FuNGI

A0A1V2L1S6

Protein Details

Accession

A0A1V2L1S6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
162-183	QHQGPSKEKAKRTKEREELKIL	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MTDSETQAQLLRDASNNIKHETQLMKKCLETRGKLMDALKHASNFLTELRTSQLTPKQYYELYIQVFDSLNLLAGFLKENHPHHHLADLYELVQYAGNIVPRLYLMITVGTVYMSIPDAPVKEIMEYDEICLVVLFYQRNRDSIQFVIQNFIEMNKLWVRLQHQGPSKEKAKRTKEREELKILVGSNLVRLSQLENDKDYYKVSILPTILEQIVQCRDVIAQEYLLDVVIQVFPDEFHLYTLDVYLNCIKDLNPNVSLKKVLITLIDRLTDFAKREDLSDLEKLTIDESKDGKTTEESSSQTESHLFEKFWFYINELDKARELTIEDTSYLLESVARLTLTYYPTNYDNIDQLFKFAHDKIKELDQGATDPTDENFKLLLLTPVVNYTNLHDILKLKNYGDLLDAQPIKIQKVVSLEILNKILNEGIKIMSVDAVNGFVKLFKVIIISKDKEMDKNGDESLEYINDQEKLAKFVHLVWNKNTSTHAKLLTSLKNHLSSGNIKHTYPSLFFNTLKLIRRNKNLESTNSLFKFTSRVINDLYRTGLNDLSFKLYLSSAIIADQVKSEEFAYEFFAQCFTIYEEAISDSRTQYQSIVSIAGALQQCRNFSRDNYDTLITKTALHGSKLLKKADQCRAVYLASHLWWGVEIPALGEEEGVTEFYRDGKRVLECLQRSLRVADMVMDSTSSIELFVEILNRCLYYFIHGNESVTIKYINGLIELIQTNIESLNAEGSSSDVPKRHFERTLEYINSQKEIDDRFQLITW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.33
3	0.35
4	0.37
5	0.37
6	0.35
7	0.39
8	0.42
9	0.45
10	0.47
11	0.49
12	0.48
13	0.5
14	0.54
15	0.57
16	0.58
17	0.53
18	0.51
19	0.55
20	0.54
21	0.55
22	0.54
23	0.51
24	0.47
25	0.47
26	0.43
27	0.35
28	0.34
29	0.3
30	0.27
31	0.23
32	0.2
33	0.2
34	0.16
35	0.17
36	0.2
37	0.22
38	0.22
39	0.28
40	0.32
41	0.35
42	0.38
43	0.4
44	0.4
45	0.39
46	0.41
47	0.37
48	0.36
49	0.32
50	0.3
51	0.27
52	0.25
53	0.24
54	0.21
55	0.19
56	0.12
57	0.12
58	0.1
59	0.1
60	0.08
61	0.08
62	0.1
63	0.11
64	0.16
65	0.21
66	0.24
67	0.29
68	0.33
69	0.35
70	0.34
71	0.38
72	0.34
73	0.29
74	0.29
75	0.25
76	0.21
77	0.19
78	0.18
79	0.14
80	0.12
81	0.11
82	0.09
83	0.1
84	0.11
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.1
89	0.12
90	0.1
91	0.09
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.06
98	0.06
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.08
105	0.09
106	0.11
107	0.12
108	0.12
109	0.12
110	0.12
111	0.14
112	0.16
113	0.15
114	0.15
115	0.15
116	0.14
117	0.13
118	0.12
119	0.1
120	0.08
121	0.11
122	0.12
123	0.13
124	0.21
125	0.22
126	0.25
127	0.27
128	0.28
129	0.28
130	0.28
131	0.33
132	0.29
133	0.28
134	0.3
135	0.27
136	0.26
137	0.23
138	0.21
139	0.16
140	0.12
141	0.15
142	0.14
143	0.16
144	0.15
145	0.18
146	0.22
147	0.28
148	0.32
149	0.36
150	0.41
151	0.47
152	0.51
153	0.55
154	0.59
155	0.59
156	0.63
157	0.65
158	0.68
159	0.71
160	0.75
161	0.78
162	0.8
163	0.81
164	0.81
165	0.78
166	0.7
167	0.62
168	0.58
169	0.47
170	0.38
171	0.31
172	0.24
173	0.18
174	0.16
175	0.13
176	0.1
177	0.1
178	0.11
179	0.16
180	0.21
181	0.21
182	0.22
183	0.24
184	0.25
185	0.25
186	0.24
187	0.2
188	0.16
189	0.17
190	0.16
191	0.18
192	0.17
193	0.17
194	0.17
195	0.17
196	0.17
197	0.14
198	0.13
199	0.12
200	0.14
201	0.14
202	0.13
203	0.11
204	0.11
205	0.11
206	0.14
207	0.11
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.07
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.05
221	0.07
222	0.09
223	0.08
224	0.08
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.08
231	0.1
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.16
238	0.19
239	0.21
240	0.22
241	0.25
242	0.26
243	0.27
244	0.27
245	0.22
246	0.2
247	0.17
248	0.14
249	0.13
250	0.14
251	0.16
252	0.16
253	0.17
254	0.16
255	0.16
256	0.16
257	0.16
258	0.16
259	0.14
260	0.15
261	0.15
262	0.16
263	0.17
264	0.17
265	0.18
266	0.19
267	0.18
268	0.15
269	0.15
270	0.14
271	0.13
272	0.14
273	0.11
274	0.12
275	0.13
276	0.14
277	0.15
278	0.15
279	0.15
280	0.15
281	0.17
282	0.16
283	0.19
284	0.19
285	0.2
286	0.23
287	0.22
288	0.21
289	0.19
290	0.18
291	0.16
292	0.16
293	0.14
294	0.12
295	0.16
296	0.16
297	0.16
298	0.15
299	0.15
300	0.19
301	0.21
302	0.25
303	0.22
304	0.23
305	0.21
306	0.22
307	0.2
308	0.15
309	0.13
310	0.1
311	0.11
312	0.11
313	0.1
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.06
319	0.05
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.04
324	0.04
325	0.05
326	0.08
327	0.11
328	0.12
329	0.11
330	0.13
331	0.14
332	0.15
333	0.15
334	0.13
335	0.12
336	0.13
337	0.14
338	0.12
339	0.12
340	0.11
341	0.11
342	0.13
343	0.12
344	0.17
345	0.16
346	0.18
347	0.18
348	0.22
349	0.23
350	0.22
351	0.22
352	0.16
353	0.16
354	0.15
355	0.14
356	0.1
357	0.08
358	0.07
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.12
380	0.14
381	0.17
382	0.17
383	0.14
384	0.15
385	0.15
386	0.14
387	0.13
388	0.14
389	0.11
390	0.15
391	0.15
392	0.13
393	0.15
394	0.15
395	0.14
396	0.14
397	0.13
398	0.1
399	0.13
400	0.14
401	0.14
402	0.15
403	0.15
404	0.15
405	0.16
406	0.15
407	0.12
408	0.11
409	0.1
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.07
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.07
431	0.08
432	0.12
433	0.18
434	0.19
435	0.2
436	0.24
437	0.25
438	0.25
439	0.27
440	0.26
441	0.21
442	0.22
443	0.21
444	0.17
445	0.16
446	0.15
447	0.14
448	0.11
449	0.09
450	0.08
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.12
455	0.11
456	0.13
457	0.14
458	0.14
459	0.13
460	0.16
461	0.25
462	0.26
463	0.29
464	0.29
465	0.35
466	0.35
467	0.35
468	0.35
469	0.3
470	0.29
471	0.29
472	0.28
473	0.22
474	0.25
475	0.3
476	0.32
477	0.31
478	0.3
479	0.3
480	0.3
481	0.3
482	0.27
483	0.24
484	0.24
485	0.27
486	0.32
487	0.31
488	0.29
489	0.29
490	0.31
491	0.3
492	0.26
493	0.25
494	0.21
495	0.23
496	0.23
497	0.23
498	0.27
499	0.29
500	0.33
501	0.37
502	0.41
503	0.43
504	0.51
505	0.56
506	0.55
507	0.59
508	0.58
509	0.55
510	0.54
511	0.51
512	0.51
513	0.46
514	0.45
515	0.35
516	0.31
517	0.3
518	0.24
519	0.28
520	0.21
521	0.23
522	0.24
523	0.28
524	0.29
525	0.27
526	0.28
527	0.2
528	0.2
529	0.19
530	0.18
531	0.14
532	0.15
533	0.14
534	0.16
535	0.15
536	0.14
537	0.14
538	0.12
539	0.12
540	0.11
541	0.11
542	0.08
543	0.08
544	0.1
545	0.09
546	0.1
547	0.1
548	0.1
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.08
553	0.08
554	0.09
555	0.13
556	0.14
557	0.14
558	0.14
559	0.14
560	0.13
561	0.13
562	0.14
563	0.11
564	0.1
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.12
569	0.12
570	0.12
571	0.11
572	0.11
573	0.15
574	0.16
575	0.16
576	0.15
577	0.16
578	0.16
579	0.15
580	0.15
581	0.1
582	0.1
583	0.09
584	0.14
585	0.14
586	0.13
587	0.16
588	0.17
589	0.19
590	0.2
591	0.23
592	0.2
593	0.21
594	0.29
595	0.29
596	0.31
597	0.32
598	0.33
599	0.32
600	0.31
601	0.33
602	0.24
603	0.22
604	0.19
605	0.23
606	0.22
607	0.22
608	0.25
609	0.27
610	0.35
611	0.4
612	0.41
613	0.38
614	0.43
615	0.51
616	0.56
617	0.58
618	0.51
619	0.49
620	0.49
621	0.46
622	0.41
623	0.35
624	0.29
625	0.21
626	0.21
627	0.17
628	0.14
629	0.13
630	0.13
631	0.1
632	0.08
633	0.07
634	0.07
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.07
640	0.06
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.07
646	0.12
647	0.15
648	0.15
649	0.16
650	0.2
651	0.22
652	0.25
653	0.31
654	0.35
655	0.34
656	0.41
657	0.46
658	0.44
659	0.44
660	0.42
661	0.38
662	0.3
663	0.29
664	0.23
665	0.19
666	0.17
667	0.16
668	0.14
669	0.12
670	0.11
671	0.11
672	0.09
673	0.07
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.11
679	0.11
680	0.13
681	0.14
682	0.14
683	0.14
684	0.15
685	0.14
686	0.15
687	0.2
688	0.2
689	0.26
690	0.26
691	0.27
692	0.29
693	0.31
694	0.26
695	0.22
696	0.21
697	0.14
698	0.15
699	0.16
700	0.13
701	0.11
702	0.12
703	0.1
704	0.14
705	0.15
706	0.14
707	0.13
708	0.12
709	0.12
710	0.11
711	0.11
712	0.08
713	0.07
714	0.1
715	0.09
716	0.09
717	0.08
718	0.1
719	0.13
720	0.15
721	0.19
722	0.2
723	0.23
724	0.31
725	0.36
726	0.41
727	0.45
728	0.46
729	0.5
730	0.53
731	0.59
732	0.55
733	0.54
734	0.54
735	0.5
736	0.49
737	0.41
738	0.35
739	0.31
740	0.31
741	0.32
742	0.31
743	0.3

A0A1V2L1S6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer