Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V2LC23

Protein Details
Accession A0A1V2LC23    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-71ITLAPKKKTASPKKAPAKKPAPKPKKIKRTVSAYCFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-64PKKKTASPKKAPAKKPAPKPKKIKR
Subcellular Location(s) mito 20.5, mito_nucl 12.666, cyto_mito 12.333, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MLSMLRSRLAARVVAPSFAAATAVAPLTSQFSTLSITLAPKKKTASPKKAPAKKPAPKPKKIKRTVSAYCFFVKDAFVNDREELMAVPFKERAALLRQKWNSLSQSELDKYNELHEKDAERNAAEVAEKIKNGPPKRPLTGYFTWLMEERPTLIAHNPGASSKELIKLGAEGWKNLPEYEKQTYNHEAAKNLAKWSAQYAKWKVQQEAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.21
4 0.19
5 0.17
6 0.16
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.06
13 0.06
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.1
23 0.14
24 0.21
25 0.27
26 0.28
27 0.28
28 0.31
29 0.37
30 0.47
31 0.55
32 0.58
33 0.61
34 0.7
35 0.78
36 0.85
37 0.84
38 0.84
39 0.84
40 0.82
41 0.83
42 0.84
43 0.83
44 0.83
45 0.88
46 0.88
47 0.88
48 0.89
49 0.87
50 0.83
51 0.83
52 0.82
53 0.78
54 0.71
55 0.63
56 0.55
57 0.46
58 0.39
59 0.3
60 0.23
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.15
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.14
81 0.21
82 0.22
83 0.31
84 0.32
85 0.33
86 0.34
87 0.36
88 0.31
89 0.25
90 0.24
91 0.17
92 0.2
93 0.19
94 0.19
95 0.17
96 0.16
97 0.15
98 0.17
99 0.21
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.19
104 0.21
105 0.23
106 0.2
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.1
116 0.11
117 0.15
118 0.22
119 0.24
120 0.29
121 0.34
122 0.39
123 0.42
124 0.45
125 0.44
126 0.45
127 0.45
128 0.42
129 0.36
130 0.3
131 0.28
132 0.24
133 0.22
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.16
147 0.15
148 0.16
149 0.14
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.19
157 0.19
158 0.16
159 0.18
160 0.22
161 0.22
162 0.22
163 0.24
164 0.21
165 0.27
166 0.31
167 0.35
168 0.33
169 0.38
170 0.43
171 0.43
172 0.46
173 0.42
174 0.37
175 0.35
176 0.42
177 0.39
178 0.36
179 0.35
180 0.29
181 0.28
182 0.34
183 0.37
184 0.33
185 0.4
186 0.45
187 0.52
188 0.58
189 0.63