Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V2LBC2

Protein Details
Accession A0A1V2LBC2    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-51VYATCHRRKEKQCAAEFKELHydrophilic
87-113SLKKELESLKQKPKNKKEKIRHIDLGCHydrophilic
275-298GASGVKKEEKKEEKKEKEEEQTTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-105KQKPKNKKEK
281-289KEEKKEEKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MGEKRKNDGGSGANRKKYKVNNGIIDPSTSGVYATCHRRKEKQCAAEFKELLEEAAEELYGDKMREEDNEDSDDNDDEGEELSIEESLKKELESLKQKPKNKKEKIRHIDLGCECVVFIKTRKPIVPEEIVAKICKDATESKTKNTRFTQKLTPITYSVSATMEEVEKLAKRVLAPHFHKDQGQEPHTFAIKVSARNFNSIPKGDILQKVAQCVGKDHGHKVDLKKYEKLILVECFKNNIGMSVVDDYDKYQKYNLQQIFEKNAGDVPSGDSRVGASGVKKEEKKEEKKEKEEEQTTKSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.64
4 0.65
5 0.65
6 0.64
7 0.65
8 0.65
9 0.68
10 0.72
11 0.65
12 0.58
13 0.48
14 0.39
15 0.3
16 0.22
17 0.17
18 0.1
19 0.12
20 0.16
21 0.25
22 0.31
23 0.38
24 0.43
25 0.53
26 0.61
27 0.69
28 0.74
29 0.73
30 0.76
31 0.78
32 0.8
33 0.8
34 0.72
35 0.61
36 0.55
37 0.45
38 0.37
39 0.27
40 0.2
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.11
53 0.16
54 0.17
55 0.19
56 0.22
57 0.22
58 0.22
59 0.22
60 0.21
61 0.16
62 0.13
63 0.1
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.12
79 0.2
80 0.28
81 0.36
82 0.45
83 0.53
84 0.61
85 0.7
86 0.77
87 0.8
88 0.82
89 0.85
90 0.85
91 0.88
92 0.89
93 0.87
94 0.84
95 0.74
96 0.72
97 0.62
98 0.55
99 0.43
100 0.35
101 0.26
102 0.19
103 0.18
104 0.11
105 0.12
106 0.15
107 0.18
108 0.22
109 0.23
110 0.26
111 0.28
112 0.31
113 0.32
114 0.27
115 0.26
116 0.26
117 0.26
118 0.23
119 0.2
120 0.15
121 0.13
122 0.11
123 0.11
124 0.13
125 0.16
126 0.26
127 0.27
128 0.32
129 0.4
130 0.41
131 0.46
132 0.46
133 0.51
134 0.44
135 0.48
136 0.5
137 0.5
138 0.54
139 0.5
140 0.47
141 0.38
142 0.36
143 0.32
144 0.25
145 0.18
146 0.13
147 0.11
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.13
160 0.18
161 0.26
162 0.29
163 0.34
164 0.37
165 0.37
166 0.39
167 0.35
168 0.38
169 0.37
170 0.36
171 0.32
172 0.3
173 0.31
174 0.3
175 0.28
176 0.21
177 0.2
178 0.2
179 0.23
180 0.25
181 0.31
182 0.31
183 0.34
184 0.35
185 0.32
186 0.34
187 0.31
188 0.29
189 0.23
190 0.24
191 0.25
192 0.26
193 0.26
194 0.26
195 0.25
196 0.25
197 0.26
198 0.26
199 0.22
200 0.22
201 0.23
202 0.24
203 0.25
204 0.27
205 0.29
206 0.29
207 0.34
208 0.36
209 0.4
210 0.43
211 0.44
212 0.45
213 0.43
214 0.46
215 0.45
216 0.42
217 0.38
218 0.36
219 0.37
220 0.36
221 0.34
222 0.32
223 0.29
224 0.29
225 0.25
226 0.2
227 0.16
228 0.13
229 0.15
230 0.14
231 0.14
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.19
236 0.2
237 0.19
238 0.19
239 0.23
240 0.28
241 0.37
242 0.39
243 0.37
244 0.41
245 0.45
246 0.49
247 0.47
248 0.42
249 0.33
250 0.32
251 0.28
252 0.24
253 0.2
254 0.18
255 0.2
256 0.22
257 0.21
258 0.18
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.16
263 0.13
264 0.18
265 0.25
266 0.32
267 0.35
268 0.38
269 0.48
270 0.56
271 0.64
272 0.69
273 0.74
274 0.76
275 0.82
276 0.86
277 0.84
278 0.84
279 0.84
280 0.79