FuNGI

A0A1V2L605

Protein Details

Accession

A0A1V2L605

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-30	TEVVKRRKVSVGKKAVKPRLFS	Hydrophilic
719-745	LNIDTIKQRNKPKEAPKKPKNAPFFLQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-22	RKVSVGKK
727-738	RNKPKEAPKKPK

Subcellular Location(s)

mito 12, cyto 7, mito_nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024977 Apc4-like_WD40_dom IPR011047 Quinoprotein_ADH-like_supfam IPR007319 SSU_processome_Utp21 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF12894 ANAPC4_WD40 PF04192 Utp21 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MLTASMTTTEVVKRRKVSVGKKAVKPRLFSPFRTIGQTTTGLPFAVGTLGSTFYIATSVGRSFQIFDANTLHLLFVTQGELSSEITALAAHYHYVYAAYGEEIGIFKRGRLEHSMTVEGGVKRLLVFGDYLIGSNNKTVFVFKKSAGMKVATEFYTKFGLEDDIVGIVHPPTYLNKIVVLTATGLSIYNIHSGKLLYSTSFSYTMTAIECAPVLDIVALGTTTGEVILYNIKKGKTLRTMTTKSSVTSISFRTDGPAHLCIGHTSGDLTFFDLDRNARIHVLNAHRETHGGVSKAQFLNGQPIIVTNGGDNHLKEFVFDPPLSSNAAVVAPPRYLRSRGGHAAPVTSFEFADDDGHYILSGSRDKSVWKFSLRKDAQSQEMSQRAHKRTDGKREGGIKDKFPEVIGMAVENTRVGEWENVVTAHEGENVARTWDSHSRRVGRHKLATIDGGVVKSVAASPCGNFALVGSSNGGIGVHNLQSGQLRKKYNLHKKAVTGLALDGMNRKMVSCGLDGVVGFYDFSQSKYLGKLVLDAPITSMVYHRSSDLFALALDDLSVVVVDAVTHKVVRVFWGHSNRITAMAFSPDGRWIVTAALDSTIRTWDIPTGLCIDGIRVSHVATNIKFSPVGDFLATTHVARIGISLWTNRAQFRPVSTRNVEEDEFTDVSLSMISDDVTLLDGAFDEEVEEEYTNHYESVDQIDNSLLTLSLGPRSKFQTLLNIDTIKQRNKPKEAPKKPKNAPFFLQLSGAQIGDEASVREGKTAILSKNGDDQDDETKLHAMKPVNGTFESEFTRLLRVCSGKSDYAEFVKYFTLASPAVTDLEIKTMSSVDLTEMKYFVEALTQGFKSNTDVDLIEAWMTIFLKNHGDVIHGTDDEELKVALDLWFEAHKEKTDNFDDLVKYCSGVISLLTTV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.5
3	0.57
4	0.62
5	0.66
6	0.72
7	0.74
8	0.79
9	0.85
10	0.87
11	0.83
12	0.77
13	0.73
14	0.72
15	0.69
16	0.64
17	0.62
18	0.6
19	0.57
20	0.59
21	0.53
22	0.44
23	0.43
24	0.41
25	0.35
26	0.29
27	0.27
28	0.21
29	0.19
30	0.17
31	0.13
32	0.12
33	0.09
34	0.07
35	0.07
36	0.09
37	0.09
38	0.09
39	0.08
40	0.07
41	0.08
42	0.08
43	0.07
44	0.09
45	0.1
46	0.12
47	0.13
48	0.14
49	0.15
50	0.17
51	0.23
52	0.21
53	0.22
54	0.24
55	0.24
56	0.24
57	0.22
58	0.21
59	0.13
60	0.13
61	0.11
62	0.09
63	0.09
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.09
68	0.1
69	0.1
70	0.09
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.07
75	0.07
76	0.07
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.07
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.08
89	0.08
90	0.08
91	0.12
92	0.12
93	0.12
94	0.18
95	0.19
96	0.23
97	0.29
98	0.34
99	0.36
100	0.41
101	0.42
102	0.36
103	0.36
104	0.38
105	0.32
106	0.26
107	0.21
108	0.16
109	0.13
110	0.14
111	0.13
112	0.08
113	0.08
114	0.07
115	0.1
116	0.1
117	0.1
118	0.11
119	0.12
120	0.11
121	0.14
122	0.14
123	0.12
124	0.12
125	0.16
126	0.17
127	0.22
128	0.25
129	0.23
130	0.3
131	0.31
132	0.34
133	0.34
134	0.33
135	0.29
136	0.28
137	0.31
138	0.25
139	0.25
140	0.22
141	0.21
142	0.22
143	0.2
144	0.17
145	0.14
146	0.15
147	0.13
148	0.13
149	0.12
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.07
155	0.07
156	0.06
157	0.06
158	0.08
159	0.12
160	0.14
161	0.14
162	0.16
163	0.17
164	0.17
165	0.16
166	0.15
167	0.12
168	0.1
169	0.1
170	0.08
171	0.08
172	0.07
173	0.08
174	0.08
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.13
179	0.13
180	0.13
181	0.15
182	0.14
183	0.1
184	0.12
185	0.13
186	0.15
187	0.16
188	0.15
189	0.14
190	0.14
191	0.14
192	0.13
193	0.12
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.06
200	0.06
201	0.05
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.04
214	0.1
215	0.11
216	0.13
217	0.17
218	0.17
219	0.21
220	0.23
221	0.3
222	0.33
223	0.38
224	0.43
225	0.49
226	0.53
227	0.53
228	0.57
229	0.5
230	0.42
231	0.39
232	0.33
233	0.26
234	0.25
235	0.23
236	0.2
237	0.2
238	0.19
239	0.2
240	0.2
241	0.2
242	0.2
243	0.2
244	0.17
245	0.17
246	0.17
247	0.15
248	0.15
249	0.14
250	0.1
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.1
259	0.1
260	0.11
261	0.11
262	0.13
263	0.12
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.19
268	0.24
269	0.29
270	0.31
271	0.32
272	0.3
273	0.3
274	0.3
275	0.27
276	0.24
277	0.18
278	0.18
279	0.17
280	0.24
281	0.23
282	0.23
283	0.2
284	0.18
285	0.24
286	0.22
287	0.21
288	0.14
289	0.14
290	0.15
291	0.14
292	0.14
293	0.07
294	0.08
295	0.1
296	0.11
297	0.11
298	0.1
299	0.12
300	0.11
301	0.12
302	0.12
303	0.13
304	0.15
305	0.15
306	0.15
307	0.15
308	0.16
309	0.16
310	0.15
311	0.12
312	0.09
313	0.1
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.08
318	0.09
319	0.12
320	0.13
321	0.15
322	0.19
323	0.22
324	0.27
325	0.3
326	0.31
327	0.33
328	0.31
329	0.3
330	0.26
331	0.25
332	0.2
333	0.16
334	0.14
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.1
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.1
348	0.1
349	0.11
350	0.11
351	0.13
352	0.16
353	0.21
354	0.22
355	0.26
356	0.31
357	0.33
358	0.44
359	0.43
360	0.45
361	0.45
362	0.45
363	0.44
364	0.4
365	0.4
366	0.34
367	0.38
368	0.34
369	0.34
370	0.4
371	0.37
372	0.37
373	0.39
374	0.43
375	0.44
376	0.54
377	0.56
378	0.5
379	0.52
380	0.56
381	0.55
382	0.55
383	0.5
384	0.41
385	0.37
386	0.35
387	0.3
388	0.24
389	0.22
390	0.13
391	0.12
392	0.09
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.05
398	0.05
399	0.04
400	0.04
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.1
420	0.17
421	0.21
422	0.24
423	0.29
424	0.34
425	0.39
426	0.47
427	0.52
428	0.5
429	0.51
430	0.48
431	0.46
432	0.41
433	0.38
434	0.29
435	0.23
436	0.17
437	0.13
438	0.1
439	0.08
440	0.07
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.04
461	0.04
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.09
468	0.13
469	0.17
470	0.21
471	0.23
472	0.25
473	0.32
474	0.42
475	0.5
476	0.56
477	0.57
478	0.55
479	0.55
480	0.58
481	0.52
482	0.43
483	0.33
484	0.23
485	0.19
486	0.16
487	0.15
488	0.11
489	0.1
490	0.1
491	0.09
492	0.09
493	0.07
494	0.08
495	0.09
496	0.08
497	0.09
498	0.08
499	0.09
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.06
504	0.05
505	0.05
506	0.07
507	0.06
508	0.08
509	0.08
510	0.09
511	0.1
512	0.11
513	0.12
514	0.11
515	0.11
516	0.12
517	0.11
518	0.14
519	0.14
520	0.12
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.1
525	0.1
526	0.09
527	0.1
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.11
532	0.11
533	0.11
534	0.08
535	0.06
536	0.07
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.03
544	0.02
545	0.02
546	0.02
547	0.02
548	0.03
549	0.04
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.07
554	0.07
555	0.09
556	0.11
557	0.13
558	0.19
559	0.26
560	0.28
561	0.28
562	0.3
563	0.29
564	0.28
565	0.25
566	0.19
567	0.13
568	0.13
569	0.12
570	0.11
571	0.11
572	0.11
573	0.11
574	0.1
575	0.1
576	0.08
577	0.08
578	0.08
579	0.07
580	0.06
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.08
586	0.08
587	0.07
588	0.08
589	0.08
590	0.09
591	0.09
592	0.09
593	0.12
594	0.12
595	0.12
596	0.11
597	0.11
598	0.11
599	0.11
600	0.12
601	0.09
602	0.09
603	0.1
604	0.12
605	0.15
606	0.14
607	0.18
608	0.17
609	0.18
610	0.18
611	0.17
612	0.18
613	0.15
614	0.16
615	0.12
616	0.11
617	0.11
618	0.14
619	0.14
620	0.11
621	0.1
622	0.1
623	0.1
624	0.1
625	0.1
626	0.07
627	0.08
628	0.09
629	0.1
630	0.11
631	0.15
632	0.17
633	0.18
634	0.19
635	0.2
636	0.2
637	0.24
638	0.31
639	0.31
640	0.37
641	0.38
642	0.4
643	0.4
644	0.43
645	0.38
646	0.3
647	0.27
648	0.25
649	0.22
650	0.19
651	0.16
652	0.12
653	0.12
654	0.11
655	0.09
656	0.05
657	0.05
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.04
666	0.04
667	0.05
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.04
672	0.05
673	0.06
674	0.07
675	0.06
676	0.09
677	0.1
678	0.1
679	0.1
680	0.09
681	0.08
682	0.09
683	0.15
684	0.16
685	0.15
686	0.15
687	0.15
688	0.15
689	0.15
690	0.14
691	0.08
692	0.05
693	0.06
694	0.07
695	0.12
696	0.16
697	0.16
698	0.19
699	0.24
700	0.25
701	0.26
702	0.27
703	0.31
704	0.32
705	0.36
706	0.38
707	0.34
708	0.34
709	0.4
710	0.45
711	0.4
712	0.43
713	0.48
714	0.52
715	0.58
716	0.67
717	0.7
718	0.75
719	0.81
720	0.85
721	0.86
722	0.88
723	0.89
724	0.89
725	0.86
726	0.81
727	0.73
728	0.69
729	0.63
730	0.53
731	0.47
732	0.38
733	0.33
734	0.28
735	0.24
736	0.16
737	0.13
738	0.12
739	0.1
740	0.09
741	0.07
742	0.07
743	0.1
744	0.1
745	0.11
746	0.11
747	0.1
748	0.15
749	0.19
750	0.19
751	0.23
752	0.25
753	0.25
754	0.33
755	0.34
756	0.3
757	0.26
758	0.27
759	0.26
760	0.27
761	0.27
762	0.2
763	0.22
764	0.22
765	0.22
766	0.25
767	0.22
768	0.25
769	0.32
770	0.34
771	0.35
772	0.35
773	0.37
774	0.33
775	0.34
776	0.32
777	0.25
778	0.23
779	0.2
780	0.25
781	0.22
782	0.22
783	0.25
784	0.23
785	0.24
786	0.29
787	0.33
788	0.31
789	0.32
790	0.34
791	0.31
792	0.32
793	0.34
794	0.28
795	0.25
796	0.22
797	0.21
798	0.18
799	0.15
800	0.15
801	0.12
802	0.13
803	0.13
804	0.13
805	0.14
806	0.13
807	0.14
808	0.11
809	0.14
810	0.13
811	0.12
812	0.11
813	0.11
814	0.11
815	0.1
816	0.1
817	0.09
818	0.15
819	0.16
820	0.17
821	0.17
822	0.17
823	0.17
824	0.17
825	0.14
826	0.11
827	0.1
828	0.11
829	0.16
830	0.17
831	0.18
832	0.18
833	0.19
834	0.2
835	0.21
836	0.2
837	0.16
838	0.16
839	0.16
840	0.17
841	0.17
842	0.14
843	0.11
844	0.11
845	0.1
846	0.11
847	0.1
848	0.1
849	0.11
850	0.15
851	0.15
852	0.17
853	0.16
854	0.17
855	0.17
856	0.21
857	0.23
858	0.19
859	0.19
860	0.2
861	0.2
862	0.19
863	0.18
864	0.13
865	0.1
866	0.1
867	0.1
868	0.09
869	0.08
870	0.08
871	0.09
872	0.12
873	0.12
874	0.15
875	0.17
876	0.19
877	0.23
878	0.25
879	0.3
880	0.33
881	0.34
882	0.33
883	0.37
884	0.36
885	0.33
886	0.35
887	0.27
888	0.23
889	0.21
890	0.19
891	0.14
892	0.12
893	0.11

A0A1V2L605

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer