FuNGI

A0A1V2LC52

Protein Details

Accession

A0A1V2LC52

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
407-438	DSMMDDKKLKKQKKAPLKKPPQPKPVAGKTLP	Hydrophilic
448-471	GASEEPPKKKRGTYKKKPKTEMKP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-435	KKLKKQKKAPLKKPPQPKPVAGK
452-471	EPPKKKRGTYKKKPKTEMKP

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 10.333, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MSNQDLKRSFGTMSSPHPNGTPANGTITTRNQQQQQQQAHTHAQQARMQQQQRIAMMNGNQHGYAHQPHLQKRVYNFVEEPDEILKKFEKSPPSMEFHIHENHYRFGNQDGIISKSNQMVKEFLEYVARGEIPHATVEVLRDAGITFYEGCLILKVFDHRNFIEVEGKRVPRSFRALLRPTQLSLYFDMLYQSDMALQKFSDALATGMETEILMLTNRKLDLKVPLNPYKATPYTKPVAQYPIIKESTGEILHNHREECTDPESKAFHPFKELHEELPQQNSEYEQFMLIMNDKAASDSAEGSQFTRLRFVEQLRLNKEKLKQASINANLSTTNNRSPMGRQSPNNIANLTPAQQQMLQQRRLQQLQLQQMQSMNGNLSPLQQQQQHIQQQKAMAQQQLQQTSPMTDSMMDDKKLKKQKKAPLKKPPQPKPVAGKTLPGTYSDKTLPGASEEPPKKKRGTYKKKPKTEMKP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.38
3	0.36
4	0.37
5	0.37
6	0.33
7	0.33
8	0.3
9	0.23
10	0.27
11	0.28
12	0.29
13	0.31
14	0.36
15	0.36
16	0.39
17	0.43
18	0.44
19	0.49
20	0.56
21	0.61
22	0.62
23	0.65
24	0.63
25	0.63
26	0.63
27	0.59
28	0.59
29	0.54
30	0.51
31	0.47
32	0.49
33	0.51
34	0.54
35	0.55
36	0.5
37	0.52
38	0.52
39	0.5
40	0.47
41	0.4
42	0.35
43	0.35
44	0.37
45	0.34
46	0.3
47	0.28
48	0.24
49	0.24
50	0.23
51	0.23
52	0.22
53	0.25
54	0.31
55	0.36
56	0.44
57	0.47
58	0.48
59	0.47
60	0.53
61	0.49
62	0.47
63	0.42
64	0.38
65	0.39
66	0.35
67	0.34
68	0.28
69	0.28
70	0.23
71	0.25
72	0.23
73	0.2
74	0.25
75	0.28
76	0.31
77	0.33
78	0.4
79	0.43
80	0.46
81	0.46
82	0.45
83	0.4
84	0.38
85	0.39
86	0.35
87	0.36
88	0.33
89	0.33
90	0.32
91	0.31
92	0.27
93	0.24
94	0.26
95	0.21
96	0.21
97	0.21
98	0.23
99	0.24
100	0.24
101	0.23
102	0.23
103	0.27
104	0.25
105	0.24
106	0.22
107	0.21
108	0.24
109	0.24
110	0.2
111	0.19
112	0.17
113	0.17
114	0.17
115	0.16
116	0.12
117	0.11
118	0.12
119	0.1
120	0.1
121	0.1
122	0.08
123	0.09
124	0.1
125	0.1
126	0.09
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.06
132	0.06
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.07
139	0.07
140	0.06
141	0.07
142	0.11
143	0.15
144	0.18
145	0.22
146	0.22
147	0.23
148	0.23
149	0.23
150	0.28
151	0.23
152	0.25
153	0.27
154	0.29
155	0.29
156	0.31
157	0.31
158	0.27
159	0.33
160	0.33
161	0.33
162	0.41
163	0.44
164	0.45
165	0.48
166	0.45
167	0.39
168	0.37
169	0.31
170	0.24
171	0.21
172	0.2
173	0.15
174	0.14
175	0.14
176	0.12
177	0.11
178	0.1
179	0.08
180	0.08
181	0.09
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.04
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.16
209	0.2
210	0.26
211	0.31
212	0.36
213	0.38
214	0.38
215	0.38
216	0.35
217	0.34
218	0.31
219	0.26
220	0.24
221	0.25
222	0.26
223	0.26
224	0.23
225	0.24
226	0.24
227	0.26
228	0.25
229	0.28
230	0.27
231	0.26
232	0.24
233	0.21
234	0.21
235	0.18
236	0.15
237	0.11
238	0.14
239	0.17
240	0.18
241	0.17
242	0.14
243	0.15
244	0.16
245	0.18
246	0.19
247	0.18
248	0.17
249	0.19
250	0.21
251	0.2
252	0.29
253	0.27
254	0.22
255	0.25
256	0.26
257	0.27
258	0.34
259	0.33
260	0.26
261	0.29
262	0.33
263	0.29
264	0.31
265	0.29
266	0.21
267	0.2
268	0.19
269	0.16
270	0.14
271	0.13
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.07
286	0.08
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.14
291	0.15
292	0.15
293	0.18
294	0.18
295	0.19
296	0.23
297	0.24
298	0.28
299	0.32
300	0.39
301	0.41
302	0.45
303	0.44
304	0.45
305	0.47
306	0.47
307	0.44
308	0.43
309	0.4
310	0.41
311	0.48
312	0.48
313	0.47
314	0.39
315	0.36
316	0.31
317	0.29
318	0.29
319	0.24
320	0.22
321	0.2
322	0.2
323	0.21
324	0.23
325	0.31
326	0.36
327	0.39
328	0.38
329	0.42
330	0.51
331	0.53
332	0.52
333	0.43
334	0.34
335	0.31
336	0.31
337	0.27
338	0.21
339	0.18
340	0.17
341	0.18
342	0.22
343	0.28
344	0.35
345	0.37
346	0.37
347	0.44
348	0.49
349	0.51
350	0.48
351	0.44
352	0.43
353	0.49
354	0.53
355	0.46
356	0.41
357	0.39
358	0.39
359	0.34
360	0.28
361	0.19
362	0.13
363	0.13
364	0.11
365	0.12
366	0.15
367	0.16
368	0.2
369	0.23
370	0.25
371	0.3
372	0.39
373	0.46
374	0.49
375	0.48
376	0.46
377	0.45
378	0.48
379	0.49
380	0.44
381	0.39
382	0.34
383	0.38
384	0.42
385	0.42
386	0.39
387	0.33
388	0.3
389	0.29
390	0.27
391	0.22
392	0.16
393	0.13
394	0.14
395	0.2
396	0.23
397	0.23
398	0.27
399	0.3
400	0.39
401	0.49
402	0.54
403	0.57
404	0.62
405	0.71
406	0.77
407	0.85
408	0.86
409	0.88
410	0.92
411	0.9
412	0.92
413	0.92
414	0.91
415	0.87
416	0.85
417	0.83
418	0.82
419	0.82
420	0.72
421	0.69
422	0.61
423	0.61
424	0.53
425	0.46
426	0.41
427	0.33
428	0.37
429	0.32
430	0.3
431	0.26
432	0.27
433	0.24
434	0.24
435	0.25
436	0.23
437	0.32
438	0.38
439	0.46
440	0.5
441	0.54
442	0.54
443	0.6
444	0.68
445	0.69
446	0.72
447	0.74
448	0.8
449	0.86
450	0.92
451	0.94

A0A1V2LC52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer