FuNGI

A0A1V2LCR3

Protein Details

Accession

A0A1V2LCR3

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
693-721	KRDAPHSTTNREKARKKNFLMTIHKRDVR	Hydrophilic
727-747	SLRDKQKVLKAHITKQKKKGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
264-287	VGKKTGKAKKKLDNAMKQMKKKSS
686-747	KFGSRRGKRDAPHSTTNREKARKKNFLMTIHKRDVRGKAKMSLRDKQKVLKAHITKQKKKGF

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto_mito 6.833, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MVKKRGAAILPNNIILLQNLVKRDPESYREEFLQQYAHYESLRDLFMANPSGQDGDQFAELIGFVTAVCSCFPKETANFPNELKSLITNNHRELTPELREKIIQCLVMMRNKDVITAESLIQTIFPLLSAYSGAANLNSQHSKALRHQVYSTLITLLKSLNTGAKNQKLNRSTQALLFNLLEQKDAQGLWATKLTRELWRRGIWDDSRTVEIMTQATLHPDTKVAYSGVKFFLGADKERDENFEDDDSDEEGFDLGSLKHKMTVGKKTGKAKKKLDNAMKQMKKKSSAKHSATYLNFSAIHLLRDPQGFAEQIFDFHLNGKNSNKFNLEQKIALMNLVSRLIGTHKLTILGIYTFFLKYLTPKQRDVTQIMAAAAQASHDLVPPESISIVVRKIADEFVSDGVAPEVAAAGINTIREILARNPLAIEETLLHDLTEYKGSKSKPVNIAAKSLISLYREVAPEMLKRKDRGKTATMEISAGEKKGLPQFGVQNDTQGIPGIELLIQWRKEQGLEGNDDENDAAAWEVDDKEIDSSDIEGDWVTVESDKEYDISDDEDEKMEDSKADEKDAEDNESDSDLDLSDDDDADEKEEKQNEEDKDQVINKLTSLDPDSAFRELASTRILTPADFQKIQELRTQAGLEKIMGTKNLRNEDGVESSSLVGPVKYKQLREERIAHAQEGREDRDKFGSRRGKRDAPHSTTNREKARKKNFLMTIHKRDVRGKAKMSLRDKQKVLKAHITKQKKKGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.27
3	0.23
4	0.18
5	0.19
6	0.2
7	0.22
8	0.24
9	0.24
10	0.29
11	0.3
12	0.31
13	0.35
14	0.37
15	0.41
16	0.41
17	0.43
18	0.4
19	0.37
20	0.36
21	0.28
22	0.27
23	0.25
24	0.25
25	0.22
26	0.21
27	0.21
28	0.2
29	0.2
30	0.16
31	0.14
32	0.13
33	0.17
34	0.2
35	0.18
36	0.16
37	0.16
38	0.18
39	0.17
40	0.16
41	0.14
42	0.12
43	0.12
44	0.12
45	0.11
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.07
50	0.05
51	0.04
52	0.05
53	0.06
54	0.07
55	0.07
56	0.09
57	0.1
58	0.12
59	0.14
60	0.19
61	0.21
62	0.29
63	0.36
64	0.37
65	0.4
66	0.39
67	0.43
68	0.37
69	0.36
70	0.28
71	0.24
72	0.24
73	0.28
74	0.35
75	0.35
76	0.38
77	0.41
78	0.4
79	0.4
80	0.4
81	0.4
82	0.41
83	0.42
84	0.4
85	0.38
86	0.41
87	0.4
88	0.43
89	0.39
90	0.31
91	0.24
92	0.29
93	0.31
94	0.34
95	0.35
96	0.3
97	0.32
98	0.31
99	0.32
100	0.27
101	0.23
102	0.21
103	0.21
104	0.2
105	0.16
106	0.16
107	0.15
108	0.13
109	0.12
110	0.09
111	0.06
112	0.06
113	0.05
114	0.05
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.08
123	0.09
124	0.14
125	0.15
126	0.15
127	0.18
128	0.19
129	0.23
130	0.29
131	0.38
132	0.36
133	0.37
134	0.38
135	0.39
136	0.42
137	0.4
138	0.35
139	0.27
140	0.24
141	0.22
142	0.21
143	0.17
144	0.13
145	0.12
146	0.12
147	0.14
148	0.15
149	0.2
150	0.27
151	0.33
152	0.41
153	0.45
154	0.53
155	0.5
156	0.54
157	0.54
158	0.52
159	0.47
160	0.44
161	0.45
162	0.37
163	0.36
164	0.32
165	0.28
166	0.26
167	0.25
168	0.2
169	0.15
170	0.15
171	0.13
172	0.13
173	0.11
174	0.12
175	0.13
176	0.14
177	0.18
178	0.18
179	0.17
180	0.21
181	0.23
182	0.26
183	0.31
184	0.34
185	0.36
186	0.4
187	0.41
188	0.4
189	0.45
190	0.4
191	0.39
192	0.37
193	0.32
194	0.31
195	0.29
196	0.26
197	0.19
198	0.18
199	0.14
200	0.12
201	0.1
202	0.09
203	0.11
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.12
209	0.11
210	0.13
211	0.11
212	0.12
213	0.13
214	0.15
215	0.15
216	0.15
217	0.14
218	0.12
219	0.16
220	0.16
221	0.17
222	0.18
223	0.18
224	0.2
225	0.21
226	0.23
227	0.21
228	0.2
229	0.2
230	0.18
231	0.16
232	0.15
233	0.16
234	0.14
235	0.12
236	0.1
237	0.08
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.12
247	0.14
248	0.19
249	0.24
250	0.32
251	0.36
252	0.43
253	0.49
254	0.57
255	0.64
256	0.68
257	0.72
258	0.71
259	0.72
260	0.74
261	0.78
262	0.77
263	0.77
264	0.77
265	0.78
266	0.77
267	0.74
268	0.72
269	0.67
270	0.65
271	0.63
272	0.62
273	0.62
274	0.65
275	0.64
276	0.62
277	0.61
278	0.6
279	0.55
280	0.51
281	0.41
282	0.33
283	0.28
284	0.23
285	0.24
286	0.17
287	0.17
288	0.13
289	0.13
290	0.13
291	0.13
292	0.14
293	0.1
294	0.11
295	0.1
296	0.09
297	0.12
298	0.09
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.1
303	0.12
304	0.16
305	0.14
306	0.17
307	0.2
308	0.25
309	0.25
310	0.28
311	0.28
312	0.25
313	0.3
314	0.32
315	0.3
316	0.25
317	0.25
318	0.24
319	0.21
320	0.2
321	0.14
322	0.09
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.05
327	0.05
328	0.07
329	0.1
330	0.1
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.1
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.08
346	0.17
347	0.26
348	0.28
349	0.3
350	0.32
351	0.37
352	0.4
353	0.4
354	0.34
355	0.26
356	0.24
357	0.22
358	0.2
359	0.15
360	0.12
361	0.09
362	0.06
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.04
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.02
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.04
404	0.05
405	0.06
406	0.12
407	0.12
408	0.13
409	0.13
410	0.13
411	0.14
412	0.12
413	0.12
414	0.06
415	0.08
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.13
423	0.12
424	0.12
425	0.16
426	0.17
427	0.24
428	0.27
429	0.33
430	0.34
431	0.41
432	0.46
433	0.43
434	0.46
435	0.4
436	0.36
437	0.3
438	0.24
439	0.19
440	0.13
441	0.13
442	0.11
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.16
449	0.2
450	0.25
451	0.25
452	0.27
453	0.33
454	0.38
455	0.42
456	0.43
457	0.43
458	0.42
459	0.43
460	0.45
461	0.39
462	0.34
463	0.28
464	0.26
465	0.23
466	0.19
467	0.14
468	0.1
469	0.12
470	0.15
471	0.16
472	0.13
473	0.15
474	0.2
475	0.22
476	0.26
477	0.24
478	0.22
479	0.21
480	0.21
481	0.18
482	0.14
483	0.11
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.08
490	0.12
491	0.13
492	0.13
493	0.14
494	0.14
495	0.14
496	0.16
497	0.18
498	0.17
499	0.2
500	0.22
501	0.22
502	0.21
503	0.21
504	0.19
505	0.14
506	0.1
507	0.07
508	0.05
509	0.03
510	0.04
511	0.04
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.07
519	0.06
520	0.06
521	0.07
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.09
539	0.1
540	0.11
541	0.12
542	0.12
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.11
547	0.1
548	0.11
549	0.16
550	0.16
551	0.17
552	0.17
553	0.17
554	0.22
555	0.23
556	0.24
557	0.19
558	0.18
559	0.17
560	0.18
561	0.17
562	0.11
563	0.1
564	0.07
565	0.07
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.07
572	0.07
573	0.09
574	0.1
575	0.11
576	0.16
577	0.19
578	0.2
579	0.22
580	0.29
581	0.3
582	0.32
583	0.34
584	0.3
585	0.33
586	0.33
587	0.33
588	0.3
589	0.28
590	0.24
591	0.24
592	0.23
593	0.2
594	0.21
595	0.2
596	0.17
597	0.19
598	0.22
599	0.2
600	0.2
601	0.17
602	0.16
603	0.14
604	0.15
605	0.14
606	0.13
607	0.12
608	0.16
609	0.16
610	0.14
611	0.18
612	0.23
613	0.27
614	0.27
615	0.27
616	0.32
617	0.34
618	0.35
619	0.36
620	0.32
621	0.27
622	0.3
623	0.31
624	0.23
625	0.25
626	0.24
627	0.2
628	0.2
629	0.2
630	0.19
631	0.21
632	0.23
633	0.24
634	0.3
635	0.35
636	0.34
637	0.33
638	0.34
639	0.35
640	0.34
641	0.31
642	0.25
643	0.2
644	0.2
645	0.2
646	0.18
647	0.14
648	0.11
649	0.11
650	0.13
651	0.22
652	0.26
653	0.27
654	0.35
655	0.45
656	0.51
657	0.56
658	0.6
659	0.57
660	0.62
661	0.63
662	0.56
663	0.5
664	0.45
665	0.45
666	0.43
667	0.42
668	0.4
669	0.39
670	0.4
671	0.45
672	0.5
673	0.46
674	0.51
675	0.56
676	0.55
677	0.63
678	0.69
679	0.68
680	0.66
681	0.74
682	0.75
683	0.72
684	0.75
685	0.72
686	0.72
687	0.73
688	0.78
689	0.77
690	0.76
691	0.77
692	0.77
693	0.82
694	0.84
695	0.81
696	0.82
697	0.8
698	0.8
699	0.83
700	0.83
701	0.81
702	0.81
703	0.79
704	0.73
705	0.72
706	0.72
707	0.7
708	0.68
709	0.63
710	0.62
711	0.66
712	0.72
713	0.72
714	0.71
715	0.72
716	0.72
717	0.72
718	0.72
719	0.71
720	0.7
721	0.7
722	0.72
723	0.7
724	0.71
725	0.76
726	0.79
727	0.81

A0A1V2LCR3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer