FuNGI

A0A1V2LBU9

Protein Details

Accession

A0A1V2LBU9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
718-740	GSQRLGSQGASQKRKKRKVKGFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
729-739	QKRKKRKVKGF

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 6, mito 5, E.R. 2, plas 1, pero 1, golg 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003743 F:translation initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MFPQRKGLGVQLAHGLPGPAIPLLQYDTDEPWVFARQRDGGIPLRPVQDSLIQIVPPQFDDDVIVTKLKRRDDPKIVGITREFIDEMQKNEYIIEKHPLIFDPSEGSLLDFHTCIQKRNKIVPVIAFVTNEYKNNLVVQELMEVTEKVTRTGSTETTDAKVKTYTLGTGVSLLFPHSIKQVHISKLLIGSSTHNKNSLAVLTSHSMTLVTFFNFNKYTIETGAEITCDEFGEQIVHVACNPYDISQFAIAGAKGRWAILKNTGKRLKVIHTGHVHNANELSTFKRISWTNDSDKIVFMGRTFLKKIDFETGKSTDIISATHWSQIRDYQMWLSDPKFAFLLTSKELIWCDTSDGIKRVLAWKHNMPSNDPSLKLSFHDSEDDTKIVMLSCLTTPIVLVYEFKLDDDGLPKSVRDPFMLETGTEGKTHDIVLIPSSTSDEEEDDNDDASDKCFTTFQLSQRLELTKCTLSNFEASLPKKELQQPVITNDMSSPDVSQSKTASAICEALFHGPMPHKERMVDDSLILQEYASKFHFDKSEDFQPTSLFNAAPPAENVYSLEEFDSMIEQLLEYCRGNGFDTVSMRSLSKILFKEEIESMSELYDKITKIWTDDRVAIREVVRDLCLSLSVVFDAQVEKNALIEEMDMMPTKTRKLVRDWDENYDESDDEFGLSGRSASESEAPMVEEPVIRLTQTQNSQPASQQSQIMRPSQRFGSQKMGSQRLGSQGASQKRKKRKVKGFA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.23
3	0.14
4	0.14
5	0.13
6	0.07
7	0.07
8	0.07
9	0.08
10	0.1
11	0.11
12	0.12
13	0.13
14	0.16
15	0.21
16	0.21
17	0.2
18	0.2
19	0.26
20	0.26
21	0.26
22	0.29
23	0.27
24	0.29
25	0.3
26	0.33
27	0.33
28	0.36
29	0.38
30	0.37
31	0.38
32	0.36
33	0.35
34	0.32
35	0.31
36	0.28
37	0.28
38	0.26
39	0.22
40	0.24
41	0.26
42	0.24
43	0.2
44	0.21
45	0.17
46	0.14
47	0.16
48	0.15
49	0.16
50	0.17
51	0.19
52	0.17
53	0.23
54	0.28
55	0.32
56	0.38
57	0.41
58	0.5
59	0.56
60	0.63
61	0.65
62	0.7
63	0.66
64	0.62
65	0.57
66	0.5
67	0.41
68	0.36
69	0.28
70	0.19
71	0.26
72	0.24
73	0.25
74	0.26
75	0.26
76	0.24
77	0.25
78	0.28
79	0.22
80	0.23
81	0.26
82	0.24
83	0.25
84	0.26
85	0.27
86	0.27
87	0.25
88	0.23
89	0.2
90	0.19
91	0.19
92	0.17
93	0.16
94	0.13
95	0.13
96	0.14
97	0.1
98	0.1
99	0.18
100	0.19
101	0.25
102	0.33
103	0.39
104	0.44
105	0.52
106	0.58
107	0.54
108	0.57
109	0.53
110	0.5
111	0.47
112	0.42
113	0.34
114	0.29
115	0.29
116	0.27
117	0.25
118	0.22
119	0.19
120	0.18
121	0.19
122	0.18
123	0.13
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.11
128	0.12
129	0.11
130	0.11
131	0.11
132	0.14
133	0.13
134	0.12
135	0.13
136	0.12
137	0.14
138	0.18
139	0.19
140	0.18
141	0.2
142	0.21
143	0.23
144	0.27
145	0.25
146	0.23
147	0.22
148	0.19
149	0.19
150	0.18
151	0.17
152	0.14
153	0.14
154	0.13
155	0.14
156	0.14
157	0.12
158	0.11
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.13
165	0.13
166	0.2
167	0.25
168	0.26
169	0.3
170	0.29
171	0.27
172	0.28
173	0.28
174	0.22
175	0.16
176	0.18
177	0.23
178	0.27
179	0.27
180	0.27
181	0.27
182	0.27
183	0.27
184	0.25
185	0.19
186	0.14
187	0.16
188	0.16
189	0.16
190	0.15
191	0.14
192	0.12
193	0.1
194	0.11
195	0.09
196	0.08
197	0.1
198	0.11
199	0.15
200	0.16
201	0.17
202	0.16
203	0.17
204	0.18
205	0.16
206	0.17
207	0.14
208	0.15
209	0.14
210	0.13
211	0.11
212	0.1
213	0.09
214	0.07
215	0.07
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.05
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.09
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.09
235	0.1
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.11
243	0.11
244	0.13
245	0.21
246	0.3
247	0.32
248	0.42
249	0.47
250	0.46
251	0.47
252	0.48
253	0.43
254	0.44
255	0.43
256	0.4
257	0.41
258	0.42
259	0.44
260	0.47
261	0.42
262	0.33
263	0.31
264	0.24
265	0.19
266	0.17
267	0.16
268	0.11
269	0.12
270	0.11
271	0.15
272	0.17
273	0.21
274	0.28
275	0.31
276	0.35
277	0.4
278	0.42
279	0.38
280	0.37
281	0.32
282	0.26
283	0.2
284	0.15
285	0.14
286	0.14
287	0.16
288	0.17
289	0.17
290	0.18
291	0.18
292	0.2
293	0.23
294	0.23
295	0.22
296	0.26
297	0.27
298	0.26
299	0.26
300	0.24
301	0.16
302	0.15
303	0.14
304	0.1
305	0.11
306	0.1
307	0.14
308	0.15
309	0.14
310	0.15
311	0.17
312	0.19
313	0.17
314	0.18
315	0.15
316	0.15
317	0.16
318	0.17
319	0.15
320	0.18
321	0.17
322	0.17
323	0.15
324	0.14
325	0.13
326	0.13
327	0.15
328	0.11
329	0.12
330	0.11
331	0.12
332	0.13
333	0.13
334	0.13
335	0.1
336	0.09
337	0.1
338	0.11
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.16
345	0.18
346	0.2
347	0.22
348	0.25
349	0.28
350	0.3
351	0.3
352	0.28
353	0.28
354	0.31
355	0.29
356	0.25
357	0.23
358	0.21
359	0.21
360	0.19
361	0.2
362	0.15
363	0.14
364	0.16
365	0.15
366	0.17
367	0.18
368	0.17
369	0.13
370	0.12
371	0.11
372	0.09
373	0.08
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.05
384	0.06
385	0.05
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.09
393	0.09
394	0.09
395	0.1
396	0.1
397	0.11
398	0.15
399	0.15
400	0.13
401	0.15
402	0.14
403	0.17
404	0.17
405	0.16
406	0.14
407	0.15
408	0.15
409	0.13
410	0.12
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.09
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.08
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.09
432	0.09
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.13
441	0.17
442	0.2
443	0.29
444	0.29
445	0.3
446	0.32
447	0.35
448	0.29
449	0.27
450	0.28
451	0.2
452	0.2
453	0.2
454	0.19
455	0.17
456	0.18
457	0.17
458	0.16
459	0.21
460	0.21
461	0.24
462	0.26
463	0.26
464	0.28
465	0.34
466	0.36
467	0.33
468	0.37
469	0.35
470	0.35
471	0.38
472	0.34
473	0.28
474	0.23
475	0.22
476	0.17
477	0.15
478	0.12
479	0.11
480	0.13
481	0.13
482	0.15
483	0.13
484	0.13
485	0.15
486	0.15
487	0.14
488	0.12
489	0.14
490	0.12
491	0.13
492	0.12
493	0.11
494	0.11
495	0.1
496	0.12
497	0.13
498	0.18
499	0.23
500	0.25
501	0.24
502	0.25
503	0.27
504	0.29
505	0.3
506	0.26
507	0.2
508	0.2
509	0.2
510	0.19
511	0.17
512	0.12
513	0.11
514	0.11
515	0.13
516	0.12
517	0.13
518	0.13
519	0.16
520	0.2
521	0.19
522	0.23
523	0.27
524	0.35
525	0.36
526	0.36
527	0.34
528	0.32
529	0.3
530	0.28
531	0.24
532	0.15
533	0.11
534	0.16
535	0.16
536	0.15
537	0.15
538	0.17
539	0.16
540	0.16
541	0.17
542	0.16
543	0.16
544	0.15
545	0.15
546	0.11
547	0.11
548	0.11
549	0.11
550	0.07
551	0.07
552	0.06
553	0.05
554	0.06
555	0.07
556	0.1
557	0.09
558	0.09
559	0.1
560	0.11
561	0.13
562	0.13
563	0.13
564	0.15
565	0.17
566	0.19
567	0.19
568	0.19
569	0.18
570	0.18
571	0.17
572	0.15
573	0.19
574	0.19
575	0.21
576	0.24
577	0.24
578	0.26
579	0.26
580	0.27
581	0.22
582	0.21
583	0.18
584	0.15
585	0.15
586	0.12
587	0.12
588	0.14
589	0.12
590	0.12
591	0.16
592	0.15
593	0.19
594	0.24
595	0.27
596	0.27
597	0.33
598	0.36
599	0.35
600	0.37
601	0.35
602	0.31
603	0.3
604	0.28
605	0.24
606	0.21
607	0.18
608	0.17
609	0.15
610	0.14
611	0.12
612	0.1
613	0.09
614	0.09
615	0.08
616	0.08
617	0.08
618	0.1
619	0.1
620	0.12
621	0.13
622	0.12
623	0.13
624	0.13
625	0.12
626	0.1
627	0.1
628	0.09
629	0.08
630	0.1
631	0.1
632	0.1
633	0.14
634	0.15
635	0.16
636	0.21
637	0.26
638	0.28
639	0.35
640	0.45
641	0.49
642	0.58
643	0.6
644	0.62
645	0.61
646	0.58
647	0.53
648	0.45
649	0.38
650	0.27
651	0.24
652	0.16
653	0.12
654	0.12
655	0.09
656	0.08
657	0.08
658	0.07
659	0.07
660	0.08
661	0.08
662	0.1
663	0.14
664	0.14
665	0.16
666	0.16
667	0.17
668	0.16
669	0.17
670	0.16
671	0.13
672	0.12
673	0.14
674	0.14
675	0.12
676	0.14
677	0.16
678	0.23
679	0.27
680	0.32
681	0.35
682	0.38
683	0.4
684	0.42
685	0.46
686	0.44
687	0.42
688	0.42
689	0.39
690	0.43
691	0.45
692	0.49
693	0.49
694	0.46
695	0.48
696	0.46
697	0.51
698	0.48
699	0.48
700	0.51
701	0.47
702	0.51
703	0.56
704	0.58
705	0.51
706	0.5
707	0.48
708	0.45
709	0.45
710	0.39
711	0.37
712	0.38
713	0.47
714	0.54
715	0.59
716	0.62
717	0.7
718	0.8
719	0.84
720	0.87

A0A1V2LBU9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer