FuNGI

A0A1V2L0A5

Protein Details

Accession

A0A1V2L0A5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-123	GVAPRAKMNQQRSRRFRSARD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSRKYPKIISPTLEEEAKVVDGVLMPPQYSNPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPAPETEDEMLLAVFEYTDRVLNMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSARDAQIQDEARDKLAQETKDFGEVIEESIKKKKTWDSNAITPGTPFMDKLALGLRYWTAYKLATDPGWKDLQIIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRSDIEYNPNTRHAIYGLDADLIFLGLATHEPHFRVLREDVFAQDNRFMSLKDQMNMTEEQKARLHEEDSKKPFLWLNINVLREYLEIELNIPRLSFKFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPSLDVRDNSIDLLVSLWKQSLPRMKTYITCDGTLNLENVQILLSALGPREDDIFRARQAQEQRRAGFDKRRKTQQQQERTVNNHFSSNITKGKDRGTFKPVDNIPVFDVDGNSVGKVNMTNSDAVKMRTQVTLAGMGDDKAQKELEQLNASDAGSTEPTEVKPEVVESANKANLSAAAALRQQLLTNKTNKESSSSTSSVVPEKRKASEESPSNSASEPGSPIPAHLDDEDPVKLYEPGYQNRYYKSKFHITDAEVPEFRNQVVKHYVEGISWVLLYYYQGCPSWNWYYPYHYAPFASDFMSVELKDLNIEFIQGEPFLPYEQLMSVLPAASGHTLPPIFRPLMSEPDSPIIDFYPEDFPIDMNGKKASWQGIVLLPFIDEKRLLDVVRAQYPKLTDAERSRNVRKNEVLVVSKHNPNYNKYAKIYQDKDIHEVDFHFHKSSLAGIVSANAGYDLEGVLDCPVKGDHAYTDIPMSLFMQLDYEMPRKTTGKSIILTGYIKHRPVLTQEDKDAIIYGNNNNNGRGGGRRNYYNAQQTAENIIEVGPYGDSHYSVRFGGFKSFLLLAQQHQAGLQKQQRVKDFMQGQGHHNRYENPNRYENPNMPRPSRNGVLRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.63
3	0.66
4	0.68
5	0.63
6	0.6
7	0.59
8	0.57
9	0.5
10	0.43
11	0.35
12	0.3
13	0.26
14	0.19
15	0.13
16	0.1
17	0.09
18	0.1
19	0.14
20	0.13
21	0.12
22	0.13
23	0.15
24	0.2
25	0.23
26	0.28
27	0.28
28	0.34
29	0.35
30	0.37
31	0.38
32	0.34
33	0.34
34	0.3
35	0.27
36	0.22
37	0.21
38	0.18
39	0.15
40	0.13
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.18
49	0.24
50	0.26
51	0.34
52	0.42
53	0.46
54	0.5
55	0.5
56	0.49
57	0.47
58	0.47
59	0.4
60	0.33
61	0.28
62	0.23
63	0.2
64	0.15
65	0.12
66	0.07
67	0.06
68	0.04
69	0.05
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.09
74	0.1
75	0.16
76	0.25
77	0.33
78	0.36
79	0.37
80	0.39
81	0.4
82	0.41
83	0.39
84	0.32
85	0.28
86	0.26
87	0.24
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.55
100	0.66
101	0.74
102	0.8
103	0.84
104	0.82
105	0.79
106	0.8
107	0.79
108	0.78
109	0.79
110	0.73
111	0.65
112	0.67
113	0.61
114	0.53
115	0.48
116	0.39
117	0.31
118	0.29
119	0.27
120	0.26
121	0.3
122	0.31
123	0.27
124	0.31
125	0.3
126	0.32
127	0.31
128	0.23
129	0.2
130	0.18
131	0.18
132	0.21
133	0.2
134	0.2
135	0.27
136	0.3
137	0.28
138	0.32
139	0.38
140	0.42
141	0.51
142	0.58
143	0.59
144	0.65
145	0.71
146	0.68
147	0.6
148	0.5
149	0.42
150	0.34
151	0.27
152	0.18
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.13
157	0.16
158	0.15
159	0.15
160	0.16
161	0.15
162	0.15
163	0.16
164	0.16
165	0.13
166	0.12
167	0.14
168	0.15
169	0.17
170	0.18
171	0.21
172	0.22
173	0.24
174	0.25
175	0.24
176	0.23
177	0.21
178	0.22
179	0.18
180	0.18
181	0.14
182	0.13
183	0.13
184	0.12
185	0.1
186	0.07
187	0.07
188	0.06
189	0.07
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.17
198	0.22
199	0.29
200	0.3
201	0.32
202	0.32
203	0.35
204	0.36
205	0.35
206	0.4
207	0.37
208	0.41
209	0.41
210	0.41
211	0.38
212	0.35
213	0.33
214	0.24
215	0.21
216	0.16
217	0.16
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.12
222	0.11
223	0.09
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.2
238	0.21
239	0.22
240	0.22
241	0.21
242	0.24
243	0.25
244	0.22
245	0.23
246	0.21
247	0.2
248	0.19
249	0.17
250	0.15
251	0.22
252	0.24
253	0.22
254	0.22
255	0.21
256	0.24
257	0.26
258	0.26
259	0.25
260	0.22
261	0.24
262	0.26
263	0.27
264	0.27
265	0.26
266	0.27
267	0.28
268	0.34
269	0.41
270	0.44
271	0.47
272	0.44
273	0.43
274	0.43
275	0.38
276	0.38
277	0.31
278	0.34
279	0.35
280	0.36
281	0.34
282	0.32
283	0.29
284	0.23
285	0.21
286	0.14
287	0.09
288	0.08
289	0.09
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.14
297	0.14
298	0.14
299	0.18
300	0.19
301	0.23
302	0.24
303	0.25
304	0.21
305	0.23
306	0.21
307	0.16
308	0.15
309	0.12
310	0.11
311	0.08
312	0.09
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.09
319	0.11
320	0.11
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.11
325	0.11
326	0.14
327	0.19
328	0.18
329	0.17
330	0.18
331	0.18
332	0.17
333	0.17
334	0.12
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.12
344	0.19
345	0.21
346	0.25
347	0.27
348	0.29
349	0.32
350	0.37
351	0.42
352	0.36
353	0.35
354	0.31
355	0.29
356	0.3
357	0.26
358	0.21
359	0.13
360	0.11
361	0.09
362	0.09
363	0.08
364	0.06
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.11
377	0.13
378	0.13
379	0.18
380	0.19
381	0.21
382	0.3
383	0.38
384	0.44
385	0.48
386	0.48
387	0.46
388	0.5
389	0.49
390	0.5
391	0.49
392	0.5
393	0.5
394	0.59
395	0.63
396	0.68
397	0.73
398	0.73
399	0.76
400	0.76
401	0.77
402	0.73
403	0.7
404	0.66
405	0.6
406	0.51
407	0.41
408	0.33
409	0.27
410	0.24
411	0.25
412	0.25
413	0.22
414	0.22
415	0.23
416	0.27
417	0.32
418	0.33
419	0.33
420	0.34
421	0.37
422	0.36
423	0.43
424	0.38
425	0.37
426	0.34
427	0.3
428	0.25
429	0.22
430	0.21
431	0.13
432	0.13
433	0.07
434	0.08
435	0.07
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.07
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.11
447	0.12
448	0.13
449	0.14
450	0.14
451	0.14
452	0.13
453	0.13
454	0.12
455	0.11
456	0.12
457	0.11
458	0.1
459	0.09
460	0.09
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.1
468	0.12
469	0.13
470	0.13
471	0.13
472	0.13
473	0.14
474	0.14
475	0.11
476	0.1
477	0.07
478	0.06
479	0.07
480	0.07
481	0.06
482	0.07
483	0.09
484	0.09
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.09
490	0.1
491	0.09
492	0.12
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.11
497	0.1
498	0.11
499	0.1
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.11
508	0.15
509	0.18
510	0.23
511	0.24
512	0.26
513	0.28
514	0.28
515	0.28
516	0.26
517	0.25
518	0.27
519	0.26
520	0.25
521	0.24
522	0.25
523	0.26
524	0.29
525	0.29
526	0.27
527	0.29
528	0.3
529	0.31
530	0.33
531	0.31
532	0.33
533	0.35
534	0.34
535	0.35
536	0.34
537	0.32
538	0.29
539	0.27
540	0.2
541	0.15
542	0.13
543	0.1
544	0.11
545	0.1
546	0.1
547	0.12
548	0.12
549	0.12
550	0.11
551	0.12
552	0.1
553	0.12
554	0.12
555	0.11
556	0.1
557	0.1
558	0.1
559	0.09
560	0.14
561	0.17
562	0.21
563	0.24
564	0.29
565	0.3
566	0.33
567	0.39
568	0.36
569	0.36
570	0.38
571	0.43
572	0.39
573	0.41
574	0.43
575	0.41
576	0.47
577	0.47
578	0.45
579	0.36
580	0.36
581	0.33
582	0.28
583	0.24
584	0.21
585	0.17
586	0.17
587	0.22
588	0.22
589	0.21
590	0.23
591	0.24
592	0.18
593	0.2
594	0.16
595	0.11
596	0.1
597	0.09
598	0.06
599	0.05
600	0.06
601	0.07
602	0.08
603	0.09
604	0.09
605	0.1
606	0.11
607	0.16
608	0.21
609	0.22
610	0.25
611	0.25
612	0.3
613	0.32
614	0.35
615	0.32
616	0.28
617	0.24
618	0.22
619	0.23
620	0.19
621	0.17
622	0.14
623	0.12
624	0.13
625	0.14
626	0.12
627	0.1
628	0.1
629	0.09
630	0.09
631	0.08
632	0.08
633	0.06
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.06
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.07
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.07
652	0.07
653	0.06
654	0.07
655	0.07
656	0.07
657	0.06
658	0.09
659	0.09
660	0.09
661	0.11
662	0.14
663	0.13
664	0.13
665	0.18
666	0.18
667	0.24
668	0.28
669	0.27
670	0.25
671	0.29
672	0.29
673	0.25
674	0.23
675	0.16
676	0.13
677	0.12
678	0.12
679	0.12
680	0.12
681	0.13
682	0.13
683	0.12
684	0.14
685	0.18
686	0.16
687	0.14
688	0.16
689	0.15
690	0.16
691	0.18
692	0.18
693	0.16
694	0.15
695	0.16
696	0.18
697	0.19
698	0.18
699	0.16
700	0.13
701	0.14
702	0.14
703	0.13
704	0.1
705	0.09
706	0.12
707	0.14
708	0.14
709	0.14
710	0.2
711	0.23
712	0.3
713	0.31
714	0.27
715	0.28
716	0.29
717	0.29
718	0.26
719	0.23
720	0.22
721	0.28
722	0.37
723	0.43
724	0.48
725	0.55
726	0.6
727	0.62
728	0.63
729	0.58
730	0.54
731	0.52
732	0.5
733	0.46
734	0.41
735	0.45
736	0.43
737	0.45
738	0.43
739	0.44
740	0.42
741	0.42
742	0.49
743	0.48
744	0.48
745	0.47
746	0.51
747	0.52
748	0.58
749	0.58
750	0.57
751	0.58
752	0.54
753	0.55
754	0.5
755	0.43
756	0.35
757	0.32
758	0.28
759	0.24
760	0.24
761	0.21
762	0.19
763	0.19
764	0.18
765	0.18
766	0.17
767	0.13
768	0.12
769	0.1
770	0.11
771	0.11
772	0.1
773	0.09
774	0.06
775	0.06
776	0.05
777	0.06
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.05
782	0.06
783	0.07
784	0.07
785	0.08
786	0.08
787	0.09
788	0.09
789	0.1
790	0.1
791	0.14
792	0.15
793	0.14
794	0.16
795	0.15
796	0.15
797	0.14
798	0.14
799	0.11
800	0.1
801	0.1
802	0.09
803	0.09
804	0.1
805	0.14
806	0.17
807	0.16
808	0.17
809	0.21
810	0.22
811	0.24
812	0.3
813	0.32
814	0.34
815	0.35
816	0.37
817	0.35
818	0.37
819	0.36
820	0.3
821	0.32
822	0.32
823	0.32
824	0.3
825	0.29
826	0.27
827	0.32
828	0.4
829	0.4
830	0.4
831	0.41
832	0.43
833	0.42
834	0.4
835	0.35
836	0.26
837	0.2
838	0.18
839	0.21
840	0.25
841	0.31
842	0.31
843	0.31
844	0.31
845	0.3
846	0.28
847	0.29
848	0.28
849	0.29
850	0.33
851	0.37
852	0.42
853	0.46
854	0.51
855	0.54
856	0.51
857	0.46
858	0.43
859	0.41
860	0.4
861	0.36
862	0.29
863	0.2
864	0.17
865	0.14
866	0.13
867	0.11
868	0.06
869	0.06
870	0.08
871	0.09
872	0.1
873	0.12
874	0.14
875	0.15
876	0.15
877	0.17
878	0.17
879	0.18
880	0.23
881	0.23
882	0.22
883	0.23
884	0.24
885	0.22
886	0.24
887	0.24
888	0.21
889	0.25
890	0.25
891	0.22
892	0.22
893	0.26
894	0.24
895	0.32
896	0.35
897	0.38
898	0.42
899	0.49
900	0.54
901	0.56
902	0.55
903	0.56
904	0.55
905	0.55
906	0.59
907	0.56
908	0.56
909	0.59
910	0.61
911	0.55
912	0.52
913	0.5
914	0.5
915	0.58
916	0.61
917	0.57
918	0.62
919	0.63
920	0.66
921	0.68
922	0.67
923	0.65
924	0.65
925	0.66
926	0.62
927	0.65
928	0.64
929	0.63
930	0.63

A0A1V2L0A5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer