Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V2LCG2

Protein Details
Accession A0A1V2LCG2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-148LQYSPDKRVKEKKVKQQEQDFNVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 12.5, nucl 12, mito_nucl 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034244  Rrt5_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12409  RRM1_RRT5  
Amino Acid Sequences MSATEFIKSAEAEAVEPVDAAVNIEEEAHVSASSVEKPPSSSIHRLYINNVNYQTTESDLYDLLKEFKVLSVLVPSHTVRGFKGAKQKSLGIAYVEFKSANEALLAKDAINGKELNGRSLRVKPFLQYSPDKRVKEKKVKQQEQDFNVCPDLVEDNTDPAVKSHHSESVHMEDTEDQVEKIIKPPVSDDTIFIHRLHRKTTDGNLREFFYEYVPTEVYIFKSHVKTGVTKPLFRHRYVSALITLSAEGAIEKALIELKGKKLKGRHISFKPAYLSKIEEVKNAAQAQHVKLEKVGKDLASAGPCATSATCSAKDSCSDCDCQEDNCCSVDNGQVSKPITGVDDDDEMALSGAPKETEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.12
4 0.1
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.08
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.1
20 0.13
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.18
25 0.21
26 0.25
27 0.3
28 0.34
29 0.35
30 0.41
31 0.45
32 0.45
33 0.48
34 0.51
35 0.47
36 0.46
37 0.43
38 0.37
39 0.33
40 0.33
41 0.29
42 0.22
43 0.21
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.16
48 0.15
49 0.15
50 0.15
51 0.13
52 0.13
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.11
57 0.11
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.17
62 0.17
63 0.19
64 0.2
65 0.2
66 0.16
67 0.23
68 0.25
69 0.26
70 0.36
71 0.37
72 0.4
73 0.42
74 0.44
75 0.4
76 0.4
77 0.37
78 0.29
79 0.26
80 0.24
81 0.22
82 0.21
83 0.17
84 0.14
85 0.16
86 0.14
87 0.12
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.12
92 0.12
93 0.09
94 0.12
95 0.14
96 0.13
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.19
101 0.19
102 0.2
103 0.19
104 0.2
105 0.21
106 0.28
107 0.31
108 0.29
109 0.29
110 0.27
111 0.32
112 0.33
113 0.36
114 0.37
115 0.39
116 0.45
117 0.53
118 0.52
119 0.53
120 0.6
121 0.64
122 0.68
123 0.71
124 0.71
125 0.75
126 0.81
127 0.83
128 0.83
129 0.81
130 0.76
131 0.74
132 0.64
133 0.55
134 0.47
135 0.39
136 0.28
137 0.21
138 0.16
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.1
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.19
155 0.22
156 0.23
157 0.22
158 0.2
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.13
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.14
172 0.16
173 0.18
174 0.19
175 0.17
176 0.17
177 0.19
178 0.2
179 0.19
180 0.23
181 0.24
182 0.25
183 0.26
184 0.26
185 0.26
186 0.27
187 0.34
188 0.39
189 0.37
190 0.39
191 0.38
192 0.37
193 0.35
194 0.33
195 0.26
196 0.17
197 0.16
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.18
211 0.18
212 0.21
213 0.24
214 0.33
215 0.32
216 0.33
217 0.36
218 0.44
219 0.47
220 0.44
221 0.44
222 0.35
223 0.37
224 0.35
225 0.34
226 0.25
227 0.22
228 0.21
229 0.17
230 0.16
231 0.11
232 0.09
233 0.07
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.05
241 0.06
242 0.08
243 0.11
244 0.18
245 0.25
246 0.26
247 0.3
248 0.34
249 0.43
250 0.51
251 0.56
252 0.6
253 0.6
254 0.69
255 0.67
256 0.67
257 0.62
258 0.54
259 0.48
260 0.41
261 0.37
262 0.3
263 0.35
264 0.31
265 0.28
266 0.3
267 0.3
268 0.33
269 0.31
270 0.28
271 0.25
272 0.29
273 0.28
274 0.32
275 0.31
276 0.26
277 0.28
278 0.34
279 0.31
280 0.31
281 0.32
282 0.24
283 0.24
284 0.25
285 0.26
286 0.21
287 0.21
288 0.17
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.12
293 0.1
294 0.12
295 0.16
296 0.18
297 0.2
298 0.22
299 0.23
300 0.26
301 0.28
302 0.3
303 0.29
304 0.31
305 0.29
306 0.34
307 0.34
308 0.32
309 0.35
310 0.33
311 0.31
312 0.28
313 0.29
314 0.22
315 0.23
316 0.25
317 0.24
318 0.23
319 0.23
320 0.28
321 0.28
322 0.28
323 0.27
324 0.22
325 0.2
326 0.18
327 0.19
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.15
333 0.13
334 0.12
335 0.1
336 0.08
337 0.08
338 0.09