Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V2LCR0

Protein Details
Accession A0A1V2LCR0    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-142QESLRKHAHRTNKRVNNNSNTNNHydrophilic
316-335VTPATRSSPRKRGRPPSVTPHydrophilic
400-450SVTPTAPPRRRGRPPSVTKMPNSVTPTAPPRKRGRPPGSKNGQRRSKRLAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-178KRGRGRPRR
210-219AARRRGRPPS
234-242SPRKRGRPP
259-282LRKRGRPPSLTPATGSPPRKRGRP
301-305RKRGR
321-347RSSPRKRGRPPSVTPATGLPPRKRGRP
407-419PRRRGRPPSVTKM
424-448TPTAPPRKRGRPPGSKNGQRRSKRL
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MSDFDVRTAFISFVDHLPSDIIRKLWLIQSLNIAYETQRDKLESILRKIRSPRGTQDGHNGDLVKETIKLSNHLTQLRREVLEESKSLATTIKIAKMQLGSQHEQLQHDHKMYQNEIELQESLRKHAHRTNKRVNNNSNTNNSSNVNSQKKATIQMSINQLIQEMNTPIKRGRGRPRRDEAEFIRQRRMQQEEELKKLRLMMVEEDAKAAARRRGRPPSATKMLEAVTPAAGSSPRKRGRPPSATKMLDSVTPTTRSSLRKRGRPPSLTPATGSPPRKRGRPPSVTTMLNSVTPATGAPPRKRGRPPSVTKMLDSVTPATRSSPRKRGRPPSVTPATGLPPRKRGRPPSVTTMLNSVTPSAPSRKRGRPPSVTTMLNSVTPAAPPRRRGRPPSVTTMLNSVTPTAPPRRRGRPPSVTKMPNSVTPTAPPRKRGRPPGSKNGQRRSKRLAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.16
4 0.17
5 0.18
6 0.19
7 0.19
8 0.18
9 0.16
10 0.17
11 0.2
12 0.22
13 0.28
14 0.27
15 0.26
16 0.33
17 0.33
18 0.32
19 0.3
20 0.27
21 0.21
22 0.25
23 0.26
24 0.22
25 0.22
26 0.23
27 0.22
28 0.27
29 0.35
30 0.36
31 0.41
32 0.47
33 0.48
34 0.53
35 0.59
36 0.63
37 0.62
38 0.61
39 0.6
40 0.6
41 0.62
42 0.59
43 0.63
44 0.58
45 0.52
46 0.49
47 0.41
48 0.33
49 0.31
50 0.29
51 0.19
52 0.16
53 0.15
54 0.17
55 0.17
56 0.2
57 0.22
58 0.28
59 0.33
60 0.38
61 0.39
62 0.39
63 0.45
64 0.46
65 0.42
66 0.37
67 0.35
68 0.34
69 0.34
70 0.3
71 0.28
72 0.25
73 0.24
74 0.23
75 0.2
76 0.16
77 0.17
78 0.2
79 0.21
80 0.21
81 0.21
82 0.24
83 0.24
84 0.25
85 0.27
86 0.3
87 0.29
88 0.3
89 0.35
90 0.35
91 0.35
92 0.36
93 0.35
94 0.33
95 0.31
96 0.31
97 0.29
98 0.31
99 0.31
100 0.3
101 0.27
102 0.27
103 0.26
104 0.25
105 0.22
106 0.19
107 0.22
108 0.2
109 0.21
110 0.22
111 0.22
112 0.25
113 0.31
114 0.41
115 0.46
116 0.56
117 0.64
118 0.69
119 0.77
120 0.82
121 0.83
122 0.82
123 0.81
124 0.76
125 0.72
126 0.67
127 0.59
128 0.52
129 0.45
130 0.38
131 0.35
132 0.37
133 0.36
134 0.32
135 0.32
136 0.33
137 0.33
138 0.36
139 0.31
140 0.29
141 0.25
142 0.29
143 0.34
144 0.33
145 0.32
146 0.26
147 0.25
148 0.2
149 0.18
150 0.15
151 0.1
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.14
156 0.21
157 0.25
158 0.31
159 0.4
160 0.47
161 0.55
162 0.63
163 0.7
164 0.7
165 0.69
166 0.68
167 0.62
168 0.63
169 0.62
170 0.55
171 0.53
172 0.49
173 0.48
174 0.47
175 0.46
176 0.37
177 0.37
178 0.45
179 0.43
180 0.48
181 0.49
182 0.44
183 0.39
184 0.38
185 0.32
186 0.24
187 0.2
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.17
199 0.23
200 0.3
201 0.38
202 0.41
203 0.47
204 0.52
205 0.56
206 0.58
207 0.54
208 0.47
209 0.4
210 0.37
211 0.31
212 0.24
213 0.16
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.08
220 0.11
221 0.2
222 0.25
223 0.28
224 0.32
225 0.4
226 0.49
227 0.57
228 0.61
229 0.6
230 0.65
231 0.63
232 0.6
233 0.53
234 0.44
235 0.35
236 0.3
237 0.24
238 0.17
239 0.18
240 0.18
241 0.18
242 0.22
243 0.26
244 0.3
245 0.38
246 0.42
247 0.48
248 0.56
249 0.64
250 0.68
251 0.68
252 0.68
253 0.67
254 0.66
255 0.58
256 0.51
257 0.44
258 0.4
259 0.41
260 0.41
261 0.36
262 0.39
263 0.42
264 0.47
265 0.51
266 0.57
267 0.6
268 0.64
269 0.64
270 0.64
271 0.66
272 0.61
273 0.55
274 0.47
275 0.38
276 0.29
277 0.25
278 0.17
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.13
284 0.19
285 0.22
286 0.31
287 0.35
288 0.43
289 0.5
290 0.58
291 0.62
292 0.65
293 0.7
294 0.7
295 0.77
296 0.71
297 0.64
298 0.57
299 0.48
300 0.39
301 0.32
302 0.26
303 0.19
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.26
308 0.32
309 0.39
310 0.46
311 0.51
312 0.59
313 0.69
314 0.77
315 0.8
316 0.81
317 0.79
318 0.79
319 0.78
320 0.69
321 0.6
322 0.52
323 0.46
324 0.44
325 0.45
326 0.38
327 0.41
328 0.45
329 0.52
330 0.57
331 0.62
332 0.66
333 0.68
334 0.69
335 0.67
336 0.69
337 0.61
338 0.54
339 0.47
340 0.38
341 0.3
342 0.26
343 0.19
344 0.15
345 0.15
346 0.18
347 0.22
348 0.27
349 0.33
350 0.41
351 0.49
352 0.58
353 0.66
354 0.73
355 0.74
356 0.77
357 0.78
358 0.75
359 0.66
360 0.57
361 0.5
362 0.42
363 0.32
364 0.25
365 0.18
366 0.13
367 0.13
368 0.19
369 0.25
370 0.29
371 0.36
372 0.44
373 0.53
374 0.61
375 0.68
376 0.72
377 0.74
378 0.74
379 0.76
380 0.73
381 0.64
382 0.56
383 0.51
384 0.41
385 0.33
386 0.27
387 0.2
388 0.16
389 0.17
390 0.22
391 0.29
392 0.34
393 0.41
394 0.49
395 0.57
396 0.67
397 0.74
398 0.79
399 0.8
400 0.83
401 0.85
402 0.86
403 0.84
404 0.76
405 0.76
406 0.68
407 0.64
408 0.6
409 0.53
410 0.45
411 0.44
412 0.5
413 0.52
414 0.55
415 0.56
416 0.6
417 0.67
418 0.75
419 0.8
420 0.81
421 0.82
422 0.86
423 0.89
424 0.91
425 0.9
426 0.91
427 0.9
428 0.9
429 0.87
430 0.85