FuNGI

A0A1V2L8P7

Protein Details

Accession

A0A1V2L8P7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
332-357	EKEMEAKKSKKSKKKANAAKRGKGDE	Basic
489-513	PPPPPAPPSQREKKPEQKQEPEFDY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
337-355	AKKSKKSKKKANAAKRGKG

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12.833, nucl 12.5, cyto 11, mito_nucl 7.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MGDITGEKSLVEAAENPVSEVVADEIAIDDTAPVVQGDEMTINDQLASTEGVDAIPQEINAVNGPEQSETVNDEPETVPEKVSMNEEGGVPQDLAEIATVDVTGDDFLGDILKKADERVPPAANDDGTSDSDDSSDDSDSDSSSNSDSGSSDDDDEEEEEEEEEEENDVKVMDGETSDNEQDASGPIISKNEVVDEPADQLPADFSIAETEPIHHVGHIIGFVEKSIIIKGVISGELRFLKEGSVLCLEDRTPIGYLFEIFGPVAFPMYRVKFNTVEDLEKFKDKKKQKVFYVVPKSDFEFTDRIKSIKGSDASNFNDEEIPEEEQEFSDDEKEMEAKKSKKSKKKANAAKRGKGDESTEGPTAKKQQPPQRSNPYKASNHAIPAAGGYQSRSERDHSRGSRYSQPQAHQYPSNGMPGMSQMPQMPSFPMMMPIPGMPQMPGMQMPMMQMQGQQPQMSPMQMQQFFQMQQMMMMQQMAQGGHPAPAPPPPPPPAPPSQREKKPEQKQEPEFDY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.18
4	0.17
5	0.17
6	0.15
7	0.14
8	0.11
9	0.07
10	0.07
11	0.06
12	0.07
13	0.07
14	0.07
15	0.06
16	0.05
17	0.05
18	0.05
19	0.06
20	0.05
21	0.05
22	0.05
23	0.05
24	0.07
25	0.07
26	0.08
27	0.1
28	0.1
29	0.1
30	0.1
31	0.09
32	0.09
33	0.09
34	0.09
35	0.07
36	0.07
37	0.08
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.1
50	0.11
51	0.13
52	0.12
53	0.12
54	0.12
55	0.12
56	0.15
57	0.16
58	0.17
59	0.16
60	0.17
61	0.17
62	0.19
63	0.23
64	0.19
65	0.18
66	0.17
67	0.19
68	0.18
69	0.2
70	0.19
71	0.16
72	0.16
73	0.16
74	0.15
75	0.15
76	0.15
77	0.12
78	0.1
79	0.09
80	0.08
81	0.08
82	0.07
83	0.06
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.04
88	0.04
89	0.04
90	0.04
91	0.04
92	0.04
93	0.03
94	0.04
95	0.05
96	0.06
97	0.06
98	0.07
99	0.08
100	0.08
101	0.1
102	0.16
103	0.17
104	0.22
105	0.28
106	0.29
107	0.29
108	0.32
109	0.32
110	0.27
111	0.24
112	0.21
113	0.18
114	0.16
115	0.17
116	0.14
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.11
121	0.1
122	0.09
123	0.08
124	0.08
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.09
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.09
136	0.11
137	0.11
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.11
144	0.09
145	0.08
146	0.07
147	0.08
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.06
162	0.07
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.11
184	0.11
185	0.11
186	0.09
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.07
191	0.04
192	0.04
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.09
199	0.11
200	0.11
201	0.09
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.09
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.09
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.04
253	0.05
254	0.08
255	0.1
256	0.13
257	0.14
258	0.17
259	0.19
260	0.19
261	0.24
262	0.22
263	0.23
264	0.22
265	0.25
266	0.23
267	0.26
268	0.26
269	0.25
270	0.33
271	0.37
272	0.46
273	0.52
274	0.59
275	0.59
276	0.68
277	0.7
278	0.72
279	0.75
280	0.68
281	0.61
282	0.54
283	0.5
284	0.42
285	0.36
286	0.28
287	0.22
288	0.2
289	0.24
290	0.23
291	0.22
292	0.21
293	0.21
294	0.2
295	0.22
296	0.23
297	0.18
298	0.2
299	0.25
300	0.26
301	0.27
302	0.25
303	0.2
304	0.19
305	0.17
306	0.18
307	0.14
308	0.14
309	0.12
310	0.13
311	0.12
312	0.11
313	0.12
314	0.1
315	0.09
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.1
321	0.1
322	0.14
323	0.2
324	0.22
325	0.3
326	0.4
327	0.49
328	0.58
329	0.67
330	0.73
331	0.77
332	0.85
333	0.88
334	0.88
335	0.9
336	0.9
337	0.88
338	0.83
339	0.78
340	0.69
341	0.61
342	0.52
343	0.46
344	0.4
345	0.36
346	0.31
347	0.27
348	0.25
349	0.26
350	0.31
351	0.32
352	0.35
353	0.39
354	0.46
355	0.56
356	0.63
357	0.71
358	0.74
359	0.76
360	0.76
361	0.77
362	0.76
363	0.69
364	0.65
365	0.62
366	0.53
367	0.48
368	0.44
369	0.35
370	0.27
371	0.24
372	0.21
373	0.15
374	0.12
375	0.11
376	0.13
377	0.15
378	0.17
379	0.18
380	0.21
381	0.25
382	0.3
383	0.39
384	0.39
385	0.45
386	0.49
387	0.52
388	0.57
389	0.58
390	0.62
391	0.58
392	0.57
393	0.58
394	0.58
395	0.58
396	0.52
397	0.48
398	0.45
399	0.41
400	0.41
401	0.32
402	0.27
403	0.22
404	0.21
405	0.22
406	0.17
407	0.17
408	0.14
409	0.17
410	0.18
411	0.19
412	0.18
413	0.16
414	0.17
415	0.15
416	0.17
417	0.14
418	0.14
419	0.14
420	0.13
421	0.14
422	0.14
423	0.14
424	0.11
425	0.13
426	0.13
427	0.14
428	0.14
429	0.13
430	0.12
431	0.12
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.12
436	0.14
437	0.16
438	0.22
439	0.23
440	0.23
441	0.21
442	0.23
443	0.25
444	0.24
445	0.21
446	0.21
447	0.27
448	0.28
449	0.29
450	0.28
451	0.31
452	0.31
453	0.32
454	0.3
455	0.2
456	0.19
457	0.2
458	0.18
459	0.14
460	0.14
461	0.11
462	0.1
463	0.12
464	0.11
465	0.1
466	0.12
467	0.12
468	0.13
469	0.14
470	0.13
471	0.13
472	0.19
473	0.21
474	0.22
475	0.28
476	0.31
477	0.35
478	0.39
479	0.44
480	0.48
481	0.54
482	0.58
483	0.61
484	0.67
485	0.71
486	0.74
487	0.78
488	0.79
489	0.82
490	0.86
491	0.86
492	0.87
493	0.86

A0A1V2L8P7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer