Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V2LCA5

Protein Details
Accession A0A1V2LCA5    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MTKRRNNKHNGHPNKRHQEGDNBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 10, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MTKRRNNKHNGHPNKRHQEGDNARQLDPVFGQYRALPVSEDIIASVTPDTIPTDGETYLAMVRKQAETGSTVMFVPRDIDYDESEEQVTEQQTPIDRAPFRDLSSFKDIVLEEFTKQRDNLPEPGTLPIPDDFIFPESFTAWRAYVMSHEPSLHLVSNLDKELTLRLVVYSTRWLAASTPAQISNWIYSLLVRVPEVMDHSDVSVVRELGVRAKKFHDRDELPQDTRILCATILCIVGDFFNQRDLFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.88
3 0.82
4 0.73
5 0.73
6 0.72
7 0.7
8 0.69
9 0.61
10 0.56
11 0.53
12 0.51
13 0.42
14 0.33
15 0.3
16 0.22
17 0.2
18 0.21
19 0.18
20 0.21
21 0.2
22 0.19
23 0.14
24 0.12
25 0.14
26 0.13
27 0.13
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.11
46 0.13
47 0.11
48 0.11
49 0.13
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.12
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.13
81 0.13
82 0.16
83 0.16
84 0.18
85 0.23
86 0.23
87 0.24
88 0.26
89 0.26
90 0.26
91 0.32
92 0.3
93 0.24
94 0.25
95 0.24
96 0.2
97 0.22
98 0.18
99 0.12
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.17
105 0.18
106 0.2
107 0.24
108 0.23
109 0.23
110 0.23
111 0.24
112 0.22
113 0.18
114 0.16
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.1
121 0.1
122 0.08
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.15
140 0.13
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.15
164 0.16
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.19
171 0.16
172 0.14
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.13
190 0.15
191 0.14
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.19
197 0.26
198 0.26
199 0.26
200 0.32
201 0.4
202 0.42
203 0.48
204 0.5
205 0.48
206 0.54
207 0.62
208 0.64
209 0.57
210 0.57
211 0.53
212 0.44
213 0.4
214 0.33
215 0.24
216 0.16
217 0.14
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.11
228 0.17