Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061AVX1

Protein Details
Accession A0A061AVX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-64SNPPTPLSIKRPPTKKKHLNPSIEIEKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-54AKRRRSSAASNPPTPLSIKRPPTKKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR034922  REX1-like_exo  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06145  REX1_like  
Amino Acid Sequences MAGLDDVAKIDINTTLHDEEKTKRLISMAKRRRSSAASNPPTPLSIKRPPTKKKHLNPSIEIEKAVHPQKEFKFSTLRDLALYTLQVGDNCPKYIKVKNRAQINNVVLVTTPGLDALTHFGATDIPPSTDNITEGLPVLKENFQEFVRLTAPGDRESVYPLMKSLSMRPFTKSEKSRITKELKDKKLVLPDLKMTLEEMTLNGYPIHPMTDAVIAGETPEGWIDTKKFAHDGSHTFALDCEMCETASGKTLTRISVIDFDETVIMDEYVKPAEEITDYLTQYSGITREILEGVTTTLEDIQRKLLEIISTDDFLIGHSLENDLKVMRLRHPNIIDTSVVFEHPRGPPFKSSLKYLTRVYLQRSIQNGEHDSIEDSKACLDLVKLKLVEGGLLGKVVDGQSVFEDLMKLEKKAVFIDRTRVQPNQERYIQCANEDDIVDTIIKKVPTHHLVIGNLRSDKESLSELNSRLEKILSALPPKTIFIVASGSGEQTEMRKLALEKKAHPELWTTEDEEKLREITRTTRLGVGFFKII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.2
4 0.22
5 0.25
6 0.26
7 0.32
8 0.35
9 0.31
10 0.3
11 0.32
12 0.38
13 0.45
14 0.52
15 0.55
16 0.61
17 0.64
18 0.67
19 0.69
20 0.67
21 0.64
22 0.64
23 0.65
24 0.63
25 0.63
26 0.63
27 0.58
28 0.54
29 0.49
30 0.43
31 0.4
32 0.41
33 0.46
34 0.52
35 0.61
36 0.7
37 0.77
38 0.83
39 0.86
40 0.87
41 0.89
42 0.9
43 0.88
44 0.84
45 0.83
46 0.79
47 0.69
48 0.6
49 0.51
50 0.44
51 0.42
52 0.43
53 0.37
54 0.31
55 0.38
56 0.42
57 0.49
58 0.47
59 0.43
60 0.46
61 0.44
62 0.51
63 0.47
64 0.43
65 0.34
66 0.33
67 0.31
68 0.24
69 0.24
70 0.15
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.13
75 0.18
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.2
80 0.24
81 0.33
82 0.4
83 0.45
84 0.52
85 0.57
86 0.66
87 0.69
88 0.69
89 0.69
90 0.62
91 0.58
92 0.49
93 0.42
94 0.32
95 0.28
96 0.23
97 0.15
98 0.12
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.12
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.13
129 0.15
130 0.14
131 0.16
132 0.16
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.19
139 0.17
140 0.19
141 0.17
142 0.16
143 0.18
144 0.2
145 0.16
146 0.15
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.18
152 0.23
153 0.27
154 0.28
155 0.31
156 0.35
157 0.38
158 0.46
159 0.44
160 0.44
161 0.5
162 0.54
163 0.56
164 0.59
165 0.61
166 0.6
167 0.66
168 0.69
169 0.64
170 0.66
171 0.63
172 0.59
173 0.61
174 0.58
175 0.5
176 0.43
177 0.39
178 0.36
179 0.33
180 0.29
181 0.21
182 0.16
183 0.14
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.06
210 0.06
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.15
217 0.16
218 0.18
219 0.2
220 0.22
221 0.21
222 0.2
223 0.2
224 0.18
225 0.16
226 0.13
227 0.09
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.06
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.11
242 0.14
243 0.15
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.06
251 0.05
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.08
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.08
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.1
312 0.11
313 0.16
314 0.24
315 0.26
316 0.32
317 0.34
318 0.36
319 0.35
320 0.35
321 0.3
322 0.22
323 0.22
324 0.16
325 0.15
326 0.13
327 0.11
328 0.13
329 0.15
330 0.19
331 0.18
332 0.2
333 0.22
334 0.27
335 0.33
336 0.31
337 0.33
338 0.37
339 0.4
340 0.42
341 0.41
342 0.39
343 0.39
344 0.4
345 0.4
346 0.4
347 0.37
348 0.38
349 0.39
350 0.39
351 0.35
352 0.37
353 0.34
354 0.27
355 0.26
356 0.22
357 0.21
358 0.19
359 0.17
360 0.13
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.13
368 0.15
369 0.19
370 0.18
371 0.18
372 0.2
373 0.2
374 0.19
375 0.12
376 0.12
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.08
391 0.07
392 0.13
393 0.14
394 0.14
395 0.16
396 0.18
397 0.19
398 0.22
399 0.28
400 0.27
401 0.28
402 0.36
403 0.37
404 0.42
405 0.45
406 0.44
407 0.45
408 0.48
409 0.52
410 0.52
411 0.54
412 0.5
413 0.51
414 0.57
415 0.52
416 0.44
417 0.4
418 0.34
419 0.29
420 0.28
421 0.23
422 0.15
423 0.15
424 0.15
425 0.12
426 0.12
427 0.13
428 0.13
429 0.12
430 0.16
431 0.23
432 0.27
433 0.31
434 0.34
435 0.35
436 0.38
437 0.44
438 0.44
439 0.41
440 0.39
441 0.35
442 0.32
443 0.28
444 0.25
445 0.21
446 0.2
447 0.16
448 0.2
449 0.25
450 0.24
451 0.3
452 0.31
453 0.3
454 0.28
455 0.27
456 0.22
457 0.19
458 0.24
459 0.23
460 0.27
461 0.27
462 0.29
463 0.3
464 0.31
465 0.3
466 0.24
467 0.2
468 0.16
469 0.18
470 0.15
471 0.16
472 0.16
473 0.14
474 0.13
475 0.14
476 0.13
477 0.12
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.15
482 0.18
483 0.27
484 0.34
485 0.38
486 0.41
487 0.49
488 0.57
489 0.55
490 0.54
491 0.5
492 0.46
493 0.46
494 0.43
495 0.39
496 0.34
497 0.37
498 0.37
499 0.34
500 0.31
501 0.28
502 0.27
503 0.25
504 0.24
505 0.26
506 0.33
507 0.35
508 0.35
509 0.38
510 0.37
511 0.39
512 0.38