Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V2LDI4

Protein Details
Accession A0A1V2LDI4    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-38IIGNDKPQVRYRSRRSRSRSGERGGSRHydrophilic
206-228SRDGGRRGGRPPREKKKTTEDLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-54RSRRSRSRSGERGGSRPGDYRDRDSDRRPKRR
168-178RRGGRRERPRA
204-222RGSRDGGRRGGRPPREKKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MSSLLEKSLDEIIGNDKPQVRYRSRRSRSRSGERGGSRPGDYRDRDSDRRPKRRGLEIEEGPLNSRSRAQRLMQGRYYIKITNLKYDITESELELLLDRIGKLTFCYIEFDRSGRSTGTAYAQYYKVDDNTAAVESYNNRKAGGQIITVELIKPLRIVALPSTEREERRGGRRERPRAKTAQDLDNELDAYMRGDEPATDRESRGSRDGGRRGGRPPREKKKTTEDLDRELEEYMDNKPFASAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.24
4 0.28
5 0.35
6 0.42
7 0.45
8 0.52
9 0.62
10 0.7
11 0.74
12 0.81
13 0.82
14 0.85
15 0.87
16 0.87
17 0.85
18 0.81
19 0.81
20 0.76
21 0.72
22 0.67
23 0.6
24 0.52
25 0.48
26 0.46
27 0.45
28 0.44
29 0.45
30 0.48
31 0.52
32 0.55
33 0.59
34 0.64
35 0.67
36 0.74
37 0.73
38 0.73
39 0.72
40 0.76
41 0.75
42 0.73
43 0.71
44 0.63
45 0.63
46 0.57
47 0.5
48 0.42
49 0.37
50 0.3
51 0.21
52 0.23
53 0.22
54 0.24
55 0.29
56 0.28
57 0.33
58 0.39
59 0.45
60 0.43
61 0.46
62 0.43
63 0.4
64 0.41
65 0.35
66 0.32
67 0.32
68 0.3
69 0.3
70 0.3
71 0.29
72 0.27
73 0.27
74 0.24
75 0.2
76 0.19
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.11
94 0.11
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.12
102 0.12
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.14
124 0.17
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.21
130 0.2
131 0.16
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.2
150 0.23
151 0.24
152 0.26
153 0.3
154 0.29
155 0.36
156 0.44
157 0.45
158 0.51
159 0.61
160 0.69
161 0.74
162 0.76
163 0.75
164 0.73
165 0.72
166 0.72
167 0.66
168 0.62
169 0.54
170 0.51
171 0.46
172 0.4
173 0.35
174 0.25
175 0.21
176 0.13
177 0.12
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.1
184 0.13
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.22
189 0.25
190 0.28
191 0.29
192 0.3
193 0.33
194 0.4
195 0.46
196 0.5
197 0.52
198 0.52
199 0.56
200 0.62
201 0.65
202 0.67
203 0.71
204 0.74
205 0.79
206 0.81
207 0.8
208 0.81
209 0.81
210 0.78
211 0.78
212 0.73
213 0.7
214 0.7
215 0.64
216 0.54
217 0.44
218 0.38
219 0.28
220 0.23
221 0.19
222 0.19
223 0.18
224 0.17