Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V2L6J4

Protein Details
Accession A0A1V2L6J4    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-173APEESQKSKRQQKMEKRAQHTHTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 24, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006591  RNAP_P/RPABC4  
IPR029040  RPABC4/Spt4  
IPR008506  SND2/TMEM208  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF03604  DNA_RNApol_7kD  
PF05620  TMEM208_SND2  
Amino Acid Sequences MAGQSAKKQVASNTKILKEIHLVTWTTLVFFGLFTLYFNRPASSKPFIFFSLPSLASLFVLEKTGRPRVDDSGKIIRQGQDLSAEGLTEYLFDVIYYTIICQFLAFATGSNKMWWLYLAIPAFAGYKVYGLISAGKEMFGMGKKPAAQNAAPEESQKSKRQQKMEKRAQHTHTTMSKEGFVPPQNLSSANAGFASSKNNTVKYICTNCATPVSLGRNDAIRCNACGHRVLYKARTRRMVQFEAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.54
3 0.52
4 0.47
5 0.42
6 0.4
7 0.35
8 0.31
9 0.29
10 0.25
11 0.28
12 0.25
13 0.2
14 0.17
15 0.14
16 0.11
17 0.1
18 0.09
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.11
23 0.13
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.17
28 0.2
29 0.25
30 0.28
31 0.28
32 0.26
33 0.29
34 0.3
35 0.31
36 0.29
37 0.27
38 0.25
39 0.23
40 0.22
41 0.2
42 0.18
43 0.16
44 0.16
45 0.13
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.11
50 0.15
51 0.22
52 0.21
53 0.23
54 0.25
55 0.3
56 0.35
57 0.35
58 0.37
59 0.4
60 0.41
61 0.4
62 0.4
63 0.36
64 0.31
65 0.3
66 0.24
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.14
71 0.12
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.06
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.08
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.07
127 0.08
128 0.07
129 0.09
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.16
134 0.16
135 0.18
136 0.22
137 0.23
138 0.21
139 0.21
140 0.22
141 0.24
142 0.29
143 0.31
144 0.36
145 0.42
146 0.48
147 0.57
148 0.64
149 0.7
150 0.76
151 0.82
152 0.82
153 0.81
154 0.83
155 0.78
156 0.76
157 0.67
158 0.62
159 0.57
160 0.53
161 0.47
162 0.4
163 0.37
164 0.3
165 0.31
166 0.29
167 0.26
168 0.24
169 0.23
170 0.23
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.2
175 0.18
176 0.16
177 0.15
178 0.13
179 0.13
180 0.12
181 0.15
182 0.14
183 0.2
184 0.22
185 0.23
186 0.25
187 0.26
188 0.29
189 0.33
190 0.37
191 0.34
192 0.33
193 0.33
194 0.33
195 0.35
196 0.33
197 0.25
198 0.26
199 0.28
200 0.28
201 0.28
202 0.27
203 0.3
204 0.29
205 0.32
206 0.32
207 0.29
208 0.28
209 0.32
210 0.34
211 0.31
212 0.34
213 0.32
214 0.33
215 0.36
216 0.41
217 0.45
218 0.51
219 0.57
220 0.61
221 0.67
222 0.65
223 0.69
224 0.71