FuNGI

A0A1V2L7C1

Protein Details

Accession

A0A1V2L7C1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
509-536	QFTTKIPPAKVTKKRANKKGRIPATFDA	Hydrophilic
544-573	RWLPMKDRSYYKPKKGKKKNARDTQGGSAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
517-531	AKVTKKRANKKGRIP
554-564	YKPKKGKKKNA
593-601	QKKKKKGKK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like

Amino Acid Sequences

MASLNDLFKELAVQADEGEYSAVFEQASDILKSAPHDLRALTHTVVALIHLERYLDALRFLKQYSQADPGNSLILEKLYVYYKLNLATELRTALDSIPESDNTKAILHLKAQFLYQQGNYAEALEIYRDLISQVDSRHPLYADLAINERAVLADGIASGSIVGTTQPSITDSPTSHDLIYNEAALALASGNTDKALSLLDEAEQLAAALDDEDELIPIQLQRAFVLFSLDRTEEAIEILHKVENLKSDDSLGSIVLSNNLVASSSTTPSAVFLLKELQFPNKINELSARLSAEQRCILWKNYYRLAVKAGKRVQLSTSDGADITGRVLSSLSKAGVSITDDNIKVQAKKALKYAKTVKTIPASIAAAQLNIQTGNLDAAVSALEVLPDESRLTPGISGTLLSLYATLSSEKKATSLFNDVTSAYKGKELTSMENTFLTTFYLHFLSHPELSSEAKEILNSLNTKNPSHIISAALHPTEPATNLTPLSDLTSSYTVEDLITEATSHLQSQFTTKIPPAKVTKKRANKKGRIPATFDAKVEPDPERWLPMKDRSYYKPKKGKKKNARDTQGGSADHTTEEALNTKQNSASSSAGQKKKKKGKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.12
3	0.12
4	0.11
5	0.11
6	0.08
7	0.08
8	0.08
9	0.08
10	0.07
11	0.07
12	0.08
13	0.1
14	0.12
15	0.11
16	0.11
17	0.12
18	0.13
19	0.15
20	0.21
21	0.22
22	0.22
23	0.23
24	0.23
25	0.27
26	0.28
27	0.3
28	0.24
29	0.22
30	0.2
31	0.19
32	0.18
33	0.15
34	0.14
35	0.11
36	0.11
37	0.1
38	0.1
39	0.09
40	0.12
41	0.14
42	0.12
43	0.15
44	0.16
45	0.18
46	0.2
47	0.22
48	0.23
49	0.28
50	0.31
51	0.31
52	0.36
53	0.36
54	0.35
55	0.36
56	0.33
57	0.28
58	0.25
59	0.21
60	0.15
61	0.12
62	0.11
63	0.09
64	0.1
65	0.1
66	0.13
67	0.15
68	0.16
69	0.18
70	0.2
71	0.2
72	0.21
73	0.2
74	0.2
75	0.19
76	0.18
77	0.17
78	0.14
79	0.15
80	0.13
81	0.14
82	0.13
83	0.15
84	0.16
85	0.17
86	0.19
87	0.19
88	0.19
89	0.18
90	0.17
91	0.17
92	0.18
93	0.18
94	0.2
95	0.25
96	0.26
97	0.26
98	0.26
99	0.26
100	0.25
101	0.26
102	0.22
103	0.23
104	0.2
105	0.21
106	0.2
107	0.19
108	0.17
109	0.13
110	0.13
111	0.08
112	0.08
113	0.07
114	0.07
115	0.06
116	0.07
117	0.07
118	0.08
119	0.1
120	0.12
121	0.17
122	0.19
123	0.21
124	0.22
125	0.22
126	0.21
127	0.2
128	0.23
129	0.19
130	0.18
131	0.19
132	0.18
133	0.18
134	0.17
135	0.15
136	0.1
137	0.09
138	0.08
139	0.05
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.03
149	0.03
150	0.04
151	0.04
152	0.05
153	0.05
154	0.07
155	0.08
156	0.09
157	0.12
158	0.12
159	0.15
160	0.19
161	0.2
162	0.18
163	0.2
164	0.19
165	0.19
166	0.2
167	0.16
168	0.12
169	0.11
170	0.1
171	0.08
172	0.08
173	0.04
174	0.03
175	0.03
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.06
186	0.06
187	0.07
188	0.07
189	0.06
190	0.06
191	0.05
192	0.04
193	0.04
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.12
213	0.1
214	0.1
215	0.12
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.09
230	0.12
231	0.15
232	0.15
233	0.14
234	0.15
235	0.15
236	0.14
237	0.14
238	0.09
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.04
249	0.06
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.1
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.11
261	0.11
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.18
266	0.19
267	0.21
268	0.2
269	0.2
270	0.18
271	0.19
272	0.2
273	0.18
274	0.19
275	0.17
276	0.14
277	0.17
278	0.17
279	0.17
280	0.15
281	0.14
282	0.15
283	0.17
284	0.18
285	0.2
286	0.25
287	0.26
288	0.29
289	0.34
290	0.32
291	0.31
292	0.34
293	0.35
294	0.33
295	0.37
296	0.37
297	0.36
298	0.36
299	0.36
300	0.32
301	0.29
302	0.3
303	0.23
304	0.21
305	0.16
306	0.16
307	0.15
308	0.14
309	0.1
310	0.07
311	0.06
312	0.05
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.12
327	0.12
328	0.12
329	0.15
330	0.16
331	0.14
332	0.14
333	0.19
334	0.19
335	0.21
336	0.27
337	0.32
338	0.32
339	0.39
340	0.47
341	0.48
342	0.5
343	0.5
344	0.48
345	0.43
346	0.43
347	0.36
348	0.3
349	0.23
350	0.19
351	0.2
352	0.16
353	0.13
354	0.12
355	0.12
356	0.1
357	0.09
358	0.08
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.04
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.07
394	0.07
395	0.08
396	0.1
397	0.09
398	0.1
399	0.11
400	0.12
401	0.14
402	0.19
403	0.19
404	0.19
405	0.2
406	0.2
407	0.2
408	0.21
409	0.19
410	0.13
411	0.15
412	0.14
413	0.13
414	0.17
415	0.18
416	0.2
417	0.26
418	0.27
419	0.25
420	0.25
421	0.25
422	0.21
423	0.19
424	0.15
425	0.09
426	0.08
427	0.09
428	0.1
429	0.09
430	0.09
431	0.12
432	0.15
433	0.16
434	0.16
435	0.15
436	0.15
437	0.17
438	0.17
439	0.16
440	0.14
441	0.13
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.16
446	0.17
447	0.17
448	0.21
449	0.24
450	0.25
451	0.26
452	0.26
453	0.24
454	0.24
455	0.24
456	0.2
457	0.19
458	0.22
459	0.23
460	0.22
461	0.19
462	0.17
463	0.17
464	0.15
465	0.14
466	0.14
467	0.13
468	0.14
469	0.15
470	0.15
471	0.14
472	0.14
473	0.16
474	0.13
475	0.11
476	0.13
477	0.15
478	0.15
479	0.15
480	0.15
481	0.11
482	0.11
483	0.11
484	0.08
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.08
490	0.09
491	0.1
492	0.1
493	0.1
494	0.11
495	0.14
496	0.18
497	0.17
498	0.21
499	0.23
500	0.3
501	0.3
502	0.37
503	0.42
504	0.5
505	0.58
506	0.64
507	0.71
508	0.74
509	0.83
510	0.87
511	0.89
512	0.89
513	0.9
514	0.91
515	0.9
516	0.84
517	0.81
518	0.77
519	0.75
520	0.68
521	0.58
522	0.5
523	0.43
524	0.39
525	0.34
526	0.3
527	0.23
528	0.26
529	0.27
530	0.3
531	0.3
532	0.33
533	0.36
534	0.42
535	0.47
536	0.48
537	0.53
538	0.56
539	0.65
540	0.7
541	0.75
542	0.76
543	0.79
544	0.84
545	0.88
546	0.92
547	0.92
548	0.93
549	0.94
550	0.94
551	0.93
552	0.9
553	0.85
554	0.82
555	0.78
556	0.68
557	0.6
558	0.51
559	0.44
560	0.35
561	0.3
562	0.22
563	0.15
564	0.15
565	0.15
566	0.15
567	0.19
568	0.2
569	0.22
570	0.23
571	0.24
572	0.24
573	0.26
574	0.27
575	0.26
576	0.34
577	0.42
578	0.49
579	0.57
580	0.63
581	0.7

A0A1V2L7C1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer