.27
640	0.3
641	0.28
642	0.29
643	0.26
644	0.31

A0A1V2LB85

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer